科研产出
抗感黄曲霉花生种质遗传多样性评价与指纹图谱构建
《山东农业科学 》 2016
摘要：为明确抗感黄曲霉花生种质的遗传多样性和亲缘关系,发掘优良抗性种质,本研究利用46对多态性SSR引物分析48份抗感黄曲霉或相关花生种质的遗传多样性,平均每对引物可扩增出5.15个等位变异,平均PIC值为0.604;聚类分析将48份种质分为8组,其中抗性种质被分成5组;低产毒种质91048、抗侵染种质AR-3、PI337409F和GFA-2以及抗圆柱状黑腐病种质PERRY与其它种质存在较大的遗传差异,可作为理想的育种材料;抽取5个标记共35个多态位点建立了48份抗感黄曲霉或相关花生种质的"引物+0,1字符串"计算机化的DNA指纹图谱。筛选出的优异种质可在抗黄曲霉品种培育中作亲本利用,以拓宽其遗传基础。
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山东省46个花生品种SSR指纹图谱构建与遗传多样性分析
《核农学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：为从分子水平上快速鉴别花生品种和选配优良杂交组合,以山东省审定的46个花生品种为材料,利用微卫星(SSR)标记进行DNA指纹图谱的构建和遗传多样性分析。从788对SSR引物中筛选出50对多态性高、稳定性好、谱带清晰的引物,共检测到175个等位位点,其中122个为多态性位点,多态性比率达70.52%;每对SSR引物扩增出的等位位点数为2~7个,多态性信息量变化范围为0.6753~0.8412,平均为0.823。此外,利用14对引物可将46份材料完全区分开。聚类分析表明,在相似系数0.77处,所有供试材料聚为一类,在相似系数0.80处,仍有76%的材料聚在一起。利用SSR标记构建的指纹图谱可为花生种质资源管理及育种实践提供依据。
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鲁西黑头羊mtDNAD-loop区遗传多样性与遗传分化研究
《山东农业科学 》 2016 CSCD
摘要：鲁西黑头羊是一个优良的绵羊培育品种,具备高产肉力和高繁殖力特征。为了评估这个品种线粒体DNA的遗传多样性,同时获得该新品种界定的分子证据,本研究对鲁西黑头羊、杜泊羊和小尾寒羊mtDNA的高变异区进行了测序,分析了它们的遗传多样性和遗传分化,并计算了鲁西黑头羊与其它两个品种间的遗传距离。结果表明:三个品种的遗传多样性较为丰富,遗传分化程度较高(Fst为0.3240~0.5909);鲁西黑头羊与杜泊羊之间的遗传距离为0.1187,达到了种间的遗传距离,与小尾寒羊之间的遗传距离为0.0654,达到了亚种间的水平。以上结果为鲁西黑头羊的品种界定提供了数据支持。
花生作图亲本间分子标记的多态性分析
《湖北农业科学 》 2015 北大核心
摘要：利用Ah MITE、SSR、SRAP及SRAP-RGA 4种分子标记技术研究了花生(Arachis hypogaea Linn)作图亲本花育22号与"950527"间的分子多态性。经过初筛和复筛,822对Ah MITE引物、1 106对SSR引物、460对SRAP和731对SRAP-RGA引物在两亲本间表现稳定多态性的数量分别为101、207、25和72对,多态性比率分别为12.3%、18.7%,5.4%和9.8%。结果表明,SSR标记揭示作图亲本间多态性的效率最高,其次是Ah MITE标记,SRAP标记的多态性和重复性最差。
关键词： 花生(Arachis hypogaea Linn) 多态性 分子标记 SSR Ah MITE SRAP SRAP-RGA
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如东田菁根瘤菌遗传多样性及高效促生菌株筛选
《微生物学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究江苏如东沿海滩涂田菁根瘤菌的遗传多样性和系统发育,筛选高效促生田菁根瘤菌。【方法】采用16S rRNA基因、持家基因(rec A、atp D、glnⅡ)、共生基因(nod A、nif H)的系统发育分析,并进行温室盆栽接种试验筛选高效菌株。【结果】分离到的32株田菁根瘤菌分布于Ensifer、Neorhizobium、Rhizobium,并与E.meliloti、N.huautlense、E.sesbaniae、R.pusense亲缘关系最近。共生基因nod A、nif H的系统进化分析结果基本一致,均与E.saheli最为相近。7株代表菌株均能耐受5%的Na Cl(W/V)浓度,其中YIC5082耐盐性最强,能够耐受6%的Na Cl。温室盆栽试验表明7株代表菌株均能与田菁有效结瘤固氮,其中6株菌显著提高了植株的株高和鲜重。【结论】江苏如东沿海滩涂田菁根瘤菌具有较丰富的遗传多样性,其中N.huautlense、E.meliloti为优势种。该地区的田菁根瘤菌多数具有较好的共生有效性及耐盐性,YIC5077促生效果最为突出,并表现出较强的固氮及结瘤能力,具有良好的应用前景。
关键词： 如东 田菁根瘤菌 16S rRNA基因 持家基因 遗传多样性 高效菌株筛选
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日本樱花品种观赏性状多样性考察
《中国园艺文摘 》 2015
摘要：日本樱花的原始分布种即野生种通常认为有9种:‘山樱’、‘大山樱’、‘霞樱’、‘江户彼岸’、‘丁子樱’、‘深山樱’、‘大岛樱’、‘豆樱’、‘高岭樱’。无论来自哪个种,凡山野自生的品种称为山樱。种间杂种、野生种的突然变异形成的品种、人工育成品种等统称为里樱。现有品种估计500个左右,观赏性状多样性丰富,双季花品种约有十数个。花瓣数量在60枚以上的菊(瓣)樱品种30余个,其中300枚以上的品种4个。黄色或绿色品种6个。芳香品种总数约30个左右,多数来自‘大岛樱’系统。垂枝型品种20个左右,曲枝型品种2个。自主选育适合地方风土条件的优良品种,形成性状互补的品种群体,是我国樱花产业健康、可持续发展的基础条件。
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基于ISSR标记的16个核桃品种遗传多样性分析及分子身份构建
《核农学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为了分析16个核桃栽培品种的遗传关系和构建分子身份证,以核桃幼叶为材料提取其基因组DNA,利用ISSR分子标记方法,从28条引物中筛选出10条引物对16个核桃栽培品种进行标记分析。结果表明,10条ISSR引物共扩增出115个位点,每条引物可获得9~15条DNA片段,平均为11.5条,其中多样性位点99个,多态性百分比达86.09%,16个核桃品种之间的平均有效等位基因数(Ne)为1.5080,Nei's基因多样性指数(H)为0.3041,Shannon信息指数(I)为0.4577,遗传相似系数(GS)变幅为0.42~0.82。采用UPGMA方法构建的聚类图表明,16个核桃品种可以划分为4个组,品种间遗传信息差异比较大,具有丰富的遗传多样性,能够通过ISSR标记方法将16个品种区分开。此外从10条引物中筛选出3条引物作为16份核桃品种资源种质鉴定的核心引物,构建了每个核桃品种的分子身份证。本研究通过构建16个核桃品种的分子身份,为核桃品种鉴定和品种权保护提供了依据,也为核桃育种亲本的选配和种质资源鉴定奠定了基础。
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韭菜迟眼蕈蚊体内及韭菜根际微生物的多样性分析
《应用昆虫学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：【目的】为了了解韭菜迟眼蕈蚊Bradysia odoriphaga生存环境中微生物的多样性。【方法】本研究对韭蛆、韭菜鳞茎、根部以及土壤中的微生物进行分离纯化,对部分代表性细菌进行了生理生化特征的分析,并对分离得到的真菌及细菌分别采用ITS和16S r DNA基因分析的方法进行鉴定。【结果】总共分离鉴定出25种微生物,在韭菜鳞茎和土壤中分别分离出半知菌亚门(Deuteromycotina)的球孢白僵菌Beauveria bassiana和球孢虫草Cordyceps bassiana两种真菌,在韭蛆体内、韭菜鳞茎、韭菜根部以及土壤中分别分离出10、15、9、6种细菌,以变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)细菌为主,其余的细菌分别属于放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)。【结论】本研究可以为寻找韭菜、韭蛆和微生物三者之间的协同进化关系提供理论基础,并期望为韭蛆的共生防治提供指导。
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基于陆地棉茎尖转录组序列genic-SSR标记的开发与评价
《植物遗传资源学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：利用软件MISA和SSR Locator对陆地棉(Gossypium hirsutum L.)Coker312茎尖转录组测序得到的73515条Unigene序列进行分析,查找到4507个SSR位点,分布于4039条转录本序列中,SSR位点出现频率为5.5%,非编码区的SSR位点要显著高于编码区(2853/1654)。SSR重复基元中,三核苷酸重复基元占主导地位(51.03%),且AAG/CTT(20.08%)类型最多;其次是二核苷酸重复基元(28.76%),主要为AG/CT(55.47%)。利用引物批量设计软件共开发1569对SSR引物,在陆地棉TM-1、海岛棉3-79(G.barbadense L.)、阿非利加棉(G.herbaceum L.)、雷蒙德氏棉(G.raimondii Ulbrich.)4个棉种中进行初步评价,其中1117对引物能在4个棉种间扩增出稳定的条带,扩增率为71.2%。选择650对能稳定扩增出条带的引物,在涉及5个棉种(增加了亚洲棉(G.arboreum L.))的13份材料中进一步筛选,83对引物能在13份材料中扩增出特异性条带,PIC变幅在0.121~0.648之间,平均值为0.422,其中80对引物能在7份陆地棉材料中扩增出特异性条带,平均PIC值为0.336;挑选5对在本实验室作图亲本鲁棉研22和鲁原343间有明显多态的引物进行连锁分析,其中4对成功连锁到本实验室构建的遗传图谱上。本研究丰富了棉属genic-SSR的数量,为棉属遗传作图、性状关联分析提供了更多引物选择。
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24份桑树品种资源基于SRAP分子标记的亲缘关系分析
《蚕业科学 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：应用SRAP分子标记引物对24份桑树品种资源的基因组DNA进行PCR,检测其遗传多样性,分析品种间的亲缘关系。15对SRAP引物扩增产生126条谱带,平均每对引物产生8.4条谱带,其中多态性条带共99条,多态性比率为78.57%,说明24个桑树品种间具有丰富的遗传多样性。基于品种间遗传相似系数的UPGMA聚类图和基于品种的SRAP标记类型的主成分分析中,蒙桑种(Morus mongolica Schneid.)的品种吉蒙桑、白桑种(Morus alba L.)的品种垂枝桑和山桑种(Morus bombycis Koidz.)的品种昌农山桑单独聚类,其他来自白桑种、广东桑种(Morus atropurpurea Roxb.)、鲁桑种(Morus multicaulis Perr.)的栽培品种分为3组;白桑种种内各品种间的遗传变异较小,而广东桑种、鲁桑种种内各品种间的遗传变异相对较大;广东桑3个品种间的遗传背景差异较大;鲁桑栽培品种农桑12号与其父本桐乡青的遗传相似度高,而与母本北区一号的差异显著,并且鲁桑种内各品种间未能完全聚类,品种间的亲缘关系与地理分布位置的距离相关。筛选的15对SRAP引物能够有效地检测供试桑树品种的遗传多样性,揭示品种间的亲缘关系。
关键词： 桑树品种资源 相关序列扩增多态性 遗传多样性 亲缘关系
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