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资源类型: 中文期刊
关键词:指纹图谱(模糊匹配)
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酸处理对干燥香菇甲醛、镉及挥发性风味物质的影响

食品工业科技 2023 北大核心 CSCD

摘要:为降低香菇中甲醛和重金属镉的含量,本试验研究不同酸前处理对去除香菇甲醛和镉含量的影响,并对去除方法进行正交试验优化。结果表明,乳酸作为脱除剂,在pH4.5、料液比1:4 g/mL、振荡温度35℃条件下,香菇的甲醛和镉脱除率最大,分别是88.06%和79.57%。最后利用气相色谱-离子迁移质谱(gas chromatography-ion mobility spectroscopy,GC-IMS)测定乳酸前处理对香菇挥发性风味物质的影响,结果表明,香菇样品中共有28种挥发性物质,包括9种醛类、8种酮类、6种醇类、4种酯类以及1种酸类化合物。经过乳酸预处理干燥后的香菇,2-戊酮、环己酮、γ-丁内酯等含量增加,3-辛酮、丁醛等含量大幅降低。干燥香菇中洋葱味、辛辣味等刺激性味道减少,奶油香、果香增加,气味浓郁,层次丰富。

关键词: 香菇 乳酸 甲醛 挥发性成分 指纹图谱

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利用SRAP标记构建山东省苹果资源指纹图谱

沈阳农业大学学报 2020 北大核心 CSCD

摘要:构建山东省苹果属植物资源指纹图谱,为该地区资源保护、利用及创新奠定基础.以山东省内59份苹果属植物资源为试材,采用改良CTAB法提取基因组DNA,从15条正向引物和16条反向引物随机组合的240对SRAP引物中筛选出25对条带清晰、多态性高的引物组合用于试验.根据电泳胶图,计算多态性引物的总扩增条带数、多态性条带数和多态性条带比率.按照Botstein公式计算多态信息含量;用POPGENE32软件计算观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)、Shannon's信息指数(I),并进行遗传多样性分析.用NTSYS-pc2.10e软件UPGMA方法进行聚类分析,并计算遗传相似性系数.采用引物对组合的方法,构建59份山东苹果资源数字指纹图谱.共检测出176个条带,其中多态性谱带158条,多态性比率达89.77%,平均每对引物组合产生7.04个条带和6.31个多态性条带.样品间平均观察等位基因数、有效等位基因数、Nei's基因多样性指数及Shannon's信息指数分别为1.8898,1.4945,0.2861及0.4302.UPGMA聚类结果表明,59份样品间的相似性系数为0.6540~0.9829,平均为0.7060.用SRAP多种引物组合方法有效区分59份苹果种质资源,并建立指纹图谱,置信概率达99.99%.选取遗传相似系数0.7010进行分类,59份供试苹果材料可以分为3大类群.第Ⅰ类群为原产山东的野生资源泰山海棠(Malushupehensis var. taishanensis),第Ⅱ类群以海棠(M.micromalus)和楸子(M.prunifolia)为主,含有少量的小果型花红,第Ⅲ类群主要以苹果(M.domestica)、花红(M.asiatica)为主,含有少量的海棠(M.micromalus)和楸子(M.prunifolia).当遗传相似系数为0.7480时,第Ⅱ类群、第Ⅲ类群又分别可以划分出若干小的类群,苹果(M.domestica)聚在一起,中国绵苹果(M.domesticasubsp.chinesis)、大部分的花红(M.asiatica)聚在一起,大部分的海棠(M.micromalus)与楸子(M.prunifolia)交互聚在一起,聚类结果总体上与形态学分类标准相一致.

关键词: 种质资源 苹果属 指纹图谱 山东省 SRAP标记

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基于SSR标记的132份甘薯种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析

植物遗传资源学报 2018 北大核心 CSCD

摘要:利用SSR分子标记技术,构建132份甘薯种质的DNA指纹图谱,并进行遗传多样性分析,旨在为甘薯种质资源亲缘关系鉴定、分类提供理论依据。利用筛选的核心引物进行PCR扩增,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测显示,19对引物共扩增出232个条带,其中多态性条带165条,多态性比率为71.1%,平均每对引物扩增出8.68个条带,多态性信息含量变化范围在0.6706~0.9331之间,平均为0.8158;其中引物SSR9和引物C33可将132份种质完全区分开,并构建供试材料的DNA指纹图谱,供试材料遗传距离在0.0363~0.5939之间,平均为0.4087,表明种质资源间遗传多样性丰富。基于SSR标记对供试材料进行聚类分析,将供试材料分为2个类群,第Ⅰ类群分为两个亚类,第Ⅰ-1亚类包括济薯25和3份日本引进品种日本金千贯、安納芋、日本薯;第Ⅰ-2亚类包括济徐薯23、苏丹、济薯09281。第Ⅱ类群分为两个亚类,第Ⅱ-1亚类由S07甘薯品系和与其亲缘关系较近的20份甘薯种质组成;第Ⅱ-2亚类由剩余的70份甘薯种质组成,为甘薯分子辅助育种中亲本的选择提供理论依据。

关键词: 甘薯 SSR 指纹图谱 遗传多样性 聚类分析

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莲藕品种资源InDel指纹图谱的构建

长江蔬菜 2017

摘要:利用自主开发的莲藕高多态性In Del标记,对山东省农业科学院水生生物研究中心莲藕种质资源圃中15个代表性莲藕品种资源进行分子标记分析。结果表明,利用In D38、In D61等7对引物组合即可区分该15个品种资源,并构建了各个品种的In Del指纹图谱,为莲藕品种鉴定和育种研究提供了技术支持。

关键词: 莲藕 品种资源 In Del 指纹图谱

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抗感黄曲霉花生种质遗传多样性评价与指纹图谱构建

山东农业科学 2016

摘要:为明确抗感黄曲霉花生种质的遗传多样性和亲缘关系,发掘优良抗性种质,本研究利用46对多态性SSR引物分析48份抗感黄曲霉或相关花生种质的遗传多样性,平均每对引物可扩增出5.15个等位变异,平均PIC值为0.604;聚类分析将48份种质分为8组,其中抗性种质被分成5组;低产毒种质91048、抗侵染种质AR-3、PI337409F和GFA-2以及抗圆柱状黑腐病种质PERRY与其它种质存在较大的遗传差异,可作为理想的育种材料;抽取5个标记共35个多态位点建立了48份抗感黄曲霉或相关花生种质的"引物+0,1字符串"计算机化的DNA指纹图谱。筛选出的优异种质可在抗黄曲霉品种培育中作亲本利用,以拓宽其遗传基础。

关键词: 抗黄曲霉 遗传多样性 聚类分析 指纹图谱

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山东省46个花生品种SSR指纹图谱构建与遗传多样性分析

核农学报 2016 北大核心 CSCD

摘要:为从分子水平上快速鉴别花生品种和选配优良杂交组合,以山东省审定的46个花生品种为材料,利用微卫星(SSR)标记进行DNA指纹图谱的构建和遗传多样性分析。从788对SSR引物中筛选出50对多态性高、稳定性好、谱带清晰的引物,共检测到175个等位位点,其中122个为多态性位点,多态性比率达70.52%;每对SSR引物扩增出的等位位点数为2~7个,多态性信息量变化范围为0.6753~0.8412,平均为0.823。此外,利用14对引物可将46份材料完全区分开。聚类分析表明,在相似系数0.77处,所有供试材料聚为一类,在相似系数0.80处,仍有76%的材料聚在一起。利用SSR标记构建的指纹图谱可为花生种质资源管理及育种实践提供依据。

关键词: 花生 审定品种 SSR标记 指纹图谱 遗传多样性

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红花性状标记杂交棉新品种鲁05H9 SSR指纹图谱构建及应用

山东大学学报(理学版) 2014 北大核心 CSCD

摘要:利用SSR分子标记技术对红花标记杂交棉新品种鲁05H9及其亲本材料进行多态性检测,从多态性高、重复性好的98对SSR核心引物中筛选出12对在双亲间具有多态性的引物、在F1中表现为杂合带的共显性标记。利用该12对引物构建了鲁05H9及其亲本的SSR指纹图谱。利用核心引物组合扩增的方法,可以鉴定鲁05H9的真实性和纯度,对于品种保护、纯度鉴定及杂交种推广具有极其重要的意义。

关键词: 杂交棉 红花标记性状 SSR 指纹图谱

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应用FISH-AFLP技术分析平欧杂种榛主栽品种的遗传关系

中国农业科学 2013 北大核心 CSCD

摘要:【目的】建立平欧杂种榛FISH-AFLP技术体系,并应用该技术分析平欧杂种榛主栽品种的遗传关系。【方法】以达维等10个主栽品种为试材,经DNA提取、PstⅠ/MseⅠ双酶切,进行FISH-AFLP反应,数据转换为"0—1"矩阵后,使用NTSYS pc 2.11F和Popgene 1.32软件进行数据分析并作图。【结果】从64对引物中,筛选出15对多态性强的PstⅠ/MseⅠ引物,共获得1 739条谱带,引物平均多态带比率97.94%;平欧杂种榛主栽品种的相似性系数为0.7556—0.8543,当阈值为0.8398时,可分成4个AFLP群,其中,玉坠(84-310)、辽榛4号(85-41)和平欧69号(84-69)单独为1群,其他品种为1群;平欧杂种榛主栽品种的有效等位基因数、基因多样度、Shannon信息指数分别为1.3921、0.2482和0.3957,具有较高的遗传多样性;研究获得的特征条带可用于平欧杂种榛主栽品种的快速鉴别。【结论】由于平欧杂种榛的实生选优群体是多亲本组合的混合后代,因此,该群体是一个具有高度遗传多样性的群体,主栽品种间存在复杂的亲缘关系;研究构建的FISH-AFLP技术流程、筛选得到的引物以及分析得到的各项遗传参数,可为其他榛属植物的相关研究提供参考。

关键词: 平欧杂种榛 FISH-AFLP 指纹图谱 亲缘关系 遗传多样性

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SSR分子标记在作物种质资源鉴定中的应用

山东农业科学 2012

摘要:介绍了SSR分子标记的特点及其在作物种质资源鉴定中的应用,主要包括亲缘关系鉴定、品种鉴定、真实性鉴定及纯度鉴定;提出了改进方法,并对其应用前景作了展望。

关键词: SSR标记 作物 指纹图谱 种质鉴定

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32个柿主栽品种SSR图谱构建及遗传变异分析

西北植物学报 2011 北大核心 CSCD

摘要:以32份柿主栽品种为试验材料,利用SSR标记技术构建其指纹图谱并进行遗传多样性分析。从78对候选引物中筛选出20对多态性高、稳定性好的引物作为核心引物,构建柿主栽品种SSR指纹图谱。结果显示:(1)20对引物在32份材料中共扩增出183条多态性条带,每对引物扩增出3~20条不等,平均每对引物扩增出9.15条,多态性比率为81.3%。各个位点的杂合度在0.410 3~0.914 3之间,平均为0.702 7。(2)8对引物在12个品种上具有特征带型,采用5对引物进行组合鉴定即可将32个柿品种完全区分开。(3)依据SSR带型特征,对每对引物生成的不同带型直接编号,简化柿SSR带型记录方法,并利用每个品种的带型编号,建立其DNA指纹图谱,结果表明,核心引物组合法比特征谱带法更适用于构建中国柿主栽品种DNA指纹图谱。(4)根据系统聚类分析将32个柿主栽品种分为两大类,品种间的亲缘关系与地理来源具有一定的相关性。

关键词: 主栽品种 SSR 指纹图谱 遗传多样性

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