科研产出
基于SSR荧光标记构建板栗品种(系)核心种质群
《果树学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：[目的]构建中国板栗品种(系)的核心种质.[方法]以342个中国板栗品种(系)为材料,用21对SSR荧光引物进行扩增,基于等位位点数最大原则,采用分层抽样、模拟退火算法、随机搜索算法构建核心种质;对板栗品种的含水量、可溶性糖含量、直链淀粉、支链淀粉、总淀粉含量等19个表型性状进行测量后开展差异显著性分析.[结果]21对SSR引物共检测到212个等位位点,等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)分别为10.095、3.488、0.596、0.658、0.642,表明板栗品种(系)具有丰富的遗传多样性.聚类结果显示,342个板栗品种(系)在分为南北两个群体基础上存在较多混杂,说明南北方品种存在较多基因交流.同时南北方板栗品种(系)的可溶性糖含量、直链淀粉含量、支链淀粉含量、刺苞厚、坚果厚、坚果宽呈显著性差异;总苞质量、苞质量、刺苞宽、刺苞高、苞肉厚、单粒质量呈极显著差异;含水量、总淀粉含量、出实率等其他指标无显著性差异.通过对3种方法所计算的等位位点数比较,确定基于等位基因数的模拟退火算法为最优取样策略,依次构建85份核心种质.T检验结果表明,核心种质与原始种质遗传参数无显著差异,能够充分代表原始种质的遗传多样性.[结论]确定基于等位基因数的模拟退火算法为最优取样策略,为构建板栗品种核心种质较好的方法,并得到85份核心种质,保留率为24.85%.
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八倍体草莓DNA指纹图谱的构建与初步遗传分析
《中国农业大学学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为对草莓品种进行分子鉴定,从59对SSR引物中筛选出18对多态性好的引物,采用毛细管电泳检测方法对84份八倍体草莓品种进行标记分析,检测每个标记等位变异大小,并进行初步遗传分析.将每个引物对84份草莓扩增的带型按照一定原则进行数字标注,为了简化编码,引物Pl~P18分别编号为字母A~R,将引物编号与相应的带型编码进行组合得到该样品在特定引物的扩增产物编码,按照18对引物顺序串联这些编码形成该品种的DNA指纹图谱.结果表明:18对SSR引物共扩增得到多态性条带150个,不同引物扩增到多态性条带数4~17个,共检测到377个带型;各引物的多态性信息含量(PIC)值为0.494~0.908,平均值为0.738;利用18对SSR引物共构建了 84个草莓品种的DNA指纹图谱.聚类分析结果表明:在遗传相似系数为0.99时能将所有品种区分开,一些来源相同的品种被优先聚在一起.综上,本研究成功构建84个草莓品种的DNA指纹图谱,这些品种遗传关系较近.
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西洋梨二倍体及其人工诱导同源四倍体遗传差异的SSR分析
《分子植物育种 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：以西洋梨'丰产'二倍体及其10个同源四倍体株系为材料,通过微卫星(SSR)分子标记技术对西洋梨二倍体与同源四倍体之间的遗传差异性进行了研究.应用10对SSR引物对11份材料进行扩增,共扩增出23条谱带,其中有8条呈多态性,多态性比例为34.78%;10对引物中有3对引物为多态性引物.聚类分析显示,不同同源四倍体株系与二倍体的遗传差异大小亦不同;在10个同源四倍体株系中有3个株系扩增的条带与二倍体完全相同,7个同源四倍体株系与二倍体相比产生了差异性条带.研究结果表明,西洋梨二倍体与其同源四倍体之间以及10个同源四倍体株系之间在DNA水平上表现出了一定的多态性.本研究能够为进一步进行西洋梨多倍体的育种实践提供理论指导.
关键词： 西洋梨(Pyrus communis L.) 同源四倍体 遗传差异 SSR
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1980s-2010s华北夏谷区主栽谷子品种SSR遗传多样性分析
《植物遗传资源学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：通过对20世纪80年代以来具有代表性的华北夏谷区审(鉴)定的20个主栽谷子品种进行SSR标记多态性分析,研究了华北地区育成谷子品种的遗传多样性。49对引物在20个谷子品种中扩增出具有多态性的条带,共检测出142个等位变异,平均每个位点检测出的等位变异数为2.96个。标记位点多态性信息含量(PIC)变幅为0.0904～0.6896,平均为0.4168。20份材料间的遗传距离变幅为0.0173～0.9000,聚类分析将其分成3个类群,其中谷丰1号自成一类,表明谷丰1号的遗传距离较其他品种大。不同年代谷子品种间遗传距离分析结果显示,各年代品种之间的平均遗传距离由大到小依次是1980s>1990s>2000s>2010s,表明随着年代的递进育成品种的遗传差异减小,亲缘关系增近。
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基于SSR标记的132份甘薯种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析
《植物遗传资源学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：利用SSR分子标记技术,构建132份甘薯种质的DNA指纹图谱,并进行遗传多样性分析,旨在为甘薯种质资源亲缘关系鉴定、分类提供理论依据。利用筛选的核心引物进行PCR扩增,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测显示,19对引物共扩增出232个条带,其中多态性条带165条,多态性比率为71.1%,平均每对引物扩增出8.68个条带,多态性信息含量变化范围在0.6706~0.9331之间,平均为0.8158;其中引物SSR9和引物C33可将132份种质完全区分开,并构建供试材料的DNA指纹图谱,供试材料遗传距离在0.0363~0.5939之间,平均为0.4087,表明种质资源间遗传多样性丰富。基于SSR标记对供试材料进行聚类分析,将供试材料分为2个类群,第Ⅰ类群分为两个亚类,第Ⅰ-1亚类包括济薯25和3份日本引进品种日本金千贯、安納芋、日本薯;第Ⅰ-2亚类包括济徐薯23、苏丹、济薯09281。第Ⅱ类群分为两个亚类,第Ⅱ-1亚类由S07甘薯品系和与其亲缘关系较近的20份甘薯种质组成;第Ⅱ-2亚类由剩余的70份甘薯种质组成,为甘薯分子辅助育种中亲本的选择提供理论依据。
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长生07谷子品系的创制及基于MAS的遗传分析与评价
《分子植物育种 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：以栽培种长农35和通过纯系育种选自其同质群体的长生07品系(种)为材料,以101对引物对试样DNA进行筛选获取在两者间存在多态性的SSR。通过检测发现,共有5个SSR标记在长农35和长生07品系间存在多态性,且分属3个连锁群(Link group)。结合试材形态学变异,遗传差异程度非自然变异可以解释。得以推定,长生07品系可能来源于长农35群体中个体与其它种群的异交组合,也可能来自同一亲本组合继代的不同谱系,或来自长农35剩余变异在定向选择压力下的遗传漂变,传统认为的长生07品系来自长农35自然变异的可能性是非常小的。
关键词： 谷子 分子标记辅助选择(MAS) SSR 连锁群(LG)
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