科研产出
不同生态区骨干谷子品种表型鉴定与遗传分析
《核农学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：骨干谷子品种对谷子产业发展发挥了重要的作用,为了解其优异性状遗传基础及利用价值,选用来源于不同生态区的12个骨干谷子品种,进行表型鉴定和遗传差异分析。结果表明,12个来源于不同生态区的骨干品种在株高、穗长、穗粗、穗下节间长、单穗重、生育期以及黄色素含量等方面差异较大。79对SSR多态性标记共检测到258个多态性变异位点,平均3.265 8个;SSR标记多态性（PIC）的变幅为0.141 1～0.711 6,平均为0.510 1;其中PIC>0.5的SSR标记有50对,占多态性标记的63.3%。12份材料的遗传距离变幅为0.140 2～0.801 1,平均为0.473 7;来自华北夏谷区的豫谷1号和沧谷4号遗传距离最近,而沧谷4号和来自内蒙高原的地方品种金香玉距离最远;总体而言,华北夏谷区品种和西北早熟春谷区品种遗传距离相对较大。相似性系数为0.594时,12个品种可聚为两类,华北夏谷区的豫谷1号、矮88、冀谷19号、沧谷4号和济谷12聚为一类,来自西北春谷早熟区、晚熟区和东北春谷区的7个品种聚为一类,聚类分析结果和品种的生态类型具有较高的一致性。群体结构分析和聚类分析的结果相似,华北夏谷区品种和春谷区品种之间存在基因交流。总之,不同生态区来源品种间遗传差异较大,同一生态区来源品种遗传差异较小;华北夏谷区骨干品种之间遗传差异较春谷区品种遗传差异相对较小;华北夏谷区品种和西北早熟春谷区品种间遗传差异较大,丰富华北夏谷区遗传变异,应加强与西北早熟春谷区品种之间的交流。本研究结果为优异谷子品种培育及种质资源利用提供了一定依据。
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山东省水稻品种(系)的遗传多样性分析
《作物杂志 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：利用全自动DNA分析仪荧光SSR-PCR技术和农业行业标准《水稻品种鉴定技术规程SSR标记法（NY/T1433-2014）》中公布的48对SSR引物,对山东省育成和审定的48个水稻品种（系）进行遗传多样性分析。结果表明,有40对SSR引物在48个品种（系）间表现多态性,多态率为83.3%。检测到等位基因133个,每对引物的等位基因数变幅为1～7个,平均3.32个。SSR引物的多态性信息量（PIC）变化范围为0.0384～0.7333,平均值0.2560。标记指数（MI）的变化范围在0.08～5.13,平均值0.93。48个水稻品种（系）间的遗传相似系数（GSC）在0.6390～0.9859之间,平均值0.7800,89.6%品种（系）的GSC在0.7189～0.9859之间,亲缘关系较近;以GSC为基础,按UPGMA方法在阈值0.75处将48个品种（系）划分为4大类群。由此可见,山东省育成和审定的水稻品种（系）遗传多样性不够丰富,品种（系）间的亲缘关系较近,需要进一步拓宽亲本选择范围,扩大遗传背景。
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洋葱雄性不育恢复位点Ms座位的SSR标记开发及其应用
《中国农学通报 》 2020
摘要：本研究旨在开发稳定可靠的洋葱育性位点分子标记,并将其应用于育种实践,筛选育种系,从而缩短育种周期,节省育种成本,加速洋葱杂交种的培育进程。以洋葱育性恢复Ms座位的AFLP序列为基础,采用序列比对分析、PCR检测和表型分析等方法,开发、鉴定、应用了WH-SSR-1分子标记。结果表明:WH-SSR-1标记与Ms位点紧密连锁,Ms位点基因型为纯合显性MsMs时,有1条102 bp的扩增带;纯合隐性msms时,有1条99 bp的扩增带;杂合Msms时,有102 bp和99 bp两条扩增带。32份洋葱材料的验证结果证实了Ms座位的标记类型与基因型完全相符。随后从4个OP群体中直接获得了2个配套的不育系与保持系,‘吊玉’和‘天正红玉’因未检测到保持株或不育株,无法简单实现配套。WH-SSR-1标记与Ms位点紧密连锁,能够将其用于育种系筛选的育种实践,从OP群体中直接选择保持株和不育株,同时实现两系配套。
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基于SSR标记的区试棉花品种纯度和真实性鉴定
《分子植物育种 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：利用SSR标记进行棉花品种纯度检测和真实性鉴定,可以为棉花品种审定提供重要依据.本研究在前期工作基础上,选择26对覆盖棉花每条染色体的SSR核心引物,以2018年参加山东省区试的53个棉花品种为材料,进行纯度检测和真实性鉴定.结果显示,26对SSR核心引物在53个品种中共检测到111个等位基因位点,遗传距离为0.01~0.91,平均为0.44;分子遗传纯度≥95%的品种占64.15%,<90%的品种占18.87%.聚类分析表明,CQ1802与JQ1805、CQ1803与JQ1803之间仅有1个位点的差异,遗传距离为0.01,这两组品种为同一品种参加了不同组别的试验.品种CS1802和ZQ1802的分子遗传纯度很低,分别为71.47%和72.76%,是由于群体中单个位点存在不同杂合而造成的.本研究表明利用SSR分子标记技术鉴定棉花区试品种的真实性和纯度,可以有效降低品种低代参试以及同一品种重复参试和重复审定现象的发生,对维护区域试验的权威性和育种家的合法权益具有重要意义.
关键词： 棉花 纯度检测 真实性鉴定 SSR标记 遗传多样性分析
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350份小麦种质的SSR遗传多样性分析
《山东农业科学 》 2020
摘要：为了解不同小麦种质资源的遗传多样性,本研究选用37对SSR引物分析了350份2012—2017年间进行新品种保护的小麦种质的遗传多样性.结果表明,37对引物共检测到288个多态性位点,平均每对引物检测到7.784个,变化范围为2~14个;等位基因多样性指数分布范围为0.268~0.807,平均值0.653;引物的多态信息含量平均值为0.608,变幅为0.250~0.785.采用neighbor joining法进行聚类,将350份小麦种质划分为四大类,多为具有相同亲本或亲缘关系相近的材料聚在一起.综上,350份小麦种质具有较大遗传差异,可为小麦育种的亲本选择提供参考.
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小麦DUS测试已知品种DNA指纹数据库构建及其应用
《植物遗传资源学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：为解决DUS测试中特异性测试近似品种筛选难的问题,本研究基于2256份DUS测试小麦已知品种构建DNA指纹数据库。首先利用81对SSR引物对96份小麦品种进行遗传相似度分析。结果表明,81对SSR引物扩增出84个位点,共检测到731个等位变异,每个位点的等位变异数在3～18之间,多态性信息指数(PIC)变化范围为0.29～0.89。选取42个SSR标记构建了2256份小麦品种DNA指纹数据库,共获得148493个数据,除引物barc14、xgwm341之外,其他引物数据缺失率在5%以内。对176份小麦品种进行DNA指纹数据采集和特异性测试,结果表明不具有特异性的申请品种与其最近似品种的遗传相似度都在90%以上;本研究基于42对SSR荧光标记引物构建了我国小麦DUS测试已知品种的DNA指纹数据库,确定近似品种筛选的遗传相似度阈值为80%,建议将与申请品种遗传相似度高于80%的已知品种作为近似品种进行田间种植和特异性评价。
关键词： DUS测试 已知品种 特异性测试 SSR标记 DNA指纹库
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小麦新种质CH1357抗白粉病遗传分析及染色体定位
《作物学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：白粉病是影响小麦产量和品质的一种主要病害.小偃麦衍生品系CH1357对白粉病具有较好的成株抗性,苗期对27个菌株表现为免疫或高抗,是一个高抗白粉病的优异抗源.为了明确其抗白粉病基因在染色体上的位置,对台长29/CH1357和绵阳11/CH1357的F1、BC1及F2:3家系进行了遗传分析,并利用分离群体分组分析法(bulked segregant analysis,BSA)将其初步定位.CH1357的白粉病抗性受1对显性核基因控制,位于染色体5DS,暂命名为PmCH1357.其侧翼连锁标记为Xcfd81和Xbwm8,在2个作图群体台长29/CH1357和绵阳11/CH1357中的遗传距离分别为2.0 cM/11.3 cM和1.5 cM/8.9 cM.PmCH1357与5DS染色体上已报道的其他抗白粉病基因抗谱不同,可能是一个新的抗源.
关键词： 白粉病抗性 SSR标记 连锁图谱 基因定位 Pm2
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利用荧光SSR标记构建杏新品系的分子身份证
《北方园艺 》 2018 北大核心
摘要：以15份杏种质(包括4个新品系)为试材,采用6个荧光SSR标记进行PCR试验,构建了4个杏新品系的分子身份证,以期为利用分子鉴定技术对4个杏新品系进行品种权保护提供参考依据。结果表明:利用6个标记共检测到47个等位基因,57个带型,平均每个标记获得9.8个带型;利用其中5个标记构建10位数的分子身份证,‘开园’‘春华’‘英华’和‘美华’4个新品系的分子身份证分别是2578231744、5878341744、277a231344和6768174612,既互不相同,也与其它种质的分子身份证不同。这些结果为4个杏新品系利用分子鉴定进行品种权保护提供了依据。
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芝麻产量相关性状与SSR标记的关联分析
《中国油料作物学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：为挖掘控制芝麻产量相关性状的基因位点,本研究利用多态性较高的72个SSR标记,对来自国内外96份芝麻品种资源进行遗传多样性和群体遗传结构分析,在此基础上采用TASSEL3.0软件的MLM(Mixed Linear Model)方法对株高、株蒴数、每蒴粒数、蒴长、蒴宽、千粒重、始蒴部位、空稍尖8个产量相关性状进行SSR标记的关联分析。结果表明:72个标记共检测出446个等位变异,变异范围为2~14个,平均6.2个;引物的多态性信息含量(PIC)变异范围为0.242 1~0.821 0,平均为0.540 7;基因多样性指数的变异范围在0.550 4~0.989 7,平均值为0.747 7。群体遗传结构分析将供试材料分为3个亚群。关联分析结果显示,51个标记位点与株高、蒴长、每蒴粒数、始蒴部位、空稍尖显著关联,各标记对表型变异的解释率在13.29%~32.08%。有5个位点在多个环境或均值下被重复检测到,是较为稳定等位变异,如与株高相关联的位点Hs1775-A 2、SIM201-A1;与每蒴粒数、始蒴部位和株蒴数分别关联的标记位点Hs1514-A1、SIM004-A3和SIM002-A1。
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