科研产出
鲁中肉羊LHCGR基因突变与其产羔数关联分析
《家畜生态学报 》 2020 北大核心
摘要:为了揭示LHCGR基因g.75741060A>C和g.75748150A>G突变与鲁中肉羊产羔数的关系,该研究采用Sequenom MassARRAY(R)SNP检测方法对384只鲁中肉羊LHCGR基因上述2个突变位点进行分型,并将分型结果与其产羔数进行关联分析.结果 显示:LHCGR基因2个SNPs在鲁中肉羊中均表现为中度多态(0.25
芝麻产量相关性状与SSR标记的关联分析
《中国油料作物学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要:为挖掘控制芝麻产量相关性状的基因位点,本研究利用多态性较高的72个SSR标记,对来自国内外96份芝麻品种资源进行遗传多样性和群体遗传结构分析,在此基础上采用TASSEL3.0软件的MLM(Mixed Linear Model)方法对株高、株蒴数、每蒴粒数、蒴长、蒴宽、千粒重、始蒴部位、空稍尖8个产量相关性状进行SSR标记的关联分析。结果表明:72个标记共检测出446个等位变异,变异范围为2~14个,平均6.2个;引物的多态性信息含量(PIC)变异范围为0.242 1~0.821 0,平均为0.540 7;基因多样性指数的变异范围在0.550 4~0.989 7,平均值为0.747 7。群体遗传结构分析将供试材料分为3个亚群。关联分析结果显示,51个标记位点与株高、蒴长、每蒴粒数、始蒴部位、空稍尖显著关联,各标记对表型变异的解释率在13.29%~32.08%。有5个位点在多个环境或均值下被重复检测到,是较为稳定等位变异,如与株高相关联的位点Hs1775-A 2、SIM201-A1;与每蒴粒数、始蒴部位和株蒴数分别关联的标记位点Hs1514-A1、SIM004-A3和SIM002-A1。
陆地棉早熟基因来源的遗传分析
《作物学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要:棉花早熟性相关的性状多为复杂的数量性状,是由多个基因和环境共同作用的结果,其遗传基础研究比较困难。利用连锁作图和关联分析方法,对目标性状进行基因定位,找出与性状相关联的位点,为解析复杂性状的基因来源提供了新的手段。本文分别以早熟亲本新陆早8号和新陆早10号为母本,以陆地棉标准系TM-1为父本构建F2作图群体,利用在亲本间筛选出的多态性SSR引物,通过JoinMap 3.0软件构建了2张遗传图谱,以Win QTLCart 2.5复合区间作图法在F2~F2:3中定位到控制全生育期、苗期、蕾期、花铃期和霜前铃数等早熟性相关性状的37个QTL。控制早熟性的有利等位基因多数来自早熟祖先611波和金字棉。多数性状在两类材料中由不同的基因控制,且以加性遗传为主。在由43个陆地棉品种材料构成的自然群体中通过关联分析检测到54个与这些早熟性相关性状极显著关联的位点。研究表明连锁作图和关联分析的检测结果具有较高的可比性。本研究为早熟陆地棉聚合改良以及分子标记辅助育种打下了基础。
基于图像处理的冬小麦植被覆盖率测定及其遗传解析
《作物学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要:植被覆盖率是反映植株生长势的重要生理性状,在旱作地区尤为重要。图像处理技术能够快速有效地对苗期和孕穗期植被覆盖率进行量化分析。以28份山东小麦主栽品种和品系为材料,在240株m 2和360株m 2密度下,连续2年测定了孕穗前不同发育阶段的植被覆盖率,并利用921个DArT标记和83个SSR标记分析了与植被覆盖率相关的遗传区段。结果表明,不同密度下,冬小麦植被覆盖率在越冬期、返青期和孕穗期存在显著差异,而拔节期基本一致。拔节期植被覆盖率与春季最高分蘖数、抽穗后群体叶面积指数、单位面积穗数和籽粒产量均呈显著正相关,r=0.73~0.76(P<0.01),表明拔节期植被覆盖率可用于预测上述性状。共检测出12个遗传区段与植被覆盖率相关联,大部分区段直接参与调控苗期和孕穗期的生长势。10个遗传区段与已报道的苗期性状、产量性状及抗病位点一致,其中5BL、6AS和6BL染色体上携带的植被覆盖率相关遗传区段与已报道的苗期比叶面积和生物量等位点完全相同。建议将植被覆盖率作为生长势量化指标,用于育种选择和遗传研究。
关联分析在植物育种中的应用现状
《山东农业科学 》 2012
摘要:关联分析是近年来出现的一种对QTL进行定位的方法。本文综述了关联分析在材料选择、群体结构分析、标记应用、表型分析、统计方法等方面的应用现状和存在的问题。
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