科研产出
基于ISSR标记的16个核桃品种遗传多样性分析及分子身份构建
《核农学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为了分析16个核桃栽培品种的遗传关系和构建分子身份证,以核桃幼叶为材料提取其基因组DNA,利用ISSR分子标记方法,从28条引物中筛选出10条引物对16个核桃栽培品种进行标记分析。结果表明,10条ISSR引物共扩增出115个位点,每条引物可获得9~15条DNA片段,平均为11.5条,其中多样性位点99个,多态性百分比达86.09%,16个核桃品种之间的平均有效等位基因数(Ne)为1.5080,Nei's基因多样性指数(H)为0.3041,Shannon信息指数(I)为0.4577,遗传相似系数(GS)变幅为0.42~0.82。采用UPGMA方法构建的聚类图表明,16个核桃品种可以划分为4个组,品种间遗传信息差异比较大,具有丰富的遗传多样性,能够通过ISSR标记方法将16个品种区分开。此外从10条引物中筛选出3条引物作为16份核桃品种资源种质鉴定的核心引物,构建了每个核桃品种的分子身份证。本研究通过构建16个核桃品种的分子身份,为核桃品种鉴定和品种权保护提供了依据,也为核桃育种亲本的选配和种质资源鉴定奠定了基础。
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青海地方核桃单株遗传关系的ISSR分析
《青海大学学报(自然科学版) 》 2015
摘要：采用ISSR分子标记的方法,对青海地方核桃品种单株进行了遗传关系研究。实验从30条ISSR引物中筛选出4条进行电泳分析,使用NTSYS pc 2.11F和Popgene 1.32软件进行数据统计分析并作图。结果表明:4条ISSR引物共获得40条谱带,平均每条引物10条谱带,引物平均多态带比率82.5%;4条ISSR引物可将所有样品完全分开,当遗传相似性阈值为0.736时可将样品分成7组。样品间的遗传相似性系数为0.550~0.975(平均0.763)。由于长期的自然变异和选择,青海地区核桃积累了较高的遗传多样性,单株间存在不同程度的亲缘关系。
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平欧杂种榛主栽品种(系)遗传关系的ISSR分析
《植物遗传资源学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：采用ISSR分子标记的方法,对达维、辽榛3号等17个平欧杂种榛主栽品种(系)进行了遗传关系研究。试验从60条ISSR引物中筛选出7条进行电泳分析,使用NTSYS pc 2.11F和Popgene 1.32软件进行数据统计分析并作图。结果显示:7条ISSR引物共获得58条谱带,平均每条引物8.3条谱带,引物平均多态性比率84.6%;7条ISSR引物可将所有样品完全分开,当遗传相似性阈值为0.687时可将样品分成3个类群:第Ⅰ类群14个品种(系)可分成4个亚类,第Ⅱ类群1个品种,第Ⅲ类群2个品系。样品间的遗传相似性系数为0.448~0.879(平均0.678)。群体的有效等位基因数、基因多样度、Shannon信息指数分别为1.6751、0.3701和0.5308。上述结果表明,平欧杂种榛是一个具有高度遗传多样性的群体,主栽品种(系)间存在复杂的亲缘关系。该研究结果对于平欧杂种榛的遗传关系研究具有重要意义,也可为其他榛属植物的相关研究提供参考。
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12份樱桃品种遗传多样性的ISSR分析
《山东农业科学 》 2014
摘要：本试验采用ISSR技术对12份樱桃种质资源的遗传多样性进行了研究。筛选出6条ISSR引物对供试材料进行扩增,共检测到48个遗传位点,包含44个多态性位点,多态性位点百分率为91.67%。材料间遗传相似系数为0.29~0.98,平均为0.65。当阈值为0.58时,供试样品可分为3个组,即组Ⅰ、组Ⅱ和组Ⅲ。遗传相似性分析结果显示材料间具有丰富的遗传多样性。
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‘寒富’ב四倍体嘎拉’苹果的三倍性杂交后代ISSR和AFLP分析
《分子植物育种 》 2013 CSCD
摘要：利用ISSR及AFLP分子标记技术研究了‘寒富’ב四倍体嘎拉’苹果的7份三倍性后代及其亲本的遗传变异。结果表明ISSR扩增得到的遗传多样性指数中扩增多态性比率(PPB)为60.00%,观察等位基因数(Na)为1.600,有效等位基因数(Ne)为1.420,Nei's基因多样性指数(H)为0.236,Shannon信息指数(I)为0.346;均小于AFLP扩增的遗传多样性指数66.54%、1.665、1.421、0.240和0.357。根据ISSR和AFLP得到的UPGMA聚类图显示这7份三倍性杂交后代倾向于母本‘寒富’。在三倍性苹果遗传多样性检测上AFLP优于ISSR,且这7份三倍性新种质在遗传上倾向于母本遗传。为三倍性苹果育种的亲本选择提供依据。
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陕西核桃实生居群遗传多样性ISSR分析
《山东农业科学 》 2012
摘要：采用ISSR标记对陕西核桃实生居群39个个体的遗传多样性水平及居群的遗传结构进行了研究,从13个引物中筛选出8个用于正式扩增,检测到48个位点为多态位点,多态位点百分率(PPB)为87.27%;居群材料间遗传相似系数GS变幅为0.473～0.836,平均达0.679;Shannon-Weaver遗传多样性指数的分布范围为1.483～1.960,Simpson指数的分布范围为0.739～0.846。UPGMA聚类分析结果具有一定的相似性,但是也存在明显差异。ISSR标记能将39份核桃种质完全区分开,为科学合理地保护和利用现有的核桃资源提供了理论依据和技术支持。
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薹菜种质资源的RAPD和ISSR分析
《西北农林科技大学学报(自然科学版) 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：【目的】对29份薹菜(Brassica campestris L.ssp.chinensis Makino var.tai-tsai Hort)种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析,为薹菜的种质资源保护和利用奠定基础。【方法】利用优化的RAPD和ISSR标记体系,对采自山东、江苏和北京的29份薹菜品种进行DNA多态性分析,并采用类平均法对29份薹菜品种的RAPD和ISSR扩增结果进行聚类分析。【结果】从273条RAPD引物中筛选的33个RAPD引物,共扩增出了336条清晰的谱带,其中293条显示多态性,平均每个引物扩增出10.2条多态性谱带,多态性比率为87.2%。利用RAPD标记构建了29份薹菜资源的聚类树状图,距离系数为0.63～0.79。从100条ISSR引物中筛选的45个ISSR引物,共扩增出了522条清晰的谱带,其中414条显示多态性,平均每个引物扩增出9.2条多态性谱带,多态性比率为79.3%;利用ISSR标记构建了29份薹菜资源的聚类树状图,距离系数为0.70～0.86。【结论】基于RAPD和ISSR标记构建的29份薹菜品种的聚类树状图虽有一定差异,但总体趋势一致,1、20、21号薹菜与其他品种的遗传距离相对较远。
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应用RAPD和ISSR标记对24份花生栽培种材料进行遗传多样性分析
《广西植物 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：利用RAPD引物和ISSR引物分析我国24份花生栽培种材料的遗传多样性。结果表明:所选的RAPD引物和ISSR引物中分别有13条引物和10条引物扩增出了清晰并可重复的条带,共扩增出123条带和87条带,平均每条引物扩增出9.5条带和8.7条带,其中多态性带分别占条带总数的47.15%和57.47%,平均每条引物扩增出4.7条和5.7条多态性带。在此基础上,根据Nei-Li系数采用UPGMA法进行了聚类分析,可将24份花生材料分成4类:四粒红、汕油523、冀花2号、花育16和粤油7号等5个品种聚为一类;花育20、中花8号聚为一类;黑花生单独为一类;其余的花生聚为一类。RAPD和ISSR标记能够揭示花生栽培种的遗传多样性,在种质鉴定和遗传作图等方面具有一定应用潜力。
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核桃实生居群遗传多样性ISSR分析
《植物遗传资源学报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：利用ISSR技术对新疆核桃元丰、云新核桃、泰山野核桃和陕西核桃4个核桃实生居群共61份种质进行了遗传多样性分析。结果表明:从36条ISSR引物中筛选9条引物,共检测出101个位点,多态性位点89个,占检测位点总数的88.12%,有效等位基因数、Nei's基因多样性指数和Shannon信息指数分别为1.5207、0.3125和0.4759。UPGMA聚类结果表明,61份核桃种质聚为5组,元丰核桃居群和陕西核桃首先聚在一起,然后与云新核桃聚在一起,最后与泰山野核桃相聚,其中陕西核桃居群的遗传多样性最高,分为2组,其多态位点百分率、H值和I值分别为66.29%、0.2111和0.3239。居群间遗传一致度在0.6727~0.7970之间,基因流为0.4220,表明不同居群间基因交流程度很低,基因分化明显,在遗传组成上存在显著差异。
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