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资源类型: 中文期刊
关键词:SRAP(模糊匹配)
共13条记录
花生作图亲本间分子标记的多态性分析

《湖北农业科学 》 2015 北大核心

摘要:利用Ah MITE、SSR、SRAP及SRAP-RGA 4种分子标记技术研究了花生(Arachis hypogaea Linn)作图亲本花育22号与"950527"间的分子多态性。经过初筛和复筛,822对Ah MITE引物、1 106对SSR引物、460对SRAP和731对SRAP-RGA引物在两亲本间表现稳定多态性的数量分别为101、207、25和72对,多态性比率分别为12.3%、18.7%,5.4%和9.8%。结果表明,SSR标记揭示作图亲本间多态性的效率最高,其次是Ah MITE标记,SRAP标记的多态性和重复性最差。

关键词: 花生(Arachis hypogaea Linn) 多态性 分子标记 SSR Ah MITE SRAP SRAP-RGA

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利用正交设计优化番茄SRAP-PCR反应体系

《中国蔬菜 》 2011 北大核心

摘要:以番茄耐低温材料抗寒0号和不耐低温番青的F2为材料,利用正交试验设计对SRAP-PCR反应体系中的5因素(模板DNA、引物浓度、Mg2+浓度、dNTPs浓度、TaqDNA聚合酶)在4个水平上进行正交优化试验。结果表明:各因素水平变化对反应体系影响的大小依次为:引物>TaqDNA聚合酶>dNTPs>模板DNA>Mg2+。建立番茄耐低温SRAP-PCR的20μL最佳反应体系为:模板DNA为15ng、引物浓度0.75μmol·L-1、Mg2+浓度2.0mmol·L-1、dNTPs浓度0.125mmol·L-1、TaqDNA聚合酶1.0U。

关键词: 番茄 正交设计 优化 SRAP

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番茄耐低温相关基因的SRAP标记筛选

《植物生理学报 》 2011 北大核心 CSCD

摘要:以番茄耐低温和不耐低温基因组DNA为材料进行SRAP分析,共筛选了225对SRAP引物,其中27对引物在两池之间表现差异,经测序只有Me2Em5扩增出与番茄耐低温相关的差异性片段,大小约为273bp,该片段仅在耐低温植株中稳定扩增。经Blast分析比对,该片段与已报道的PEG和低温诱导后在沙冬青幼苗中表达基因的cDNA片段同源。根据差异片段序列设计特异引物,将M2E5-273标记成功转化为更稳定的SCAR标记。

关键词: 番茄 耐低温 SRAP 分子标记

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小麦空间诱变抗寒性突变体的初步研究

《中国农学通报 》 2011 北大核心 CSCD

摘要:为了研究小麦抗寒性机理,发掘抗寒性相关基因,以空间诱变创制的‘邯6172’抗寒性突变体作为研究对象,利用SRAP标记对突变体和对照的DNA进行了比较分析。结果表明,共用了380对引物,有6对引物在对照和突变体间扩增出了稳定的差异片段,占所用引物总数的1.58%,表明对照和突变体在DNA水平上的差异很小。在对照和突变体间扩增出了6条稳定的差异片段,3个存在于突变体中,对6个片段进行同源性比对,发现片段Me3-Em7-Mt、Me4-Em11-CK、Me7-Em19-CK和Me6-Em9-Mt的核苷酸序列都与小麦3B染色体序列具有较高的相似性,这表明影响突变体抗寒能力的基因或调控序列很可能位于3B染色体序列上。

关键词: 小麦 空间诱变 抗寒性 突变体 SRAP

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洋葱SRAP-PCR体系的优化研究

《山东农业科学 》 2011

摘要:优化了洋葱SRAP-PCR反应体系的模板浓度和Mg2+浓度。采用8对不同的引物组合和2份不同的洋葱材料进行验证实验,结果表明,在20μl的反应体系中,模板的量在180~210 ng均可获得清晰的扩增,低于180 ng,扩增带模糊,高于210 ng扩增背景严重;合适的Mg2+浓度在1.5~2.0 mmol/L之间;使用优化的反应体系,扩增条带清晰,可满足不同引物组合和洋葱材料的要求。

关键词: 洋葱 SRAP 分子标记

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不同来源丹参种质遗传多样性的SRAP标记分析

《中草药 》 2010 北大核心 CSCD

摘要:目的解决丹参育种工作中的丹参种质资源的鉴别与分类。方法利用SRAP分子标记技术对48个不同来源的丹参种质进行了遗传多态性的分析,并对其进行了类群的划分。结果利用筛选到的15对SRAP引物组合从材料中检测到了120个等位位点。利用不加权成对群算术平均法(UPGMA)对丹参种质进行聚类分析可以将其分为两大类群,每一类群包含3个亚群。结论不同丹参种群间遗传距离与空间距离之间的关系较为复杂,不同地区间丹参种质的遗传分化不均衡。随着丹参种质驯化程度的增加,种质间的遗传距离有所增加。

关键词: 丹参 SRAP 遗传多样性分析

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航天搭载小麦种子SP_3代的遗传变异分析

《中国农学通报 》 2010 北大核心

摘要:为探讨航天搭载对小麦籽粒的诱变效应,给航天诱变育种提供理论支持,本研究利用酸性聚丙烯酰胺电泳和SRAP技术对航天搭载小麦品种白硬冬2号SP3代种子的醇溶蛋白和基因组DNA进行了分析。结果表明,航天诱变能够诱发醇溶蛋白和基因组DNA发生变异。在15个SP3代材料中,有8个材料的醇溶蛋白组成发生了变异,醇溶蛋白4个分区对航天诱变的敏感程度不同,以ω区最为敏感,产生的变异最多。利用25对SRAP引物对15个SP3代材料的基因组DNA变异进行了分析,共扩增出227条多态性条带,15个小麦航天诱变后代材料与对照间的遗传相似系数为0.821~0.937。

关键词: 小麦 航天诱变 醇溶蛋白 SRAP

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新疆野苹果群体遗传结构和遗传多样性的SRAP分析

《园艺学报 》 2009 北大核心 CSCD

摘要:采用SRAP分析中国新疆野苹果4个种下居群的群体遗传结构和遗传多样性。结果表明:10对SRAP引物总共扩增了209条带,其中206条是多态性带(98.56%)。巩留群体、新源群体、霍城群体和裕民群体分别扩增了180、169、178和165条多态性带,巩留群体的随机交配杂合度(hs=0.3037±0.0058)最高,其次为霍城群体。UPGMA聚类分析和群体间遗传分化系数显示,巩留群体和新源群体之间,以及霍城群体和裕民群体之间,遗传关系最近,群体间遗传变异最低。新疆野苹果群体内遗传变异高于群体间,占总变异的87.9%,主坐标轴分析显示4个群体是相对独立的,其中巩留群体和新源群体,霍城群体和裕民群体之间有较高的基因交流。所有参数分析表明,巩留群体遗传多样性最丰富,故在制定新疆野苹果原地和异地种质保护计划时应优先考虑巩留群体。

关键词: 新疆野苹果 SRAP 遗传多样性 群体遗传结构

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樱桃SRAP-PCR体系优化及其遗传多样性分析

《果树学报 》 2009 北大核心 CSCD

摘要:选取亲缘关系较远的3个不同基因型樱桃资源为试材,对影响SRAP标记PCR反应的模板、Mg2+、dNTPs、Taq酶及引物浓度进行了优化,建立了适合于樱桃SRAP标记的扩增体系。反应体系具体为:模板DNA75ng,dNTPs0.2mmol·L-1,Mg2+2.5mmol·L-1,引物0.3μmol·L-1,Taq酶1.0U,反应总体积20μL。采用优化的扩增体系,对45个樱桃种质材料进行了遗传多样性分析,筛选8对扩增清晰且多态性高的引物组合,检测位点共227个,其中多态性位点192个,占84.6%。应用NTSYS-pc软件进行聚类分析(UPGMA),结果表明45个樱桃品种可分为欧洲甜樱桃和中国樱桃2大类,品种间遗传相似系数在0.52~0.98;其中中国樱桃与甜樱桃种间的相似系数最小,表明2类种质具有不同的遗传背景;而组群内的不同品种资源表现了较高的遗传相似性。SRAP分子标记的聚类分析揭示了樱桃品种间亲缘关系与地理分布以及来源相关。

关键词: 樱桃 SRAP 体系优化 遗传多样性

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丹参种子航天搭载的生物学效应

《核农学报 》 2009 北大核心 CSCD

摘要:为探讨丹参种子航天搭载的生物学效应,利用"实践八号"育种卫星搭载丹参种子,返回地面后进行田间种植观测,分别从生育时期、种子活力、地上部形态特征、根部性状、结实性状分析丹参航天诱变的生物学效应,利用SRAP标记技术分析了材料在DNA水平上的变化。结果表明:航天搭载造成了DNA水平上的变异;提高了种子的发芽率和出苗率,促进了幼苗的发育,开花期提前;促进了花苔长度和花蕾数的增加,抑制了叶片生长。总体上促进了根部性状和种子性状的变异,除冠幅、花轴长度外,增大了各性状的变异系数。丹参种子航天诱变的生物学效应可为丹参种质改良和品种选育提供参考。

关键词: 丹参 航天诱变 生物学效应 SRAP

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