科研产出
基于ISSR标记的16个核桃品种遗传多样性分析及分子身份构建
《核农学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为了分析16个核桃栽培品种的遗传关系和构建分子身份证,以核桃幼叶为材料提取其基因组DNA,利用ISSR分子标记方法,从28条引物中筛选出10条引物对16个核桃栽培品种进行标记分析。结果表明,10条ISSR引物共扩增出115个位点,每条引物可获得9~15条DNA片段,平均为11.5条,其中多样性位点99个,多态性百分比达86.09%,16个核桃品种之间的平均有效等位基因数(Ne)为1.5080,Nei's基因多样性指数(H)为0.3041,Shannon信息指数(I)为0.4577,遗传相似系数(GS)变幅为0.42~0.82。采用UPGMA方法构建的聚类图表明,16个核桃品种可以划分为4个组,品种间遗传信息差异比较大,具有丰富的遗传多样性,能够通过ISSR标记方法将16个品种区分开。此外从10条引物中筛选出3条引物作为16份核桃品种资源种质鉴定的核心引物,构建了每个核桃品种的分子身份证。本研究通过构建16个核桃品种的分子身份,为核桃品种鉴定和品种权保护提供了依据,也为核桃育种亲本的选配和种质资源鉴定奠定了基础。
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24份桑树品种资源基于SRAP分子标记的亲缘关系分析
《蚕业科学 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：应用SRAP分子标记引物对24份桑树品种资源的基因组DNA进行PCR,检测其遗传多样性,分析品种间的亲缘关系。15对SRAP引物扩增产生126条谱带,平均每对引物产生8.4条谱带,其中多态性条带共99条,多态性比率为78.57%,说明24个桑树品种间具有丰富的遗传多样性。基于品种间遗传相似系数的UPGMA聚类图和基于品种的SRAP标记类型的主成分分析中,蒙桑种(Morus mongolica Schneid.)的品种吉蒙桑、白桑种(Morus alba L.)的品种垂枝桑和山桑种(Morus bombycis Koidz.)的品种昌农山桑单独聚类,其他来自白桑种、广东桑种(Morus atropurpurea Roxb.)、鲁桑种(Morus multicaulis Perr.)的栽培品种分为3组;白桑种种内各品种间的遗传变异较小,而广东桑种、鲁桑种种内各品种间的遗传变异相对较大;广东桑3个品种间的遗传背景差异较大;鲁桑栽培品种农桑12号与其父本桐乡青的遗传相似度高,而与母本北区一号的差异显著,并且鲁桑种内各品种间未能完全聚类,品种间的亲缘关系与地理分布位置的距离相关。筛选的15对SRAP引物能够有效地检测供试桑树品种的遗传多样性,揭示品种间的亲缘关系。
关键词： 桑树品种资源 相关序列扩增多态性 遗传多样性 亲缘关系
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山东莲藕(Nelumbo nucifera Gaertn.)种质资源的RAPD鉴定和遗传多样性分析
《分子植物育种 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：山东莲藕(Nelumbo nucifera Gaertn.)栽培历史悠久,在中国北方具有重要影响。但是,山东莲藕种质资源研究一直没有开展。为收集和保存莲藕种质资源,本研究从山东省8个种植面积较大的地区采集了76份莲藕材料,并利用RAPD分子标记对这些材料进行了遗传相似性分析,共鉴定出38份种质资源。遗传多样性指数分析显示,38份种质资源的Nei's多样性指数(H)平均值为0.26,Shannon信息指数(I)平均值为0.41。研究数据表明,山东莲藕种质资源相对丰富,但要建立高质量的种质资源圃,仍需要加强种质资源的引进。
关键词： 莲藕(Nelumbo nucifera Gaertn.) 种质资源 RAPD 分子鉴定 遗传多样性
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黑龙江省野生秋子梨群体遗传结构的荧光AFLP分析
《植物遗传资源学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：以来自黑龙江省海林市、东宁县和孙吴县3个居群的90个野生秋子梨株系为试材,利用荧光AFLP标记技术对野生秋子梨群体遗传多样性及遗传结构进行了分析,旨在为野生秋子梨种质资源的保护和利用提供科学依据。结果表明:野生秋子梨3个居群种群水平多态性位点百分比(P)为82.95%,Nei's基因多样度(H)为0.1467,Shannon信息指数(I)为0.2397,野生秋子梨遗传多样性水平较低;3个居群的多态性位点百分比、基因多样度及Shannon信息指数比较,东宁居群>海林居群>孙吴居群,居群水平上东宁居群的遗传多样性较丰富;基因分化系数(GST=0.1008)显示,野生秋子梨的遗传变异主要发生在居群内;野生秋子梨居群间存在较大的基因流动(Nm=4.4603),说明3个野生秋子梨居群间存在着较频繁的基因交流;UPGMA聚类分析结果表明,3个居群是相对独立的孟德尔群体,且海林居群和东宁居群的遗传关系较近。3个居群中东宁居群遗传多样性最丰富,是进行原生境保护优先考虑的居群。
关键词： 野生秋子梨 荧光AFLP 遗传多样性 群体遗传结构
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麻核桃遗传多样性的SSR分析
《山东农业科学 》 2014
摘要：本试验利用SSR标记技术对20个麻核桃品种的遗传多样性进行研究。从12对引物中筛选出6对用于正式PCR扩增,共检测到52个遗传位点,其中多态性遗传位点50个,多态位点百分率为96%。遗传相似性分析结果显示麻核桃种质间具有丰富的遗传多样性,遗传相似系数变幅为0.17~0.90,说明SSR标记能将20份种质完全区分开。UPGMA聚类结果显示,供试材料在相似系数为0.61处聚为4类。
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平欧杂种榛主栽品种(系)遗传关系的ISSR分析
《植物遗传资源学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：采用ISSR分子标记的方法,对达维、辽榛3号等17个平欧杂种榛主栽品种(系)进行了遗传关系研究。试验从60条ISSR引物中筛选出7条进行电泳分析,使用NTSYS pc 2.11F和Popgene 1.32软件进行数据统计分析并作图。结果显示:7条ISSR引物共获得58条谱带,平均每条引物8.3条谱带,引物平均多态性比率84.6%;7条ISSR引物可将所有样品完全分开,当遗传相似性阈值为0.687时可将样品分成3个类群:第Ⅰ类群14个品种(系)可分成4个亚类,第Ⅱ类群1个品种,第Ⅲ类群2个品系。样品间的遗传相似性系数为0.448~0.879(平均0.678)。群体的有效等位基因数、基因多样度、Shannon信息指数分别为1.6751、0.3701和0.5308。上述结果表明,平欧杂种榛是一个具有高度遗传多样性的群体,主栽品种(系)间存在复杂的亲缘关系。该研究结果对于平欧杂种榛的遗传关系研究具有重要意义,也可为其他榛属植物的相关研究提供参考。
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平欧杂种榛遗传多样性的SSR分析
《中国农学通报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：分析平欧杂种榛间的遗传关系,为遗传图谱的绘制及优良基因的选育奠定基础。该实验选用21份主栽品种,经DNA提取、SSR标记及NTSYSpc(version 2.11 a)对结果的分析建立遗传聚类图。筛选6对欧榛SSR引物对供试材料进行检测,共检测出71个遗传位点,全部为多态性遗传位点,多态位点百分率为100%。遗传相似系数为0.34~0.82,平均相似系数为0.55,当阈值为0.74时,供试样品可聚类分为4个组。C1、C13和C2聚为一组,即组Ⅰ;C6和C15聚为一组,即组Ⅱ;C7、C9、C14、C16和C10聚为一组,即组Ⅳ;其余样品聚为一组,即组Ⅲ。平欧杂种榛品种间具有丰富的遗传多样性,供试主栽品种间存在着复杂的亲缘关系;构建的技术体系可为其他相关试验提供参考。
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不同SSR标记检测技术及其在花生栽培种遗传多样性分析中的应用
《植物遗传资源学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：以85份花生栽培种为材料,分别应用银染法和荧光检测法检测9对SSR引物的扩增产物。比较结果显示,荧光检测法具有灵敏度高、检测结果准确、效率高等优点。聚类分析表明,银染法与荧光检测法分别能够区分74个、82个花生品种,并分别聚成8个、9个类群;荧光检测法的聚类结果虽然反映的品种间遗传多样性较低,但与品种类型、产地及其亲缘关系相关程度更高,表明荧光检测数据更精确、可靠。遗传多样性分析发现,地方品种的遗传多样性指数最高,其次为多粒型育成品种,表明我国地方品种和多粒型育成品种蕴藏了丰富的优异性状,有利于对其挖掘和利用。
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12份樱桃品种遗传多样性的ISSR分析
《山东农业科学 》 2014
摘要：本试验采用ISSR技术对12份樱桃种质资源的遗传多样性进行了研究。筛选出6条ISSR引物对供试材料进行扩增,共检测到48个遗传位点,包含44个多态性位点,多态性位点百分率为91.67%。材料间遗传相似系数为0.29~0.98,平均为0.65。当阈值为0.58时,供试样品可分为3个组,即组Ⅰ、组Ⅱ和组Ⅲ。遗传相似性分析结果显示材料间具有丰富的遗传多样性。
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设施黄瓜新育成品种果实外观品质的遗传多样性分析
《植物遗传资源学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：对我国新育成的不同生态类型的138个设施黄瓜品种的19个果实外观性状进行了调查分析,研究其遗传多样性。结果表明,参试品种质量性状的遗传多样性指数都小于数量性状,不同生态类型黄瓜品种果实外观性状的遗传多样性指数为华北型(1.33)>华南型(1.25)>欧洲温室型(1.0)。质量性状的遗传多样性指数为华南型(0.91)>华北型(0.65)>欧洲温室型(0.48);数量性状的遗传多样性指数为华北型(1.94)>华南型(1.56)>欧洲温室型(1.47)。华南型品种果实数量性状的变异系数均高于华北型和欧洲温室型品种。主坐标轴分析(PCO)将所有种质划分为3个区组,即1区为华北型种质优势区、2区为华北型华南型和欧洲温室型种质混合分布区、3区为华南型种质区。PCO结果表明,1区和2区发生了基因渗透。对交流区域中华北型品种自交分离,后代中出现的稀刺瘤和光皮种质的情况进一步验证了基因渗透的结果。参照育成品种的果实性状信息对黄瓜以后的育种工作提出了建议。
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