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资源类型: 中文期刊
关键词:分子鉴定(模糊匹配)
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山东省临沂地区中草药丹参根结线虫的种类鉴定

土壤与作物 2023

摘要:为了调查山东省临沂地区中草药根结线虫(Meloidogyne spp.)的种类,对临沂地区的蒙阴县和平邑县7个发病丹参田采集丹参样品,并分离线虫,利用根结线虫的通用引物(rDNA-ITS区域194/195)和常见根结线虫种的特异性引物对二龄幼虫进行分子鉴定,对PCR产物及其序列比较分析进而确定线虫种类,同时确定这些线虫能否在番茄上繁殖,然后对确定线虫种类的二龄幼虫形态学和雌虫会阴花纹的特征进行了鉴定。结果表明,rDNA-ITS区域194/195通用引物对所有7个样品都扩增出750 bp产物,证明是根结线虫,序列之间的相似度范围是99.4%~100%;序列特异性引物扩增表明蒙阴县4个样品是花生根结线虫(M. arenaria),2个样品是南方根结线虫(M. incognita),平邑县1个样品是南方根结线虫。序列分别与已报道的花生根结线虫和南方根结线虫100%同源,通用引物扩增产物序列也分别与基因库中这两种线虫序列达到98.3%~100%相似性。所有样品线虫都能在番茄上繁殖,二龄幼虫的形态学特征和雌虫会阴花纹的特征与已鉴定的南方根结线虫和花生根结线虫的特征相同。

关键词: 中草药 丹参 根结线虫 分子鉴定 形态鉴定

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马克斯克鲁维酵母菌的分离鉴定与所产乳糖酶酶学性能研究

山东农业科学 2018

摘要:为研究开发具有应用价值的新型微生物资源,用邻硝基苯酚β-D-半乳糖苷(ONPG)法,从雪莲菌发酵乳中分离到一株产乳糖酶的酵母菌株XL-B36,通过分子鉴定,确定该菌为马克斯克鲁维酵母(Kluyveromyces marxianus).对该菌所产乳糖酶酶学性能进行研究,该酶最适反应温度和最适pH值分别为47℃和7. 0,在35~40℃具有良好的稳定性.pH 5. 0~8. 0表现稳定,pH 7. 0时出现酶活峰值.金属离子Mn2+、Mg2+、Na+对酶活具有激活作用,Ca2+和Zn2+对酶活具有抑制作用,Cu2+和EDTA对酶活具有完全抑制作用.

关键词: 马克斯克鲁维酵母 β-半乳糖苷酶 分子鉴定 酶学性质

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山东省甘薯病毒复合侵染的分子鉴定

山东农业科学 2018

摘要:为明确山东省甘薯病毒种类及发生现状,本研究对7个甘薯种植区进行调查及样品采集,通过RT-PCR/PCR技术分析山东省甘薯病毒种类及侵染类型。结果显示,140份甘薯样品中感染甘薯病毒的样品有133份,共检出7种甘薯病毒,其中甘薯褪绿矮化病毒(Sweet potato chlorotic stunt virus,SPCSV)检出率最高;由多种病毒复合侵染的甘薯样品占77%,单个甘薯样品中最多检出6种病毒,复合侵染组合共33种。表明山东甘薯病毒复合侵染情况严重,是威胁甘薯生产发展的重要因素。

关键词: 甘薯病毒 复合侵染 分子鉴定

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中药材五灵脂特异性PCR鉴别方法的研究

食品与药品 2018

摘要:目的建立快速检测五灵脂中药材动物源性成分的特异性PCR法。方法从NCBI数据库下载复齿鼯鼠及相关混伪品的16S rDNA序列,通过比对获得特异性DNA片段,设计特异引物,从复齿鼯鼠的干燥粪便中提取DNA,优化PCR扩增条件,通过特异性、灵敏度实验验证,建立特异性PCR检测体系。结果 PCR产物经琼脂糖凝胶电泳后扩增出一条340 bp左右条带,而其他样品在相同条件下无扩增条带,该引物的灵敏度可达4.43ng/μl。对15种市售药材的检测结果证明该方法简便可行。结论此PCR法可快速鉴别五灵脂,不受材料和干燥程度的影响,具有操作简便、快速、特异性高的优点。

关键词: 五灵脂 复齿鼯鼠 特异性 PCR 分子鉴定

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山东鲜食葡萄主要类病毒的鉴定及序列分析

果树学报 2018 北大核心 CSCD

摘要:【目的】通过对山东省鲜食葡萄主产区采集的149份疑似感病葡萄叶片进行RT-PCR检测,明确本地区类病毒的发生情况及种类,并进行序列分析。【方法】提取叶片总RNA后,用目前国内报道的葡萄黄斑类病毒1(Grapevine yellow speckle viroid 1,GYSVd1)、葡萄黄斑类病毒2(Grapevine yellow speckle viroid 2,GYSVd2)、澳大利亚葡萄类病毒(Australian grapevine viroid,AGVd)、啤酒花矮化类病毒(Hop stunt viroid,HSVd)和柑橘裂皮类病毒(Citrus exocortis viroid,CEVd)的特异性引物对采集的具有黄化、斑驳、皱缩和畸形症状的葡萄叶片进行RT-PCR检测并测序,同时建立系统进化树。【结果】GYSVd1、GYSVd2、AGVd和HSVd均得到了预期大小的目的片段。测序表明,山东省鲜食葡萄主产区GYSVd1、GYSVd2、AGVd和HSVd的分离物序列与Gen Bank已报道分离物序列一致性均超过90%。【结论】山东省鲜食葡萄主产区受到上述4种类病毒的侵染,并且在自然条件下常发生复合侵染。其中GYSVd2为山东首次报道。

关键词: 鲜食葡萄 类病毒 分子鉴定 序列分析

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马克斯克鲁维酵母菌的分离鉴定与所产乳糖酶酶学性能研究

山东农业科学 2018

摘要:为研究开发具有应用价值的新型微生物资源,用邻硝基苯酚β-D-半乳糖苷(ONPG)法,从雪莲菌发酵乳中分离到一株产乳糖酶的酵母菌株XL-B36,通过分子鉴定,确定该菌为马克斯克鲁维酵母(Kluyveromyces marxianus)。对该菌所产乳糖酶酶学性能进行研究,该酶最适反应温度和最适pH值分别为47℃和7. 0,在35~40℃具有良好的稳定性。pH 5. 0~8. 0表现稳定,pH 7. 0时出现酶活峰值。金属离子Mn2+、Mg2+、Na+对酶活具有激活作用,Ca2+和Zn2+对酶活具有抑制作用,Cu2+和EDTA对酶活具有完全抑制作用。

关键词: 马克斯克鲁维酵母 β-半乳糖苷酶 分子鉴定 酶学性质

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黄蒿丛枝病植原体的鉴定及其16SrDNA序列分析

植物生理学报 2017 北大核心 CSCD

摘要:黄蒿为菊科蒿属一、二年生草本植物,在医学和植物病害生物防治方面具有重要价值。植原体是一类重要的病原物,常引起丛枝、小叶、黄化、簇生等症状。从山东泰山山涧采集到表现丛枝症状的感病黄蒿植株,以叶片总DNA为模板,利用植原体通用引物对R16F2n/R2进行PCR扩增,获得了大小为1 244 bp的片段,与葡萄黄化(Stolbur)植原体(AF248959)和纸花黄化植原体(JX128698)一致性分别为99.4%和99.8%。系统进化树显示,黄蒿丛枝病植原体(登录号:KT899994)与葡萄黄化(Stolbur)植原体(AF248959)和纸花黄化植原体(JX128698)处于同一分支。植原体分类鉴定在线工具i Phy Classifier分析结果显示,所获得的片段与16Sr XII-A亚组代表性植原体(AF248959)相似系数为1.0,表明黄蒿丛枝病植原体归属于16Sr XII-A亚组。利用葡萄黄化(Stolbur)植原体特异性引物对STOL4f/r进行PCR扩增,获得大小为1 754 bp的片段,与葡萄黄化(Stolbur)植原体(AF248959)一致性为99.5%,i Phy Classifier分析结果显示,该片段(登录号:KU759570)与AF248959相似系数为1.0,验证了植原体通用引物对R16F2n/R16R2分析结果的可靠性。综上,将黄蒿丛枝病植原体的分类地位确定为16Sr XII-A亚组。

关键词: 黄蒿丛枝病 葡萄黄化植原体 分子鉴定 16S rDNA序列分析

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凝结芽孢杆菌RY237 β-半乳糖苷酶酶学性质研究

食品工业科技 2017 北大核心 CSCD

摘要:为研究乳品中具有应用价值的乳糖酶,以乳糖为唯一碳源,用邻硝基苯酚-β-D-半乳糖苷(ONPG)法,从产乳酸的细菌中筛选出了产乳糖酶活力高的菌株RY237,其活性达4.98 U/m L,鉴定为凝结芽孢杆菌。研究了乳糖酶的酶学性质,该酶最适反应温度和最适p H分别为50℃和6.0。该酶在温度40~50℃具有良好的稳定性;p H5.5~8.0表现稳定,p H7.0出现酶活峰值。金属离子Ca~(2+)、K+、Zn~(2+)、Mn~(2+)、Na+、Mg~(2+)对酶活具有抑制作用,Cu~(2+)对酶活具有完全抑制作用,EDTA对酶活具有激活作用。凝结芽孢杆菌RY237乳糖酶活性高、性能优良,具有应用价值。

关键词: 凝结芽孢杆菌 分子鉴定 β-半乳糖苷酶 酶学性质

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山东莲藕(Nelumbo nucifera Gaertn.)种质资源的RAPD鉴定和遗传多样性分析

分子植物育种 2015 北大核心 CSCD

摘要:山东莲藕(Nelumbo nucifera Gaertn.)栽培历史悠久,在中国北方具有重要影响。但是,山东莲藕种质资源研究一直没有开展。为收集和保存莲藕种质资源,本研究从山东省8个种植面积较大的地区采集了76份莲藕材料,并利用RAPD分子标记对这些材料进行了遗传相似性分析,共鉴定出38份种质资源。遗传多样性指数分析显示,38份种质资源的Nei's多样性指数(H)平均值为0.26,Shannon信息指数(I)平均值为0.41。研究数据表明,山东莲藕种质资源相对丰富,但要建立高质量的种质资源圃,仍需要加强种质资源的引进。

关键词: 莲藕(Nelumbo nucifera Gaertn.) 种质资源 RAPD 分子鉴定 遗传多样性

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山东不同地区韭菜迟眼蕈蚊共生菌Wolbachia的检测及鉴定

昆虫学报 2015 北大核心 CSCD

摘要:【目的】为了揭示山东省韭菜迟眼蕈蚊Bradysia odoriphaga Yang et Zhang种群共生菌Wolbachia的感染率及其分类地位,探讨该共生菌对韭菜迟眼蕈蚊的潜在影响。【方法】利用线粒体细胞色素氧化酶I(mt COI)基因引物(LCO1490/HCO2198),通过扩增测序和序列比对对采自山东省12个地区的根蛆种群进行了分类鉴定。在上述基础上,利用Wolbachia的16S r DNA和wsp基因特异引物(分别为16S-F/16S-R和81F/691R)对鉴别出的11个韭菜迟眼蕈蚊种群体内Wolbachia感染情况进行了PCR检测;对感染个体体内Wolbachia依据16S r DNA基因片段序列进行分类鉴定。【结果】山东省12个根蛆种群中,11个种群为韭菜迟眼蕈蚊种群。基于Wolbachia的16S r DNA基因特异引物检测结果发现,这些韭菜迟眼蕈蚊种群广泛感染Wolbachia(感染率为6.67%~93.33%),而利用wsp基因特异引物检测的感染率(0.00%~40.00%)相对较低些。基于Wolbachia的16S r DNA基因构建系统发育树表明,这些韭菜迟眼蕈蚊种群感染的Wolbachia全部属于A组。【结论】确定了Wolbachia在山东省韭菜迟眼蕈蚊体内的感染率及其分类地位,为研究Wolbachia对韭菜迟眼蕈蚊生物学及生态学的影响奠定了基础。

关键词: 韭菜迟眼蕈蚊 分子鉴定 Wolbachia 16S rDNA wsp 山东

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