科研产出
1980s-2010s华北夏谷区主栽谷子品种SSR遗传多样性分析
《植物遗传资源学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：通过对20世纪80年代以来具有代表性的华北夏谷区审(鉴)定的20个主栽谷子品种进行SSR标记多态性分析,研究了华北地区育成谷子品种的遗传多样性。49对引物在20个谷子品种中扩增出具有多态性的条带,共检测出142个等位变异,平均每个位点检测出的等位变异数为2.96个。标记位点多态性信息含量(PIC)变幅为0.0904～0.6896,平均为0.4168。20份材料间的遗传距离变幅为0.0173～0.9000,聚类分析将其分成3个类群,其中谷丰1号自成一类,表明谷丰1号的遗传距离较其他品种大。不同年代谷子品种间遗传距离分析结果显示,各年代品种之间的平均遗传距离由大到小依次是1980s>1990s>2000s>2010s,表明随着年代的递进育成品种的遗传差异减小,亲缘关系增近。
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山东省济宁青山羊群体遗传多样性分析
《山东农业科学 》 2019
摘要：为了解近年来山东省对济宁青山羊品种资源保护效果,采用微卫星DNA标记技术,对山东省境内的4个济宁青山羊群体进行了遗传多样性和遗传分化分析.结果显示:24个微卫星位点在4个群体135个个体中共检测到159个等位基因,平均每个位点6.6个;4个群体的PIC在0.6016~0.6653之间,群体的He在0.6750~0.7559之间,但是群体的Ho均低于He,LWQ最低(0.5375),JXQ最高(0.6260);群体分化系数(Fst)为0.0774,基因流(Nm)分析表明每世代4个群体间有效迁移个体数为1.8905;遗传距离和遗传相似性指数分析表明,SXQ、HHQ和JXQ群体间具有较近的亲缘关系,而与LWQ群体间遗传距离相对较远.结果表明:济宁青山羊群体遗传多样性丰富,群体间存在一定的基因交流,遗传分化水平较低,但4个群体都存在不同程度的近交,SXQ和LWQ群体的近交程度较高,所以在实际工作中,应注意扩大群体数量,避免近交衰退.
关键词： 济宁青山羊 微卫星 资源保护 遗传多样性 遗传分化
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采用ISSR和SRAP综合分析灰树花的遗传多样性
《食用菌学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：通过菌丝拮抗实验观察灰树花(Grifola frondosa)菌株间拮抗反应及其类型和程度,采用简单序列重复区间(inter-simple sequence repeat,ISSR)和序列相关扩增多态性(sequence-related amplified polymor-phism,SRAP)分子标记对灰树花基因组DNA进行PCR扩增,对42株灰树花的遗传多样性进行综合分析.结果表明:拮抗实验将42株灰树花分为17组;筛选出的14条ISSR和11对SRAP引物分别扩增出369条和219条清晰条带,多态性条带平均比率分别为84.01%和81.28%;ISSR和SRAP两种分子标记的综合聚类分析结果较单独分析更准确,当遗传相似系数为0.779时,可将42株灰树花划分为6大类群,表明本研究中选取的42株灰树花菌株的遗传多样性丰富,为杂交育种的亲本选择提供了分子水平的依据.
关键词： 灰树花 拮抗反应 简单序列重复区间 序列相关扩增多态性 遗传多样性
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渤海黑牛Y染色体遗传多样性及父系起源研究
《中国牛业科学 》 2018
摘要：[目的]为研究渤海黑牛的遗传多样性、群体遗传结构及父系起源。[方法]采用PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳的方法,利用Y-SNPs和Y-STRs联合标记,对15头纯种渤海黑牛和15头与日本和牛杂交改良的渤海黑牛公牛进行遗传多样性检测。[结果]发现15头纯种渤海黑牛中普通牛Y1单倍型组所占频率为6.67%,普通牛Y2单倍型组所占频率为20.00%,瘤牛Y3单倍型组所占频率为73.33%,单倍型多样度为0.4476±0.1345;15头与日本和牛杂交改良的个体中,Y1单倍型组所占频率为40.00%,Y2单倍型组所占频率为26.67%,Y3单倍型组所占频率为33.33%,单倍型多样度为0.7048±0.0535。结果表明,渤海黑牛群体存在普通牛Y1、Y2和瘤牛Y3三种父系起源,遗传多样性较高。[结论]纯种渤海黑牛的父系以瘤牛为主,同时兼有普通牛Y2的种质特征。
关键词： 渤海黑牛 Y-SNPs Y-STRs 遗传多样性 父系起源
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枣庄黑盖猪与引进猪遗传关系分析
《养猪 》 2018
摘要：枣庄黑盖猪是存养历史悠久的一个山东地方猪群体,对其遗传多样性、群体结构及其杂交特性缺乏了解。研究针对枣庄黑盖猪核心群体,采用Illumina Porcine SNP55芯片检测全基因组范围内SNP遗传标记,分析枣庄黑盖猪的遗传多样性、群体结构及其与山东省主要引进猪之间的遗传关系。研究结果表明:1)枣庄黑盖猪群体内多样性较高,群体内遗传多样性丰富;2)枣庄黑盖猪与5个引进猪种存在大的遗传分化,枣庄黑盖猪与巴克夏猪群体遗传距离和净遗传距离最大,与长白猪的遗传距离和净遗传距离最小;3)群体结构分析表明,枣庄黑盖猪在系统发生树上单独聚类成一个分支,特征性亚群在群体中所占比例为0.826,故枣庄黑盖猪具有自己独特的遗传特征,是一个受引进猪影响较小的地方猪群体。
关键词： 枣庄黑盖猪 基因组SNP标记 遗传多样性 群体结构
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基于SSR标记的132份甘薯种质指纹图谱的构建及遗传多样性分析
《植物遗传资源学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：利用SSR分子标记技术,构建132份甘薯种质的DNA指纹图谱,并进行遗传多样性分析,旨在为甘薯种质资源亲缘关系鉴定、分类提供理论依据。利用筛选的核心引物进行PCR扩增,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测显示,19对引物共扩增出232个条带,其中多态性条带165条,多态性比率为71.1%,平均每对引物扩增出8.68个条带,多态性信息含量变化范围在0.6706~0.9331之间,平均为0.8158;其中引物SSR9和引物C33可将132份种质完全区分开,并构建供试材料的DNA指纹图谱,供试材料遗传距离在0.0363~0.5939之间,平均为0.4087,表明种质资源间遗传多样性丰富。基于SSR标记对供试材料进行聚类分析,将供试材料分为2个类群,第Ⅰ类群分为两个亚类,第Ⅰ-1亚类包括济薯25和3份日本引进品种日本金千贯、安納芋、日本薯;第Ⅰ-2亚类包括济徐薯23、苏丹、济薯09281。第Ⅱ类群分为两个亚类,第Ⅱ-1亚类由S07甘薯品系和与其亲缘关系较近的20份甘薯种质组成;第Ⅱ-2亚类由剩余的70份甘薯种质组成,为甘薯分子辅助育种中亲本的选择提供理论依据。
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26个香菇菌株的遗传多样性分析
《山东农业科学 》 2017
摘要：香菇(Lentinus edodes)是世界上著名的食用菌之一,其菌株种类较多,遗传背景较为复杂。本研究利用ISSR-PCR技术,对26个香菇菌株进行DNA指纹分析,并使用NTSYS-PC软件对其遗传差异性进行聚类分析。结果表明,从106个随机引物中共筛选到9个引物,利用这9个引物对26个香菇菌株的DNA进行ISSR-PCR,检测到124个较为清晰的扩增位点,其扩增片段DNA分子量大小主要介于0.2~4.5 kb之间。通过聚类分析,发现相似水平在55%时出现种系分离;相似水平65%时,26个菌株聚为5个群组。本研究为山东省香菇遗传信息库的建立和遗传育种工作奠定了一定的基础。
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