科研产出
利用AhMITE转座子分子标记研究花生栽培种及高世代材料的亲缘关系
《农业生物技术学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：花生微小倒转重复转座因子(AhMITE)标记是一种基于PCR的分子标记,其在花生中扩增的产物片段差异大,多态性强,带型简单、稳定,重复性好,采用琼脂糖凝胶电泳即可区分。本研究以26份花生栽培品种和89个高世代育种品系为研究材料,通过AhMITE分子标记技术分析其DNA多态性并进行聚类分析。研究共选用了多态性较好的33对AhTE引物,其中31对引物获得了较好的扩增效果,每对引物可扩增1~3条带,在115份材料共扩增产生57条带,其中多态性条带数为54,多态性条带比率为96.49%,115份材料间遗传相似系数平均值为0.6902。在遗传相似系数为0.65时可将所有材料分为3大组,来自同一省份的品种聚为一类,89个高世代品系中来自同一组合的品系优先聚为一类,用于分子标记辅助选育优良品种。本研究结果进一步证实,AhMITE分子标记作为一种新兴的分子标记,具有操作性强、多态性高、带型简单稳定等其它标记无可比拟的优点,可以广泛地用于花生遗传多样性研究、花生品种的鉴定以及花生遗传图谱的构建,并可用于分子标记辅助选育优良品种。
关键词： 花生 微小倒转重复转座因子(AhMITE) 分子标记 遗传多样性
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高油酸含量花生品种的多样性分析
《花生学报 》 2013
摘要：以5个高油酸含量花生品种和1个普通油酸含量花生品种为试材,在调查测定农艺性状、种子脂肪酸含量和SSR引物扩增带型的基础上,分析高油酸含量花生品种的多样性。结果表明,5个高油酸含量的花生品种在主茎高、侧枝长、分枝数、饱果数、百果重和百仁重6个性状方面的差异明显;其油酸含量均在80%以上,而其他七种脂肪酸的含量各有差异;利用12对SSR引物进行PCR扩增分析,共扩增出50条带,其中40条呈现多态,供试品种间的遗传相似系数介于0.325～0.750之间,平均为0.655。聚类分析结果表明,同一育种单位品种间的遗传相似系数较高,首先聚类在一起;国内高油酸含量品种间的遗传基础相近,优先聚为一类;高油酸含量品种与普通油酸含量品种间的遗传相似系数低,最后聚在一起。
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山东牛心柿群体遗传多样性和亲缘关系的SSR分析
《果树学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：【目的】从分子水平了解山东牛心柿群体的遗传结构和亲缘关系。【方法】采用SSR分子标记技术对山东省内的8个牛心柿群体共207个个体进行检测,应用POPGENE 1.31软件进行遗传参数分析,采用AREQUIN 2.0软件对群体间和群体内的遗传变异进行分子变异分析,利用TFPGA软件对Nei’s无偏差预期杂合度和基因分化系数进行了统计计算。【结果】10对SSR引物共检测到128个位点,其中105个位点为多态位点,占82%。Nei’s遗传多样性指数(He)在0.153 8~0.247 6,Shannon信息指数(H0)在0.221 7~0.372 1。群体间的遗传变异占总遗传变异的24.17%(P<0.001),群体间的遗传距离(D<0.231 7)、遗传一致度(I>0.783 2)、基因分化系数(φST=0.222 6)和遗传分化系数(FST=0.175 9)均表明各群体间产生了一定程度的遗传分化。【结论】山东牛心柿群体遗传背景丰富,群体间一定程度的遗传分化可能是人为选择压力所引起。
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鲁棉研系列抗虫棉品种SSR指纹图谱构建及遗传多样性分析
《华北农学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：利用28对SSR核心引物构建了25个鲁棉研系列抗虫棉品种的分子指纹图谱并进行遗传多样性分析。28对核心引物的SSR位点分属21条染色体,等位基因数为2~8个,平均4.39个;PIC值为0.63~0.93,平均0.84。数字指纹图谱显示,最少采用BNL1421、BNL1513、BNL1231、NAU2026和BNL2646这5对引物组合可以将25份供试材料区分开。对其中14个常规品种的遗传多样性分析表明,其遗传相似系数介于0.35~0.87,平均为0.57。此结果可为现阶段鲁棉研系列种质资源的杂交选育提供依据。
关键词： 鲁棉研系列品种 核心引物 SSR指纹图谱 遗传多样性
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中国大豆主产区不同年代大面积种植品种的遗传多样性分析
《作物学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：利用与大豆产量、品质、抗逆性、适应性等重要性状相关的125对SSR标记对中国大豆主产区东北和黄淮海地区自20世纪40年代以来大面积种植的89个大豆品种进行遗传多样性分析。结果表明,自北向南大面积种植品种SSR标记的多态性呈逐渐升高的趋势,黑龙江北部、黑龙江中南部、吉林辽宁地区和黄淮海地区大面积种植品种标记的多态性信息含量(PIC)依次为0.414、0.469、0.522和0.562。除黑龙江北部以外,其余3个地区20世纪80年代以来大面积种植品种的多态性信息含量均比80年代以前种植的品种高。根据Nei和Li提出的遗传相似系数对供试品种进行聚类分析,发现除黄淮海北部地区的冀豆12外,东北和黄淮海地区大面积种植品种各自聚成一类,而在东北地区品种中,吉林辽宁地区和黑龙江地区的品种归属不同亚类,表明同一区域内大面积种植品种的同质化现象相当明显。
应用FISH-AFLP技术分析平欧杂种榛主栽品种的遗传关系
《中国农业科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：【目的】建立平欧杂种榛FISH-AFLP技术体系,并应用该技术分析平欧杂种榛主栽品种的遗传关系。【方法】以达维等10个主栽品种为试材,经DNA提取、PstⅠ/MseⅠ双酶切,进行FISH-AFLP反应,数据转换为"0—1"矩阵后,使用NTSYS pc 2.11F和Popgene 1.32软件进行数据分析并作图。【结果】从64对引物中,筛选出15对多态性强的PstⅠ/MseⅠ引物,共获得1 739条谱带,引物平均多态带比率97.94%;平欧杂种榛主栽品种的相似性系数为0.7556—0.8543,当阈值为0.8398时,可分成4个AFLP群,其中,玉坠(84-310)、辽榛4号(85-41)和平欧69号(84-69)单独为1群,其他品种为1群;平欧杂种榛主栽品种的有效等位基因数、基因多样度、Shannon信息指数分别为1.3921、0.2482和0.3957,具有较高的遗传多样性;研究获得的特征条带可用于平欧杂种榛主栽品种的快速鉴别。【结论】由于平欧杂种榛的实生选优群体是多亲本组合的混合后代,因此,该群体是一个具有高度遗传多样性的群体,主栽品种间存在复杂的亲缘关系;研究构建的FISH-AFLP技术流程、筛选得到的引物以及分析得到的各项遗传参数,可为其他榛属植物的相关研究提供参考。
关键词： 平欧杂种榛 FISH-AFLP 指纹图谱 亲缘关系 遗传多样性
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转Bt基因玉米对根际土壤细菌遗传多样性的影响
《玉米科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：连续两年在田间自然状态下,采用PCR-DGGE方法研究6个不同生育期种植转Bt基因玉米MON810对根际土壤细菌群落遗传多样性的影响。结果表明,2008年,同一生育期内转Bt基因玉米与非Bt基因玉米根际土壤细菌16S rDNA DGGE指纹图谱相似,细菌群落的遗传物质组成差异不显著,仅在抽丝期和乳熟期Bt玉米出现两条差异条带。2009年,苗期、拔节期、喇叭口期、抽雄期4个生育期两种玉米出现差异条带,抽丝期和乳熟期无差异条带。对DGGE图谱条带进行克隆测序,部分图谱中的条带所代表的DNA序列相同,最终得到51条DNA序列,共涉及主要细菌门类8个,典型差异条带分别属于芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)、变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)。总体来看,与不同品种相比,不同生育期、不同年份间细菌群落差异更为显著,Bt蛋白的积累对根际细菌群落变化有一定影响。
关键词： 转Bt基因玉米 根际土壤细菌 PCR-DGGE 遗传多样性
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1950年以来山东省主推小麦品种的遗传多样性演变
《分子植物育种 》 2012 CSCD
摘要：利用24对SSR引物对62个山东省1950年以来大面积推广小麦品种遗传多样性的演变情况进行了分析。结果表明24对引物均有较好的多态性,共扩增到100个等位变异片段(等位基因),平均每个标记获得4.167个等位基因,多态性信息量(PIC)值平均为0.527,变幅0.200～0.723,基因多样性指数变幅0.225～0.761,平均0.582。三个基因组的位点多态性存在明显差异,平均等位变异丰富度D>B>A,基因多样性指数和多态性信息指数B、D基因组接近,并明显高于A基因组。山东省小麦品种平均遗传丰富度、遗传多样性指数和平均遗传距离均以50年代较高(分别为3.042,0.531和0.596),然后缓慢下降,1980年代回升到顶峰(分别为3.250,0.560和0.616),然后迅速下降。62个品种遗传相似系数变幅为0.580～0.940,平均为0.723。按非加权类平均法(UPGMA)、在遗传相似系数0.719处将不同品种聚类成7类,基本与山东省不同时期育种骨干亲本及其衍生品种一致,说明山东省近60年来小麦育种与全国一样,围绕骨干亲本展开。由于特有种质资源的创造和应用,山东省小麦品种遗传多样性高于全国和其他麦区,尤其是1980年代,但之后迅速下降,必须引起足够重视。
关键词： 普通小麦 主推小麦品种 SSR分子标记 遗传多样性 聚类分析 品种演变
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