科研产出
萝卜种质亲缘关系的分子标记分析
《山东农业科学 》 2023 北大核心
摘要：本研究以118个分子标记在108份萝卜种质中进行筛选，得到56个带型清晰、多态性好的标记用于亲缘关系分析。用这56个标记共扩增出130条多态性条带，每个标记2～5条，平均2.3条；观测等位基因数的平均值为2.3214,有效等位基因数的平均值为1.8643,Nei基因多样性指数的平均值为0.4573,Shannon多态性指数的平均值为0.6766,PIC值介于0.29～0.55之间。UPGMA聚类和PCA分析结果较为一致，在遗传相似系数为0.61处可将108份种质分为4大类，黑皮白肉萝卜、樱桃萝卜、心里美类型萝卜种质各聚为一类，其余种质聚为一类，表明萝卜种质亲缘关系与肉质根皮色、肉质色、大小的联系较密切。
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不同月龄鲁西黑头羊瘤胃细菌多样性比较分析
《山东农业科学 》 2023 北大核心
摘要：瘤胃是反刍动物重要的消化器官，瘤胃微生物的组成及其多样性直接关系到反刍动物对饲料的消化利用。本研究通过测定不同月龄鲁西黑头羊瘤胃液微生物菌群多样性及组成结构，探索瘤胃微生物发育规律，为鲁西黑头羊高效饲养提供理论依据。结果表明：（1）Shannon指数和Simpson指数各组之间无显著性差异，ACE指数和Chao 1指数3月龄显著低于6月龄和12月龄；（2）拟杆菌门（Bacteroidetes）和厚壁菌门（Firmicutes）为优势菌门，普雷沃菌属（Prevotella）为瘤胃优势菌属，但各类群丰度在不同月龄间存在显著差异；（3）PCA分析显示，3月龄鲁西黑头羊瘤胃菌群个体间差异较小，6月龄与12月龄明显分离，表明菌群结构差异较大。综上，鲁西黑头羊瘤胃菌群在3月龄时相对稳定，随着月龄的增长，群落丰富度有所提高，表明3月龄时瘤胃功能仍在发育。
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基于SSR标记的山东地方鸡种遗传多样性和群体遗传结构分析
《农业生物技术学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为评估山东省地方鸡(Gallus gallus)种质资源遗传多样性现状,为山东省地方鸡种质资源管理及创新利用提供科学参考依据,本研究利用20对微卫星标记对6个山东省地方鸡种、1个培育品系以及1个省外鸡种共计480个个体进行基因分型,采用软件分析山东省地方鸡种的遗传多样性和群体遗传结构.结果表明,20个多态位点在8个群体中共检测到226个等位基因,平均每个位点11.3个,PIC为0.711.群体平均等位基因为6.625个,观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)和期望杂合度(expected heterozygosity,He)的平均值分别为0.579和0.666.分子方差分析结果显示,8个鸡群体间变异为18%,群体内变异为82%,遗传变异主要来自于群体内不同的个体间.聚类分析和主成分分析(principal coordinates analysis,PCoA)结果具有一致性,8个群体被分为3大类,济宁百日鸡(JB)、莱芜黑鸡(LH)、鲁禽鸡(LQ)、琅琊鸡(LY)、鲁西微型鸡(LL)和寿光鸡(SG)率先聚为一类,石歧杂鸡(SQ)和汶上芦花鸡(WL)均单独聚为一类.研究表明,8个群体均具有丰富的遗传多样性,分类结果与各品种地理位置分布以及相互关系基本一致,本研究为山东省地方鸡种的保护、评价及开发利用提供重要的理论依据.
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黄河三角洲湿地生态退化修复的应用研究进展
《山东科学 》 2023
摘要：系统综述了黄河三角洲湿地生态退化现状及退化原因,并对其生态修复技术进行概括归纳.发现黄河三角洲湿地退化严重,总体面积逐年缩减,同时组成结构发生改变,自然湿地不断减少而人工湿地逐渐增加,景观格局呈现破碎化趋势,生态系统服务功能严重退化.造成黄河三角洲湿地生态退化的原因主要包括黄河水沙通量减少、海-陆交互作用增强、土壤盐渍化加剧、气候暖干化、外来物种入侵和人类活动.目前采用的生态修复技术包括生物组分修复、水体修复、土壤改良和综合生境修复.最后针对性地提出黄河三角洲湿地修复建议,对实践黄河流域生态保护和高质量发展的国家重大战略具有重要意义.
关键词： 黄河三角洲 退化湿地 湿地环境 生物多样性 生态修复 环境污染 海岸景观
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基于SSR标记的石榴品种遗传多样性分析和指纹图谱构建
《山东农业科学 》 2023 北大核心
摘要：为明确国内主产区不同主栽石榴品种的遗传多样性,构建DNA指纹图谱,本研究以 30 个石榴品种为试材,利用琼脂糖凝胶电泳和毛细管电泳筛选多态性引物,建立了石榴品种SSR分子标记鉴定体系,然后利用样品信息与指纹代码配置组合的串联代码,构建了不同石榴品种的DNA指纹图谱.结果表明,从 36 对引物中筛选出扩增产物条带清晰稳定、多态性高的引物 10 对,共检测出 48 个等位基因,平均为4.8个,观察杂合度和期望杂合度平均分别为 0.50 和 0.60,Shannon's 指数和Nei's多样性指数平均分别为 1.11 和 0.59,多态信息含量在 0.33~0.72 之间,平均为 0.53.聚类分析发现,30 个品种被分为 3 组,A组包括 16 个品种,B组包括 8 个品种,C组包括 6 个品种.基于样品、引物和等位基因信息,构建了 30 个品种的特异指纹代码及指纹图谱二维码.本研究结果可为石榴种质资源分子鉴定及开发利用提供理论依据.
关键词： 石榴品种 SSR分子标记 遗传多样性 DNA指纹图谱
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山东省不同地理种群棉铃虫的遗传结构
《植物保护学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为明确棉铃虫Helicoverpa armigera(Hubner)在山东省不同地理种群的遗传分化及遗传多样性,对采集得到的山东省14个棉铃虫种群共109个样本进行线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(mito-chondrial cytochrome oxidase Ⅰ,mt COⅠ)及亚基Ⅱ(mitochondrial cytochrome oxidase Ⅰ,mt COⅡ)基因片段测序,并进行遗传多样性分析,探究其在山东省的种群遗传变异情况.结果表明,棉铃虫mt COⅠ及mt COⅡ基因拼接(1 306 bp)共有18个单倍型Hapl~Hap18,其中Hap2和Hap3单倍型包含的个体数量最多,分别为37个和20个.莱阳种群的单倍型多样性最高,为1.000,莱西种群的核苷酸多态性最高,为0.004 5,14个棉铃虫种群的总体固定系数FST值为0.028,说明棉铃虫种群之间几乎没有遗传分化.GENEPOP分析表明种群间遗传距离和地理距离无显著相关性.表明山东省不同地区棉铃虫遗传分化较低,各地区种群间没有显著的遗传差异.
关键词： 棉铃虫 山东省 地理种群 线粒体基因 遗传多样性 遗传分化
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慢生根瘤菌及其与花生共生机制研究进展
《中国农业科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：氮是植物生长发育所必需的大量元素之一,豆科植物通过与根瘤菌的共生固氮获得氮素.这种共生关系的建立包括结瘤和固氮两个过程,涉及复杂的互作调控机理,并受环境因素的显著影响.花生与慢生根瘤菌的共生对花生生产尤为重要,具有较多特异和未知的共生机制.本文综述了慢生根瘤菌及其与花生共生的相关内容,具体包括:(1)花生的慢生根瘤菌多样性和基因组功能;(2)花生与慢生根瘤菌的共生机制,包括慢生根瘤菌的裂隙侵染及与花生的共生信号交流,花生的结瘤固氮和根瘤数调控机制;(3)田间环境因素(土壤氮素、pH、温度、水分)对花生结瘤固氮及产量的影响.本文从慢生根瘤菌、慢生根瘤菌与花生的共生以及在花生田间的应用三方面指出目前研究中存在的问题主要为:针对花生的慢生根瘤菌基因组功能研究较少、慢生根瘤菌与花生互作调节机理细节未知、慢生根瘤菌菌剂田间应用利用率差等.基于此,未来研究重点应该集中在花生慢生根瘤菌基因组及基因功能分析;慢生根瘤菌与花生的信号交流、根瘤数调节和营养交换机制;与根瘤固氮规律相配合的化学氮肥合理施用技术、通过合成生物学手段获得适用于花生种植的新型根瘤菌剂等方面.本文为深入了解豆科植物与根瘤菌的共生机制、提高豆科作物结瘤固氮效率和产量、减少化学氮肥施用和改善农业生态环境等提供理论基础.
关键词： 慢生根瘤菌 花生 共生固氮 结瘤固氮机制 多样性 环境因素
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油莎豆SRAP-PCR体系优化及遗传多样性分析
《山东农业科学 》 2022 北大核心
摘要：以16份油莎豆种质资源为材料,用改良的CTAB法提取基因组DNA,利用单因素试验和正交试验研究引物浓度、混合酶体积和DNA模板含量3个因素对油莎豆SRAP-PCR扩增结果的影响,以优化其SRAP-PCR体系,并对供试油莎豆种质材料的遗传多样性进行分析.结果表明,混合酶体积对SRAP-PCR反应体系影响最大,引物浓度影响最小;油莎豆SRAP-PCR总体系为15μL时,引物浓度为0.5μmol/L、混合酶体积为10.5μmol/L、DNA模板含量为80 ng的扩增效果最佳.利用最佳扩增体系,从102对引物组合中筛选出30对多态性引物,共扩增出289个多态性位点,平均多态性比率为92.82%.进一步对16份油莎豆种质的遗传多样性进行分析,结果显示其遗传一致度范围为0.60~0.93,遗传距离范围为0.07~0.40,表明供试油莎豆种质资源的遗传背景差异较小;UPGMA聚类结果表明,油莎豆种质资源亲缘关系受油莎豆品种特性和地域的影响.本研究结果可为油莎豆种质资源的多样性评价及鉴定提供方法和技术,并为其遗传育种提供依据.
关键词： 油莎豆 SRAP-PCR 扩增体系优化 遗传多样性
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中国板栗品种(系)DNA指纹图谱构建及其遗传多样性分析
《园艺学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：基于SSR荧光分子标记,对中国342个板栗品种(系)构建了 DNA指纹图谱,并解析了各品种群间的亲缘关系和遗传分化特征.结果表明:(1)所有SSR标记多位点匹配后的PI和PIsibs值分别为4.960×10-20和2.395×10-8,显示本试验所选用的标记指纹识别潜力强;对342份品种(系)构建指纹图谱,共获得338个有唯一对应关系的指纹信息,其中舒城大红袍与焦扎、双合大红袍与CSB-1两两共享了一个指纹信息,结合主要植物学性状,推测其为同物异名品种;同时发现存在大于10个位点信息差异的19份同名资源,判定其为同名异物品种.(2)两两品种群的Fst平均值为0.0224(Fst<0.05),表明品种群间遗传分化程度较低;对5个品种群进行了基因流(Nm)和AMOVA分析,遗传变异主要存在于个体内,占总变异的84%,各品种群间的平均基因流为6.592,表明资源间存在着广泛的基因交换,制约了各群体间的分化.(3)利用位点数据进行群体结构、主坐标和聚类树分析表明,板栗品种资源主要被划分为南、北两大品种群,确定了沿大别山山脉的湖北东北部、河南南部和安徽中北部、以及山东南部和江苏北部地区为分界带(混交地带).
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花生属野生资源基因组大小及遗传多样性分析
《山东农业科学 》 2022 北大核心
摘要：栽培花生是异源四倍体,其遗传背景相对狭窄.花生野生种遗传多样性丰富,利用野生种优异的基因资源是花生遗传改良和突破性品种培育的重要途径.然而,花生野生资源遗传多样性和基因组方面的研究相对滞后,制约了其在花生遗传改良中的应用.本研究利用SSR标记对9个野生近缘种和1个栽培种进行遗传多样性分析和聚类分析,共检测到33个变异位点,变幅为3~6个,平均每个标记4.7个;同时,利用流式细胞仪对4个未知基因组大小的野生花生进行测定,结果显示,A.duranensis(PI sesn2848)、A.cardenasis(PI 262141)、A.batizocoi(Grif15032)、A.monticola(PI 468199)的基因组大小分别为1.26、1.61、1.25、2.78 Gb.本研究结果可为野生花生的鉴定和评价、基因组测序、重要性状的遗传解析及在育种中的应用提供了参考.
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