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资源类型: 中文期刊
关键词:聚类分析(模糊匹配)
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谷子种质资源遗传多样性研究

《山东农业科学 》 2013

摘要:利用谷子基因组序列开发出SSR引物205对,其中171对可以稳定扩增出目的条带,149对有多态性。利用30个多态性SSR标记对41份谷子种质资源进行遗传多样性分析,共检测出291个等位变异,平均每个位点9.7个。谷子地方品种基因多样性指数平均为0.7907,育成品种基因多样性指数平均为0.7571。对41个谷子品种进行聚类,在遗传相似系数为0.164时聚为6组,与生态型基本一致。

关键词: 谷子 SSR标记 遗传多样性 聚类分析

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花生品种耐盐性指标筛选与综合评价

《应用生态学报 》 2013 北大核心 CSCD

摘要:采用盆栽试验,设置不同盐胁迫浓度,通过萌发至幼苗期的出苗速度、植株形态和生物量等指标对200个花生品种(系)进行耐盐性评价.结果表明:随盐胁迫浓度的增加,花生出苗时间延长,对植株形态建成抑制加重,物质积累减少.鉴定花生品种耐盐性强弱的适宜盐胁迫浓度为0.30%~0.45%.采用隶属函数值法将10个指标归结为平均隶属函数值,根据不同胁迫浓度下各指标与平均隶属函数值之间的相关性大小,植株鲜质量、地上部鲜质量、地下部鲜质量、地下部干质量、株高和主茎高均较大,可作为首选指标,植株干质量、地上部干质量、主根长和出苗速率均较小,可作为辅助指标综合判断品种的耐盐能力.200个品种(系)在不同盐胁迫浓度下均可分成高度耐盐型、耐盐型、盐敏感型和高度盐敏感型4组.随盐胁迫强度加大,耐盐品种数量下降,而盐敏感品种数量上升.部分品种在低、中、高盐胁迫强度下表现出统一性(均耐盐或均敏感);部分品种存在差异性,即低胁迫强度下表现耐盐性而在高胁迫强度下表现盐敏感性.

关键词: 花生 盐胁迫 耐盐指标 隶属函数 聚类分析

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山东牛心柿群体遗传多样性和亲缘关系的SSR分析

《果树学报 》 2013 北大核心 CSCD

摘要:【目的】从分子水平了解山东牛心柿群体的遗传结构和亲缘关系。【方法】采用SSR分子标记技术对山东省内的8个牛心柿群体共207个个体进行检测,应用POPGENE 1.31软件进行遗传参数分析,采用AREQUIN 2.0软件对群体间和群体内的遗传变异进行分子变异分析,利用TFPGA软件对Nei’s无偏差预期杂合度和基因分化系数进行了统计计算。【结果】10对SSR引物共检测到128个位点,其中105个位点为多态位点,占82%。Nei’s遗传多样性指数(He)在0.153 8~0.247 6,Shannon信息指数(H0)在0.221 7~0.372 1。群体间的遗传变异占总遗传变异的24.17%(P<0.001),群体间的遗传距离(D<0.231 7)、遗传一致度(I>0.783 2)、基因分化系数(φST=0.222 6)和遗传分化系数(FST=0.175 9)均表明各群体间产生了一定程度的遗传分化。【结论】山东牛心柿群体遗传背景丰富,群体间一定程度的遗传分化可能是人为选择压力所引起。

关键词: 牛心柿 SSR 遗传多样性 聚类分析

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采用穗部形态性状和SSR标记研究粳稻穗型分类

《山东农业科学 》 2013

摘要:利用离差平方和法(Ward's)对36个粳稻品种穗部性状进行聚类分析,结果表明,36个品种可分为紧穗型、中间穗型和散穗型三类.利用分布于水稻12条染色体上具有丰富多态性的28对SSR引物对36个水稻品种进行PCR扩增分析,共检测到76个等位基因变异,每一个位点上检测到的等位变异数为2~9个,平均为2.71个.根据扩增结果可以将36个品种相互区分.供试品种间的遗传相似系数值为0.5758~0.9783,平均为0.8042,遗传相似性变化较大.根据非加权平均数方法(UPGMA)聚类分析结果,供试品种可聚为三大类群,其中第一个类群进一步可分为3个亚类.两种聚类结果表明:利用SSR标记的遗传相似系数进行聚类,与利用水稻穗部性状进行聚类,在亚类水平上,有一定程度的吻合.遗传距离矩阵和形态性状的欧氏距离矩阵的Mantel检验表明,二者存在显著的相关性.

关键词: 粳稻 穗型 穗部性状 SSR标记 聚类分析

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花生萌发至苗期耐盐胁迫的基因型差异

《植物生态学报 》 2013 北大核心 CSCD

摘要:采用盆栽试验,设置0、0.15%、0.30%和0.45%等4个浓度的盐胁迫,通过出苗速度、植株形态和生物量等指标研究不同基因型花生(Arachis hypogaea)品种(系)萌发至幼苗期的耐盐性差异。结果表明,各浓度盐胁迫下,相对出苗时间、相对株高、相对主茎高、相对主根长、相对地上部鲜质量、相对地下部鲜质量、相对植株鲜质量、相对地上部干质量、相对地下部干质量和相对植株干质量等10个指标耐盐指数品种间呈正态分布,变异较大。主成分分析将10个指标归结为不相关的独立因子,采用综合得分将107个品种(系)聚类为高度耐盐型、耐盐型、盐敏感型和高度盐敏感型4组,0.15%浓度下4个类型品种数分别占供试材料的45.79%、39.25%、7.48%和7.48%;0.30%浓度下4个类型品种(系)数分别占供试材料的11.21%、47.66%、22.43%和18.69%;0.45%浓度下4个类型品种(系)数分别占供试材料的6.54%、23.36%、50.47%和19.63%。部分品种(系)在各强度盐胁迫下均表现为耐盐或盐敏感,部分品种(系)在低强度胁迫下表现为耐盐,而在高强度胁迫下表现为盐敏感。3个浓度盐胁迫下高度耐盐型、耐盐型、盐敏感型和盐高度敏感型分组一致的品种(系)分别有1个(‘阜花11’)、7个(‘花育28’、‘Z11’、‘花育39’、‘花育32’、‘HLN2’、‘粤油26’、‘XE019’)、0个和1个(‘D1035’)。盐胁迫下,不同耐盐类型花生品种(系)出苗时间、植株形态和生物量等10个指标间差异达显著或极显著水平,盐敏感类型比耐盐类型品种(系)出苗时间延长,植株形态建成抑制加重,物质积累减少。

关键词: 花生 聚类分析 基因型 主成分分析 盐胁迫

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大丽花品种数量分类研究

《山东农业科学 》 2012

摘要:对52个大丽花品种的20个形态学特征进行Q型聚类分析。结果表明:株高应作为大丽花分类的一级标准,依此标准可将大丽花分为两大类;花径应作为大丽花分类的二级标准;叶片大小、花瓣大小和花瓣多少作为大丽花品种分类的三级标准。

关键词: 大丽花 品种 聚类分析 主成分分析

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1950年以来山东省主推小麦品种的遗传多样性演变

《分子植物育种 》 2012 CSCD

摘要:利用24对SSR引物对62个山东省1950年以来大面积推广小麦品种遗传多样性的演变情况进行了分析。结果表明24对引物均有较好的多态性,共扩增到100个等位变异片段(等位基因),平均每个标记获得4.167个等位基因,多态性信息量(PIC)值平均为0.527,变幅0.200~0.723,基因多样性指数变幅0.225~0.761,平均0.582。三个基因组的位点多态性存在明显差异,平均等位变异丰富度D>B>A,基因多样性指数和多态性信息指数B、D基因组接近,并明显高于A基因组。山东省小麦品种平均遗传丰富度、遗传多样性指数和平均遗传距离均以50年代较高(分别为3.042,0.531和0.596),然后缓慢下降,1980年代回升到顶峰(分别为3.250,0.560和0.616),然后迅速下降。62个品种遗传相似系数变幅为0.580~0.940,平均为0.723。按非加权类平均法(UPGMA)、在遗传相似系数0.719处将不同品种聚类成7类,基本与山东省不同时期育种骨干亲本及其衍生品种一致,说明山东省近60年来小麦育种与全国一样,围绕骨干亲本展开。由于特有种质资源的创造和应用,山东省小麦品种遗传多样性高于全国和其他麦区,尤其是1980年代,但之后迅速下降,必须引起足够重视。

关键词: 普通小麦 主推小麦品种 SSR分子标记 遗传多样性 聚类分析 品种演变

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利用SSR分子标记分析辽宁花生种质资源的遗传多态性

《花生学报 》 2012

摘要:首次报道了利用SSR标记对辽宁花生种质资源进行遗传多样性分析的效果。结果表明,10对引物在32份花生种质资源中共扩增出67条带,其中18条呈现多态性,多态性比率为26.9%,很好地揭示了辽宁地区花生种质资源之间的遗传差异,为今后花生新品种选育提供了依据。

关键词: 花生 SSR标记 聚类分析

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鲁麦14对山东新选育小麦品种的遗传贡献

《作物学报 》 2012 北大核心 CSCD

摘要:为了解骨干亲本鲁麦14对山东新选育小麦品种的遗传贡献,对鲁麦14及其6个衍生品种(系)进行了全基因组SSR扫描分析。在350个SSR位点上共检测到662个等位变异,每个位点1~5个等位变异,平均1.9个,位点平均多态性指数(PIC)为0.21。UPGMA聚类分析表明,济麦22和鲁麦14聚为一类、青丰系列4个品种(系)聚为一类,这两类形成一个大的分支,而济麦20与这些品种的关系较远。在所检测的350个位点中,与鲁麦14相同的位点数,济麦22有235个(67.1%),济麦20有210个(60.0%),青丰1号有229个(65.4%),青农2号有247个(70.6%)。这些相同位点多数以一个大的染色体区段传递至子代,且有的区段在6个衍生品种(系)中共享,如5A的gwm304-barc360-gwm415-barc1区段和6D的barc196-gdm127-barc123区段等。济麦22在21条染色体上都有与鲁麦14相同的位点,但染色体间差异较大,相同位点比例超过70%的染色体有3A、4A、7A,2B、4B、7B、1D、3D和4D;相同位点比例最低的是3B,仅46%。同一连锁群上,位点之间多呈连续区段分布,大多与已发现的重要性状分布簇相吻合。因此认为,鲁麦14的优良遗传背景对济麦22有重要贡献。在育种实践中,除需关注重要基因的导入外,还应注意骨干材料主体背景的选择。

关键词: 鲁麦14 济麦22 SSR标记 聚类分析 遗传贡献

应用RAPD和ISSR标记对24份花生栽培种材料进行遗传多样性分析

《广西植物 》 2011 北大核心 CSCD

摘要:利用RAPD引物和ISSR引物分析我国24份花生栽培种材料的遗传多样性。结果表明:所选的RAPD引物和ISSR引物中分别有13条引物和10条引物扩增出了清晰并可重复的条带,共扩增出123条带和87条带,平均每条引物扩增出9.5条带和8.7条带,其中多态性带分别占条带总数的47.15%和57.47%,平均每条引物扩增出4.7条和5.7条多态性带。在此基础上,根据Nei-Li系数采用UPGMA法进行了聚类分析,可将24份花生材料分成4类:四粒红、汕油523、冀花2号、花育16和粤油7号等5个品种聚为一类;花育20、中花8号聚为一类;黑花生单独为一类;其余的花生聚为一类。RAPD和ISSR标记能够揭示花生栽培种的遗传多样性,在种质鉴定和遗传作图等方面具有一定应用潜力。

关键词: 花生 RAPD ISSR 聚类分析 遗传多样性

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