科研产出
我国部分地区1996～2008年传染性支气管炎病毒分离株膜蛋白基因的遗传变异与系统进化分析
《中国动物传染病学报 》 2009
摘要：1996~2008年从我国不同地区分离30株传染性支气管炎病毒(Infectious Bronchitis Viruses,IBV)野毒株的M基因,采用RT-PCR方法克隆测定所分离的野毒株和澳大利亚T株的M基因序列,利用生物信息学软件与GenBank中公布的部分国内外IBV毒株的M基因序列进行比较分析,研究我国IBV的分子流行学特点和分子遗传变异规律。结果发现所测毒株M基因具有4种不同长度的开放阅读框:669bp、672bp、678bp和681bp,分别编码222、223、225和226个氨基酸的多肽,这些长度的差异是由5′端的核苷酸插入或缺失造成的。30个IBV分离株间的同源性在89.5%~100%之间。以疫苗株H120氨基酸位置为参照,在被比较的73株IBV M蛋白中发现62个位点存在变异,其中以2~5、10~16、44~46、217~222等4个区域氨基酸取代率较高。系统进化分析显示,被比较的73个IBV毒株分为5个进化群,我国的IBV分属于其中的4个群,其中第一群和第四群与我国所使用的疫苗病毒株相距较远。同时发现部分近年的分离株与10多年前分离株具有很近遗传进化关系。从M基因看,在我国出现了多种基因型IBV共存的现象,分离株与疫苗株的遗传差异提示我们需要对疫苗的选用做出重新评估。
关键词： 传染性支气管炎病毒 膜蛋白基因 分子流行病学 遗传变异
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鸡传染性支气管炎病毒S1和N基因遗传变异的相关性
《中国兽医学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：对国内1992—2005年分离的IBV毒株的纤突蛋白(S1)和核衣壳蛋白(N)基因分别进行克隆测序,结合在GenBank中发表的IBV S1和N基因的序列,对其不同毒株的S1或N基因片段和全长、S1和N基因全长分别进行遗传变异的研究,利用统计学软件SPSS11.5进行同源性相关分析。结果表明:不同IBV毒株N或S1基因片段与其全长之间遗传变异高度相关,核苷酸r≥0.892,氨基酸0.854≤r≤0.968;但S1与N基因全长之间核苷酸的遗传变异相关性相对较低一些,而且有些毒株间S1基因同源性很低(r=0.645),但N基因同源性仍很高,显示每个基因变异的独立性。国内IBV疫苗株之间S1和N基因核苷酸高度同源(S1≥97.3%;N≥90.7%),而野毒株与疫苗株相比S1和N基因同源性均较低(S1≤84.3%;N≤87.1%),这也可能与常规疫苗对IBV野毒株不能有效保护有关。
关键词： 鸡传染性支气管炎病毒 S1基因 N基因 同源性 遗传变异
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新城疫分离毒HN基因的分子特性和片段同源相关性
《病毒学报 》 2007 北大核心 CSCD
摘要：选取国内1997-2005年分离的新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)24株,经蚀斑纯化克隆其血凝素-神经氨酸酶(HN)基因,与在GenBank发表的36株国内外不同时期的NDV毒株,进行氨基酸遗传变异分析,并利用SPSS8.0软件对其不同片段的氨基酸进行同源相关比较。结果显示:国内所有NDV分离毒株氨基酸高度同源,同源性为94.4%-99.4%;与LaSota、Clone30疫苗株等的氨基酸同源性为86.9%-89%;与强毒株F48E9的氨基酸同源性为87.9%-89.9%;与国外NDV的氨基酸同源性为87.2%-96.2%。系统发育分析表明:国内NDV分离毒HN遗传距离较近,而与LaSota、Clone30和F48E9遗传距离较远。国内NDV分离毒均缺乏538-540位糖基化位点。不同片段与全长的氨基酸同源性高度相关,且与前80个氨基酸相关最密切。
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新城疫病毒HN和F基因遗传变异相关性的研究
《微生物学报 》 2006 北大核心 CSCD
摘要：选取国内1999~2005年发生的NDV毒株,经CEF蚀斑纯化和SPF鸡胚增殖,对其融合蛋白(F)和血凝素-神经氨酸酶(HN)基因分别进行克隆测序,结合在GenBank中发表的具有F和HN基因的NDV序列,利用DNAStar软件,对其不同毒株的F或HN基因片段和全长、F和HN基因全长分别进行遗传变异的研究,利用统计学软件SPSS8.0进行同源性相关分析。结果表明:不同NDV毒株F或HN基因片段与其全长之间,核甘酸r≥0.973,氨基酸:0.911≤r≤0.968,遗传变异高度相关,但F与HN基因全长之间核甘酸的遗传变异呈现弱相关(r=0.312)。国内NDV野毒株之间HN核甘酸高度同源(同源率97%以上),而与La Sota同源率仅为79.2%~80.7%,且显示出明显的地域性。
关键词： 新城疫病毒 F基因 HN基因 同源性 遗传变异 相关性
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山东省小麦品种高分子量谷蛋白亚基遗传变异分析
《山东农业科学 》 2002
摘要：对山东省 2 0世纪 6 0年代以来育成推广的 6 0个小麦品种的高分子量谷蛋白亚基的遗传变异进行了分析 ,并分析了亚基和面粉品质的关系。结果表明 :在所研究的小麦品种中 ,Glu -1位点具有较丰富的遗传变异类型 ,共有 1 3种亚基类型和 2 2种亚基组成模式。各亚基出现频率不尽相同 ,A1位点上的 1亚基出现频率为 5 0 0 % ,B1位点上 7+ 8亚基出现频率为 4 8 3% ,D1位点上 2 + 1 2亚基出现频率为 6 5 0 %。亚基 1 ,2+ 1 2 ,7+ 8模式出现频率最高 ,同时出现了含有 2 + 1 0亚基的新的亚基组成模式。优质亚基 5 + 1 0仅在 80年代以后选育推广的小麦品种中存在 ,且 5 + 1 0亚基出现频率和高分子量谷蛋白亚基品质评分均呈现上升趋势。亚基 7+ 9、1 3+ 1 6、5 + 1 0均对沉降值和谷蛋白大聚体 (GMP)含量有显著的正向作用
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不同品系家兔的RAPD遗传分析
《中国养兔 》 2000
摘要：应用随机扩增多态 DNA技术 ( RAPD)对新西兰白兔、加利福尼亚兔、布列塔尼亚配套系( ELCO)进行了遗传分析。从 2 0个随机引物中筛选出 8个 ,对其基因组 DNA进行 PCR扩增 ,对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳 ,共检测到 71条扩增片段 ,其中多态片段 45条 ,占 63.4%,反映了家兔品种的遗传变异。多态性统计表明 :品种内的遗传相似度大于品种间的遗传相似度。聚类分析表明 :ELCO的 D系与新西兰白兔、加利福尼亚兔的亲缘关系较近 ,聚为一个类群 ;ELCO的 A系与B系亲缘关系较近 ,聚为一个类群
利用大豆硬实种子保存大豆种质的研究
《大豆科学 》 1999 北大核心 CSCD
摘要：大豆硬实种子与正常种子在室温下保存，正常种子２ 年左右的时间即失去生命力，硬实种子保存４ 年发芽率仍在９０％ 以上。硬实种子的后代与正常种子后代性状一致，说明硬实种子未发生遗传变异。这就使硬实种子在大豆种质保存中应用成为可能。
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夏大豆粒茎比值的高产效应及其遗传变异的研究
《作物学报 》 1992 北大核心 CSCD
摘要：高产品种诸多经济性状的量值都有不同程度的增长,其中以节荚数和粒茎比值增量最大。其形态性状株型向矮壮紧凑型变迁。粒茎比值高、茎重适宜、光效高才是高产品种的重要特点。 F_2代粒茎比值呈连续遗传变异,组合发生正负向超亲变异机率较高为60％,个体发生正负向超亲变异机率极低,其中正向仅0.98％。亲本对F_2代粒茎比值有较大影响,有倾大值和小值亲本两种遗传倾向,但以倾小值亲本为主要遗传变异特征。 粒茎比值与诸多的经济性状,形态性状为相互联系互为制约关系,对株粒重有较大的增量效应。粒茎比值遗传力较低,均值为43.13％。个体正向超亲变异机率又极低,表明通过选育粒茎比值高,综合性状又优良进而增加产量是一件难度很大的工作,但是经过努力是可以办到的。
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