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新城疫分离毒HN基因的分子特性和片段同源相关性

文献类型: 中文期刊

作者: 秦卓明 1 ; 马保臣 2 ; 袁小远 1 ; 徐怀英 1 ; 何叶峰 1 ; 崔治中 2 ;

作者机构: 1.山东农业科学院家禽研究所

2.山东农业大学动物科技学院

关键词: 新城疫病毒;HN基因;氨基酸;遗传变异;相关性

期刊名称: 病毒学报

ISSN: 1000-8721

年卷期: 2007 年 23 卷 01 期

页码: 39-45

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 选取国内1997-2005年分离的新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)24株,经蚀斑纯化克隆其血凝素-神经氨酸酶(HN)基因,与在GenBank发表的36株国内外不同时期的NDV毒株,进行氨基酸遗传变异分析,并利用SPSS8.0软件对其不同片段的氨基酸进行同源相关比较。结果显示:国内所有NDV分离毒株氨基酸高度同源,同源性为94.4%-99.4%;与LaSota、Clone30疫苗株等的氨基酸同源性为86.9%-89%;与强毒株F48E9的氨基酸同源性为87.9%-89.9%;与国外NDV的氨基酸同源性为87.2%-96.2%。系统发育分析表明:国内NDV分离毒HN遗传距离较近,而与LaSota、Clone30和F48E9遗传距离较远。国内NDV分离毒均缺乏538-540位糖基化位点。不同片段与全长的氨基酸同源性高度相关,且与前80个氨基酸相关最密切。

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