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资源类型: 中文期刊
关键词:多态性(模糊匹配)
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大白菜EST-SSR标记开发中非SSR标记的鉴别

《山东农业科学 》 2010

摘要:EST-SSR标记开发过程中经常会遇到一些问题,例如引物重复设计等。本试验对从大白菜EST序列中开发的30个多态性SSR标记产生的多态性条带进行测序,结果发现有一些标记的多态性并不是由于其所含有的简单重复序列重复次数的改变引起的,这类标记约占鉴定标记总数的13%。这些标记实际上属于EST-SCAR标记。在进行SSR变异对基因表达及功能影响方面的研究时,这类非SSR标记应该被排除。

关键词: EST-SSR 标记开发 多态性 测序 大白菜

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中国荷斯坦牛HSP70基因3'-非翻译区多态性与耐热性的关联分析

《华北农学报 》 2010 北大核心 CSCD

摘要:用PCR-SSCP和测序技术研究了541头中国荷斯坦奶牛热休克蛋白70(HSP70)基因的3'-非翻译区的多态性,并研究了多态性对奶牛产奶性状和耐热性状的影响。设计引物扩增片段大小549 bp,通过PCR-SSCP技术发现参与试验的奶牛出现了3个复等位基因:A、B和C,6种基因型:AA、AB、AC、BB、BC和CC基因型。测序发现复等位基因是由3个新的突变引起的,第6 400、6 600和6 601位碱基分别发生了G/C、C/T和G/A突变。χ2适合性检验表明,该群体在这三个位点的突变没有达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.01)。中国荷斯坦牛BB基因型个体红细胞钾含量和产奶量下降率显著低于其他基因型个体(P<0.05),表明BB型的中国荷斯坦牛耐热性能优于其他类型。BB基因型个体305 d产奶量高于其他5种基因型的个体,进一步说明BB基因型可能在选育高产抗热应激奶牛中得到应用。

关键词: 荷斯坦奶牛 HSP70基因 多态性 热应激 PCR-SSCP

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补体C3基因多态性与相关疾病研究进展

《家畜生态学报 》 2010

摘要:在补体各成分中,补体第三组分(C3)在血清中含量最高,是补体系统的核心。C3在功能上不仅处于补体经典途径、甘露糖结合凝集素途径和补体旁路途径三条激活途径的汇合点,还是C3b依赖的阳性反馈环路的基础;而且C3裂解片段及其结合蛋白复杂多样,在免疫防御、免疫调控以及免疫病理中发挥着重要的作用。当C3基因发生突变或缺失时会造成C3缺陷性疾病,常伴发免疫性疾病及反复细菌感染,患者对病原菌感染的易感性显著增加。论文概述了C3基因结构及其多态性以及其与机体易感性的关联性。

关键词: C3 多态性 免疫缺陷性疾病 易感性

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荷斯坦奶牛热休克蛋白70基因3'-侧翼区遗传变异与耐热性的关系

《农业生物技术学报 》 2010 北大核心 CSCD

摘要:本实验采用PCR-SSCP和测序技术对荷斯坦奶牛和鲁西黄牛两个群体共673个个体热休克蛋白70基因(HSP70)的3'-侧翼区的遗传变异,及该突变对奶牛产奶性状和耐热性状的影响进行研究。研究结果表明设计引物扩增片段大小500bp,扩增产物具有多态性。供试的72头鲁西黄牛和601头荷斯坦奶牛均发现3种基因型,为AA、AB和BB型。测序分析发现热休克蛋白70基因(HSP70)的3'-侧翼区存在1个新突变,T→C。关联分析结果表明,BB基因型荷斯坦奶牛个体,乳脂率、乳蛋白率和305d产奶量,相对于AA基因型的个体都要高;红细胞钾含量和产奶量下降率比AA类型个体要低,且达显著水平(P<0.05)。鲁西黄牛B基因基因频率为74.31%,而荷斯坦奶牛B基因基因频率却比较低,为14.89%。由于鲁西黄牛耐热性显著强于荷斯坦奶牛,且耐热性最高的BB型奶牛产奶量下降率显著低于耐热性差的AA型奶牛。等位基因B可作为选育抗热应激奶牛潜在的分子遗传标记。

关键词: 荷斯坦奶牛 热休克蛋白70基因(HSP70) 多态性 热应激

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中国荷斯坦牛κ-酪蛋白基因第4和第5外显子多态性与泌乳性状的关联分析

《中国农业科学 》 2009 北大核心 CSCD

摘要:【目的】研究中国荷斯坦牛κ-酪蛋白基因第4和第5外显子多态性与泌乳性状的关联性,为培育高乳蛋白及高乳脂率奶牛提供参考依据。【方法】采用DNA测序、PCR-RFLP和CRS-PCR技术,对544头中国荷斯坦牛κ-酪蛋白基因的外显子4和5序列进行研究,通过SHEsis软件和PHASE软件进行配对连锁不平衡分析和单倍型分析。【结果】发现6个新的SNPs,包括外显子5上A12907G、G12950A、C12989T、A13028G、T12980C共5个SNP位点,证实前4个位点紧密连锁;外显子4上A10996T共1个SNP位点。单位点基因型与泌乳性状关联分析表明,A10996T突变位点的TT和AT基因型个体乳脂率显著高于AA基因型个体(P<0.05);T12980C突变位点的TC和CC基因型个体乳脂率、乳蛋白率分别极显著(P<0.01)、显著(P<0.05)高于TT基因型个体;紧密连锁的4个突变位点的DE基因型个体乳脂率极显著高于DD基因型个体(P<0.01)。与泌乳性状的关联分析表明,共构建出7种单倍型,发现16种单倍型组合;其中H6H6单倍型组合个体乳脂率最高,H1H4次之;H1H4单倍型组合个体乳蛋白率最高;H5H6单倍型组合个体乳蛋白率及乳脂率最低。【结论】H1H4单倍型组合在乳蛋白率和乳脂率方面为有利单倍型组合,可作为选择高乳蛋白高乳脂率牛群的分子标记。

关键词: 中国荷斯坦牛 κ-酪蛋白基因 多态性 泌乳性状 单倍型

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牛α1-抗胰蛋白酶基因5′侧翼区新SNP的鉴定及其与中国荷斯坦奶牛产奶性状的相关性

《中国生物化学与分子生物学报 》 2009 北大核心 CSCD

摘要:以中国荷斯坦奶牛(Chinese Holstein dairy cattle)为对象,以α1-抗胰蛋白酶基因(α1-AT)为候选基因,扩增5′侧翼区668 bp和999 bp的片段并进行测序.首次发现,在+3 142 bp处P1和+4 408 bp处P2分别发生C-T、T-C突变.随后采用PCR-RFLP方法对随机采自6个牛场,共计294头牛进行了检测,遗传变异和产奶性状分析结果显示:2个位点的等位基因在群体中都有分布,且处于中度多态.P1位点A和B等位基因的频率分别为50.34%和49.66%;AA、AB和BB基因型频率分别为23.81%、53.06%和23.13%;P2位点E和F等位基因的频率分别为30.61%和69.39%,EE、EF和FF基因型频率分别为11.90%、37.41%和50.68%.χ2适合性检验表明,该群体在P1位点的突变达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),在P2位点未达到平衡.基因与产奶性状关联分析表明,AB基因型个体产奶量与脂蛋比显著高于AA基因型个体(P<0.05);FF基因型个体乳蛋白率显著高于EF基因型个体(P<0.05);9种单倍型组合与乳脂率、乳蛋白率、体细胞数、产奶量及脂蛋比均存在不同程度相关性.

关键词: α1-抗胰蛋白酶基因 多态性 PCR-RFLP 产奶性状 中国荷斯坦奶牛

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hsp70基因编码区一新SNP的发现及其多态性与热应激性状的相关性研究(英文)

《中国农业科技导报 》 2009

摘要:为了探索hsp70基因多态性与热应激性状(直肠温度和红细胞钾含量)的相关性,利用PCR-SSCP方法检测290头中国荷斯坦奶牛hsp70基因的未知SNP,并利用PCR-RFLP方法对基因进行分型,采用SBYE荧光定量PCR方法检测不同组织中hsp70mRNA表达水平。结果显示,在1524位点发现一个G/A突变,有两种基因型(AA/AB),基因频率和基因型频率分别是0.9570,0.0430和0.9137,0.0863,卡方检验该群体处于哈迪-温伯格平衡。相关性分析结果表明,AA、AB基因型的直肠温度没有显著差异,但在红细胞钾含量中有极显著差异。肝脏中hsp70mRNA表达水平显著高于其他组织。推测hsp70基因1524位点的G/A SNP与中国荷斯坦奶牛热应激有关。

关键词: 热休克蛋白70 多态性 热应激 荧光定量PCR 荷斯坦奶牛

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大豆抗烟粉虱基因SSR分子标记的引物筛选

《湖北农业科学 》 2009 北大核心 CSCD

摘要:烟粉虱是近年发展起来的灾害性农业害虫,具有危害范围广、危害程度重、防治难度大等特点。烟粉虱对大豆的危害十分严重。试验进行了多次PCR扩增,在PCR扩增的基础上比较了大豆基因组总DNA提取方法的优劣,初步探索了退火温度对PCR扩增结果的影响。研究表明,在615对大豆SSR引物中能够有效扩增的有318对,161对有多态性。这些多态性引物的获得将为大豆抗烟粉虱的分子基础研究提供参考。

关键词: 烟粉虱 多态性 SSR分子标记

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甘露糖结合凝集素基因的研究进展

《中国畜牧兽医 》 2009 北大核心

摘要:疾病是影响畜牧业生产的主要因素,虽然传统的疾病控制方法对疾病的预防和治疗起到了重要作用,但随着分子生物学和基因工程技术的发展,分析在抗性和易感群体中候选基因的标记等位基因频率差异,结合遗传育种技术,提高家畜的抗病性与健康水平已成为当今提高家畜生产水平的重要途径。甘露糖结合凝集素(mannan-binding lectins,MBL)是构成人和动物血清补体凝集素途径的主要成分,在先天免疫过程中起重要作用。笔者简述了MBL的分布、结构、功能,介绍了MBL基因与抗病力的关系,对其作为家畜抗病育种遗传标记的应用前景进行了展望。期望MBL作为遗传标记,通过标记辅助选择进行抗病育种可以培育出抗病力强的家畜品种。

关键词: 甘露糖结合凝集素 生物学功能 多态性 抗病育种

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荷斯坦牛κ-酪蛋白基因两SNPs位点基因型组合对产奶性状的影响

《农业生物技术学报 》 2009 北大核心 CSCD

摘要:采用PCR-RFLP、CRS-PCR和DNA测序技术,对435头荷斯坦牛的κ-酪蛋白基因的外显子4和5上2个单核苷酸多态性(SNP)位点进行了研究。结果发现,在435头牛群中,共有8种基因型组合。单个SNP位点关联分析表明:T10996A突变位点3种基因型间TA基因型个体乳脂率极显著高于AA基因型个体(P<0.01),TA基因型个体乳蛋白率显著高于AA基因型个体(P<0.05)。T12980C突变位点的3种基因型间TC基因型个体乳脂率极显著高于TT基因型个体(P<0.01),TC和CC基因型个体乳蛋白率显著高于TT基因型个体(P<0.05)。T10996A/T12980C两种基因型组合分析中,在乳脂率上,TTCC基因型组合个体最高,TATC基因型组合个体位居第三位;在乳蛋白率上,TATC基因型组合个体显著高于AATT基因型组合个体(P<0.05)。κ-酪蛋白基因不同基因型和基因型组合与荷斯坦牛乳脂率和乳蛋白率存在相关性,但与产奶量和脂蛋白比不相关。

关键词: 荷斯坦牛 κ-酪蛋白基因 多态性 产奶性状 基因型组合

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