科研产出
山东省八个猪种繁殖、肉质、抗病基因多态性分析
《华北农学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要:利用PCR-RFLP等技术检测了山东省8个猪种(莱芜黑猪、大蒲莲黑猪、烟台黑猪、新沂蒙黑猪、里岔黑猪、五莲黑猪、鲁烟白猪和昌潍白猪)606个样品的繁殖(FSHβ、ESR和PRLR)、肉质(Haln)和抗病(FUT I)性状的主要功能基因的多态性分布,结果表明:山东省猪种上述5个基因均具有丰富的多态性,特别是FSHβ、ESR和PRLR3个影响繁殖性状有利基因的基因频率很高,是其高繁殖性能的基础。Haln和FUT I基因在中外猪种间有不同的分布特征,通过Haln和FUT I基因在中外猪种间频率的对比,初步分析了山东省各猪种受国外猪种的影响的程度,为山东省猪种遗传资源的保护和开发利用提供基础资料和科学依据。
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黑素皮质素受体1的结构和功能
《生物技术通讯 》 2008
摘要:黑色素生成反应是受黑素皮质素受体1(MC1R)调节的。MC1R是G蛋白偶联受体(GPCR)超家族的成员之一,它在表皮和毛囊的黑色素细胞中表达。被促肾上腺皮质激素和α-促黑素激活的MC1R,积极地与cAMP信号通路偶联,刺激黑色素合成,它也是褐黑素形成的一个通道。MC1R的功能行为与GPCR信号出现的概念一致,包括聚合体偶联到更多的信号通路。另外,MC1R也显示了独特的性质,如不寻常的高数量的自然变异通常与表型有关。因此,MC1R是研究GPCR功能的一个理想模型。对MC1R的结构和功能进行了简要综述。
关键词: 黑素皮质素 黑素皮质素受体 G蛋白偶联受体 多态性 黑素细胞 色素
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中国荷斯坦奶牛κ-酪蛋白基因第四外显子多态性与产奶性状的关联分析
《遗传 》 2008 北大核心 CSCD
摘要:以544头中国荷斯坦奶牛为研究对象,以κ-酪蛋白基因为产奶性状的候选基因,扩增779bp的片段,结合测序结果采用PCR-RFLP方法来检测κ-酪蛋白基因3个位点的多态性。结果在exon4的第10891bp、10927bp和10988bp处分别发生了T/C、C/A错义突变和G/A同义突变,据此分别选择了TaqⅠ、HindⅢ、PstⅠ等3种限制性内切酶检测了其多态性。发现3个位点的A、B等位基因在群体中都有分布,且处于低度多态;A和B等位基因的频率分别为86.03%和13.97%;AA,AB和BB基因型频率分别为73.71%,24.63%和1.66%;χ2适合性检验表明,该群体在这3个位点的突变达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);BB和AB基因型个体乳脂率显著高于AA基因型个体(P<0.05),AB基因型个体脂蛋白比显著高于AA基因型个体(P<0.05),但不同基因型对产奶量和乳蛋白率没有显著影响;3个位点的酶切多态性在所研究群体中是紧密连锁的。说明在中国荷斯坦奶牛群体中,κ-酪蛋白B等位基因可作为改良奶牛乳脂率性状的分子遗传标记。
关键词: 荷斯坦奶牛 κ-酪蛋白基因 多态性 PCR-RFLP 产奶性状
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微卫星DNA在牛亲子鉴定方面的研究进展
《中国畜牧兽医 》 2008 北大核心
摘要:微卫星DNA因具有长度多态性这一特点,而被广泛应用于个体的亲子鉴定。作者概述了微卫星DNA在牛亲子鉴定方面的研究进展及发展趋势。
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莱芜黑猪高繁基因的多态性及其对产仔数的影响
《西北农业学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要:分析了莱芜黑猪FSHβ、ESR和PRLR基因的多态性及其与产仔性能的关系。结果表明:对于FSHβ亚基基因,AA基因型占绝对优势,且产仔数最高,但各基因型间的产仔数差异不显著。对于ESR基因,AA基因型占绝对优势,由于在被检测的样本中未检测出BB基因型,因此难以计算基因型的产仔数差异。对于PRLR基因,BB基因型频率占绝对优势,但AA基因型比BB基因型的初产仔数多1.94头,达到显著水平(P<0.05)。FSHβ亚基基因和PRLR基因合并统计对产仔数的影响表明:AAAA基因型为有利基因型。在育种实践中,选择AAAA合并基因型可进一步提高莱芜黑猪的繁殖性能。
关键词: 莱芜黑猪 FSHβ ESR PRLR 多态性 产仔数
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莱芜猪DGAT1基因的多态性研究
《畜牧兽医学报 》 2007 北大核心 CSCD
摘要:二酰基甘油酰基转移酶1(Diacylglycerol acyltransferase,DGAT1)是催化酰基化的辅酶A和二酰基甘油合成甘油三脂的关键限速酶。莱芜猪具有较强的脂肪沉积能力,可能与DGAT1基因的活性有关。本研究对莱芜猪DGAT1的外显子6-8共476 bp的序列进行了克隆、测序(GenBank登录号:DQ289596)和多态性分析,分别在外显子6的第27 bp位点和外显子8的第56 bp位点检测到单核苷酸多态(SNP),均属于沉默突变。克隆了莱芜猪5′调控区737 bp的序列,在-241 bp(相对于起始密码子ATG)发现单个碱基的插入,该多态性位点与莱芜猪脂肪沉积的关系值得进一步探讨。
关键词: 莱芜猪 二酰基甘油酰基转移酶1基因(DGAT1) 多态性
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中国部分板栗品种的SSR标记
《农业生物技术学报 》 2007 CSCD
摘要:从板栗(Castanea mollissima)燕红中分离到25个SSR标记。为了鉴定这些SSR位点,在重复序列的两侧侧翼序列设计引物,并通过化学荧光检测法对6个板栗样品进行检测,共检测到20个多态性位点,每个位点的等位基因数为2~6个。挑选12个位点,通过半自动系统ABI PRISM377对中国北方24个板栗品种进行分析,这12个标记显示了高达75个等位基因的遗传多态性,每个位点的等位基因为4~10个,平均为6.3个,预期的平均杂合性为0.743(介于0.680~0.845),观察值为0.829(介于0.730~0.930)。无效等位基因估算频率显示为3个位点的正向价值,除了一个位点外,这些价值都很低,鉴定几率为7.01×10-11,亲缘关系鉴定几率非常高,为0.999,足够用于花粉流的研究。
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苹果α-法尼烯合酶基因组结构和序列的多态性分析
《园艺学报 》 2007 北大核心 CSCD
摘要:通过设计引物进行PCR扩增、测序、拼接序列,以及与GenBank中的cDNA序列(登录号AY182241)进行比对,获得α-法尼烯合酶基因(AFS)的基因组序列和内含子/外显子结构。获得的AFS基因序列已在GenBank注册(登录号DQ901739),它有6个内含子和7个外显子,编码一个大小为576个氨基酸的蛋白质。间隔外显子的6个内含子相位分别是0、1、2、2、0、0,其大小分别是108、113、>1000、125、220和88bp,7个外显子的推导氨基酸序列大小分别是57、89、127、73、48、83和99。编码的蛋白质中有3个序列模式(motif),RR(X8)W模式的编码基因序列在基因5′端的外显子1上,RxR模式和DDxxD模式的编码基因序列在外显子4上。将获得的AFS基因序列与GenBank中的cDNA序列(登录号AY523409)进行比对,结果发现两序列间有6个单核苷酸多态性,其中4个引起氨基酸突变。有意义的是,1个氨基酸突变(291R→G)发生在RxR模式上,此氨基酸突变以及其它突变是否与苹果α-法尼烯合成能力和虎皮病发生能力有关,值得进一步探讨。
关键词: 苹果 α-法尼烯合酶 基因组DNA 多态性 虎皮病
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肌肉生长抑制素基因5′调控区的多态性与大白猪的早期生长有关
《中国科学(C辑:生命科学) 》 2007 北大核心 CSCD
摘要:肌肉生长抑制素(myostatin,简称抑肌素,又称GDF8)是骨骼肌发育的负调节因子.本研究对猪抑肌素基因5′调控区的序列进行了克隆,对该区段的多态性及其与大白猪初生重和早期生长的关系进行了分析.结果表明,猪抑肌素基因5′调控区的序列存在长度多态性和单核苷酸多态性(SNP),其中,在435和447位点,由PCR-SSCP判定的2个等位基因(A和B)核苷酸序列不同:A等位基因分别为A和G,B等位基因则分别为G和A.在所检测的大白猪群体中A和B等位基因的频率分别为0.525和0.475;所检测的9头莱芜猪中4头为AA型,5头为AB型,未检测到BB型.本研究首次发现等位基因B对大白猪21日龄(P<0.01)、28日龄(P<0.05)和70日龄体重(P<0.05)以及0~21日龄(P<0.01)、0~28日龄(P<0.05)和21~70日龄(P<0.01)的日增重等早期生长性状均具有有利效应,加性效应值分别为(0.596±0.205)(P=0.0041),(0.498±0.200)(P=0.0136)和(1.409±0.551)kg(P=0.0112)以及(28.39±9.74)(P=0.0041),(17.78±7.15)(P=0.0136)和(37.00±16.92)g(P=0.0304),均达到显著或极显著水平.而对28~70日龄的日增重,尽管BB基因型个体有较高的日增重,但差异不显著(P>0.1).
关键词: 猪 肌肉生长抑制素(myostatin) 5′调控区 多态性 早期生长性状
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猪IGF2基因G3072A位点多态性及其与大白猪初生重和早期生长的关系
《畜牧兽医学报 》 2007 北大核心 CSCD
摘要:本研究采用PCR-SSCP技术对猪胰岛素样生长因子2(IGF2)基因G3072A位点在大白、长白和杜洛克猪群体的单核苷酸多态性(SNP)进行了检测,对其与大白猪初生重和早期生长的关系进行了分析。结果表明,在所分析的大白、长白和杜洛克猪群体的511个体中,IGF2基因在该位点均呈现多态性,大白、长白和杜洛克猪群体AA、AB和BB基因型均有分布,且大白和长白猪群体均显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01),而杜洛克猪群未偏离Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。测序结果显示,等位基因A和B分别对应于核苷酸A和G,在A等位基因中,有(AG)二核苷酸的插入。关联分析表明,在大白猪群中,AA、AB和BB基因型个体的初生重差异显著(P<0.05),AA和AB基因型个体的21、28和70日龄体重以及从出生~21日龄、21~28日龄、28~70日龄的日增重差异不显著(P>0.1)。
关键词: 猪 IGF2基因 G3072A 多态性 初生重 早期生长
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