科研产出
黑素皮质素受体4(MC4R)基因在5个地方鸡种中的遗传多态性分析
《山东农业科学 》 2017
摘要：本试验采用PCR-SSCP和PCR-RFLP方法分析了黑素皮质素受体4(MC4R)基因在5个地方鸡种中的遗传多态性,结果在5个供试鸡群体中检测到两个突变位点。在NC_006089.4:g.54 C>G位点中,CC基因型在莱芜黑鸡和琅琊鸡中均没有检测到,CG杂合型在汶上芦花鸡中表现为优势基因型,突变型GG基因型在其余4个群体中表现为优势基因型,等位基因G在所有供试群体中表现为优势等位基因。在NC_006089.4:g.315位点中,GT杂合型在汶上芦花鸡中表现为优势基因型,GG野生型在其余4个群体中表现为优势基因型,等位基因G在除汶上芦花鸡以外的4个群体中表现为优势等位基因。
关键词： 鸡 MC4R基因 PCR-SSCP PCR-RFLP 遗传多态性
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SIRT1基因多态性与肉牛屠宰性状相关性分析
《中国畜牧杂志 》 2015 北大核心
摘要：本文以牛的SIRT1基因为候选基因,采用PCR-SSCP和测序技术在利杂牛、利西杂牛、秦川牛、西杂牛和夏西杂牛5个牛群体共129头个体中检测遗传变异情况。结果表明:检测到AA、AB、AD、BD和DD共5种基因型,测序分析发现4处SNPs多态位点(Gen Bank:NM_001192980.1:g.-382A>G、-306T>C、-274G>C、-271G>C)。5个群体中不同基因型与屠宰性状的相关性分析显示,AD和BD基因型屠宰率显著高于AB、BD基因型眼肉显著高于AA、AB、AD和DD基因型,AA基因型背膘厚显著高于AA、AB、AD和DD、BD基因型净肉率显著高于AB、AD和DD基因型均达到显著水平(P<0.05)。因此,SIRT1基因单核苷酸多态性对5个牛群体的屠宰性状有一定的影响,可作为影响屠宰性状的候选基因,指导肉牛的育种工作。
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HMGCR基因多态性与肉牛屠宰性状相关性分析
《家畜生态学报 》 2015 北大核心
摘要：MHGCR是胆固醇生物合成过程中的限速酶,在内源胆固醇生物合成过程中起着重要的作用。研究以牛HMGCR基因为候选基因,采用PCR-SSCP和测序技术在利杂牛、利西杂牛、秦川牛、西杂牛和夏西杂牛五个群体共123个个体中检测遗传变异情况。结果表明,检测到AA和AB共2种基因型,没有发现BB基因型,测序分析发现一处SNP多态位点(GenBank:BC153262.1 11137T>C)。不同基因型与屠宰性状的相关性分析显示,在利西杂群体中AA基因型个体与AB基因型个体相比,AA基因型个体的屠宰率和牛柳指标达到了极显著水平(P<0.01),而AA基因型的上脑重显著高于AB基因型(P<0.05),其余各项指标基因型间差异不显著(P>0.05)。因此,HMGCR基因单核苷酸多态性对利西杂牛脂肪沉积有一定的影响,可作为影响屠宰性状的候选基因,指导肉牛的育种工作。
关键词： 肉牛 HMGCR PCR-SSCP 基因多态性 屠宰性状
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汶上芦花鸡催乳素基因外显子2的遗传变异及其与繁殖性状的相关性分析
《中国畜牧兽医 》 2014 北大核心
摘要：本研究以汶上芦花鸡为研究对象,利用PCR-SSCP技术对催乳素(prolactin,PRL)基因外显子2进行SNP检测和测序分析,并对该基因与汶上芦花鸡繁殖性状的相关性进行了分析。结果表明,PRL基因外显子2存在1个多态性位点,该位点由于在3838bp发生C→T的碱基突变,产生了AA、AB和BB 3种基因型,并导致氨基酸发生改变,由亮氨酸变为苯丙氨酸。BB基因型和等位基因B的频率最高;3种基因型(AA、AB和BB)在开产日龄、开产蛋重、开产体重、300日龄体重、300日龄蛋重的繁殖性状指标上均未达到差异显著性水平(P>0.05)。表明PRL基因外显子2多态性与汶上芦花鸡繁殖性状无明显相关性。
关键词： 催乳素基因 PCR-SSCP 汶上芦花鸡 繁殖性状
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山东地方鸡MHCB-F基因遗传变异与免疫性状相关性研究
《农业生物技术学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：鸡主要组织相容性复合体(MHC)由一组紧密连锁的、高度多态的基因座位所组成,在机体的免疫应答和调控等方面具有极其重要的作用。本研究旨在研究3个地方鸡(Gallus domesticus)品种(鲁禽鸡、琅琊鸡、石岐杂鸡)Major histocompatibility complex(MHC)B-F基因遗传变异与Sheep red blood cell(SRBC)、Avianinfluenza(AI)和New castle disease(ND)免疫抗体滴度等免疫性状的关系,揭示不同品种间基因变异与免疫性状的相关性。研究结果表明:3个品种SRBC免疫抗体滴度石歧杂鸡最高,与另外两个品种差异极显著(P<0.01);ND、H9抗体滴度趋势与SRBC一致,石歧杂另外两个品种差异极显著(P<0.01);H5抗体滴度石歧杂鸡最低,与另外两个品种差异极显著(P<0.01);亲缘关系较近的琅琊鸡和鲁禽鸡在4个抗体间结果基本一致,2个品种间差异均不显著(P>0.05)。通过PCR-SSCP方法分析了包括MHCB-F基因外显子2在内长度为396bp的片段。在这3个品种中分别发现了49、45和41个核苷酸变异位点,其中分别有40、37和32个引起了氨基酸突变,关联分析结果表明:3个品种中分别有6、9、4个SNPs位点与所检测的免疫性状显著相关(P<0.05)。亲缘关系最近的鲁禽和琅琊鸡其基因变异与免疫性状相关性基本一致,二者共有5个变异位点与免疫性状相关性一致,其中位点A192C、A217G均与新城疫抗体滴度显著相关(P<0.05),位点A217G与禽流感H5抗体滴度显著相关(P<0.05),位点A211G与禽流感H9抗体滴度显著相关(P<0.05),位点G232A与绵羊红细胞抗体滴度显著相关(P<0.05)。在石歧杂鸡中位点C183G与新城疫、禽流感H9抗体滴度显著相关(P<0.05)。研究结果对于临床疫苗的使用具有重要的指导作用。
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山东地方鸡种Mx基因遗传变异与免疫性状的关系
《浙江农业学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：采用PCR-SSCP技术研究山东地方鸡种(鲁禽鸡、琅琊鸡、石歧杂鸡、汶上芦花鸡、莱芜黑鸡、济宁百日鸡)Mx基因多态位点与绵羊红细胞(sheep red blood cell,SRBC)免疫抗体滴度和禽流感(avian influenza,AI)、新城疫(newcastle disease,ND)免疫抗体滴度等免疫性状的关系。扩增包含Mx基因intron 13和exon 14约150 bp的片段,通过SSCP分型、测序,在5个地方鸡种共发现2个SNP突变位点分别为Mx基因编码序列第1 892位点G→A(Ser→Asn),第1 911位点G→A。与免疫性状进行关联分析,发现鲁禽鸡、琅琊鸡、莱芜黑鸡Mx基因编码序列1 892位点与H9抗体滴度显著相关(P<0.05)。
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渤海黑牛BOLA-DQA2基因SNPs多态性与生长性状的关联性分析
《西南农业学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：本试验采用PCR-SSCP方法对渤海黑牛BOLA-DQA2基因的编码区进行分析,研究渤海黑牛BOLA-DQA2基因多态性与生产性状的关系。研究表明,外显子1和外显子5处没有发现多态性位点,外显子2处发现两个多态位点产生4种基因型,外显子3处发现1个多态位点产生3种基因型,外显子4处发现1个多态位点产生3种基因型。外显子2中基因型AA所对应的个体头长、额宽、体高、十字部高显著高于基因型BB、AB、BC(P<0.05),其它生长性状均无显著差异。外显子3、外显子4中生产性状在AA、BB、AB这3种基因型上均无显著差异。DQA2外显子2中等位基因A对渤海黑牛的生产性状起关键作用,可以为渤海黑牛品种选育提供一定的参考。
关键词： BOLA-DQA2 PCR-SSCP 生长性状 渤海黑牛
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石歧杂鸡催乳素基因外显子4变异与产蛋就巢性状的关联分析
《中国畜牧兽医 》 2011 北大核心
摘要：利用PCR-SSCP技术和测序技术对催乳素(prolactin,PRL)基因外显子4进行SNP检测,并分析了该基因与石歧杂鸡产蛋、就巢性状的相关性。结果表明,PRL基因外显子4存在1个多态性位点,该位点在6017位点发生G→A的碱基突变,产生了AA、AB和BB 3种基因型,AA基因型为优势基因型,等位基因A为优势等位基因,该突变未导致氨基酸的变异;该位点的变异与开产日龄、首次就巢日龄呈现一定的显著差异趋势,BB基因型开产日龄、首次就巢日龄都晚于AA和AB基因型。
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石歧杂鸡催乳素基因外显子2的SNP检测与产蛋就巢性状的关联分析
《中国畜牧兽医 》 2010 北大核心
摘要：利用PCR-SSCP技术对石歧杂鸡的催乳素(prolactin,PRL)基因外显子2进行SNP检测和测序分析,并对该基因与石歧杂鸡产蛋、就巢性状的相关性进行了研究。结果表明,PRL基因外显子2存在多态性位点,该位点由于在3838位点发生C→T的碱基突变,产生了AA、AB和BB3种基因型,并导致氨基酸的改变,由亮氨酸变为苯丙氨酸。基因型AA和等位基因A的频率最高;BB基因型个体首次就巢时间显著晚于AA和AB基因型(P<0.01);BB基因型的就巢次数显著多于AA和AB基因型(P<0.05);3种基因型与产蛋性状相关性不显著。
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中国荷斯坦牛HSP70基因3＇-非翻译区多态性与耐热性的关联分析
《华北农学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：用PCR-SSCP和测序技术研究了541头中国荷斯坦奶牛热休克蛋白70(HSP70)基因的3'-非翻译区的多态性,并研究了多态性对奶牛产奶性状和耐热性状的影响。设计引物扩增片段大小549 bp,通过PCR-SSCP技术发现参与试验的奶牛出现了3个复等位基因:A、B和C,6种基因型:AA、AB、AC、BB、BC和CC基因型。测序发现复等位基因是由3个新的突变引起的,第6 400、6 600和6 601位碱基分别发生了G/C、C/T和G/A突变。χ2适合性检验表明,该群体在这三个位点的突变没有达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.01)。中国荷斯坦牛BB基因型个体红细胞钾含量和产奶量下降率显著低于其他基因型个体(P<0.05),表明BB型的中国荷斯坦牛耐热性能优于其他类型。BB基因型个体305 d产奶量高于其他5种基因型的个体,进一步说明BB基因型可能在选育高产抗热应激奶牛中得到应用。
关键词： 荷斯坦奶牛 HSP70基因 多态性 热应激 PCR-SSCP
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