科研产出
传染性喉气管炎病毒烟台株gE基因的克隆与序列分析
《西北农林科技大学学报(自然科学版) 》 2005 北大核心 CSCD
摘要:根据传染性喉气管炎病毒(ILTV)gE基因序列设计并合成1对引物,以烟台株为模板,用PCR法扩增出1条1.5kb的基因片段,并将其克隆至pMD18-T载体中。经电泳分析、酶切鉴定,将得到的重组质粒命名为pMD-gE并进行序列测定。将测序结果与ILTV美国标准攻毒毒株和中国王岗株,BHV-1,EHV-1,FHV-1,HHV-2,HHV-3,HVT,MDV-1,MDV-2,PRV的gE基因比较,发现核苷酸和氨基酸的同源性分别为99.7%~11.9%和99.4%~15%。结果表明,不同ILTV毒株之间gE基因还是比较保守的,但不同疱疹病毒之间,gE基因的同源性较低。
关键词: 传染性喉气管炎病毒 烟台株 gE基因 克隆 序列分析
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马铃薯S病毒外壳蛋白基因的克隆及其在大肠杆菌中的表达
《园艺学报 》 2004 北大核心 CSCD
摘要:以田间采集的马铃薯病叶中提取的马铃薯病毒S(PVS)总RNA为模板,通过RT-PCR获取长度为890 bp的PVS-cp的cDNA,克隆至pGEM-T载体上。酶切回收该基因片段,并构建了该基因的原核表达质粒pBV-pvs。SDS-PAGE凝胶电泳和Western印迹分析表明:PVS-cp基因在大肠杆菌JM109中可特异地高效表达分子量约33kD的蛋白,且表达蛋白具有良好的抗原活性。利用该表达产物免疫动物家兔,获得的抗血清可用于大田马铃薯S病毒的快速检测。
关键词: 马铃薯 马铃薯S病毒 外壳蛋白基因 RT-PCR 序列分析 Western印迹 抗血清制备
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山东省玉米矮花叶病毒的生物学特性及基因组全序列测定
《病毒学报 》 2003 北大核心 CSCD
摘要:对山东省玉米矮花叶病毒原分离物(SD)进行了寄主范围、血清学等普通生物学鉴定,测定了该病毒的基因组核苷酸全序列。该病毒基因组RNA由9596个核苷酸组成(不包括3′-polyA的长度),整个基因组按一个ORF编码一个3063个氨基酸的多聚蛋白。序列比较表明,该病毒分离物(SD)与玉米矮花叶病河南分离物(HN,EMBL登录号:AF494510)核苷酸全序列同源性最高,为98 2%,与已报道的甘蔗花叶病毒(SCMV)7个分离物同源性也高达79 5%~98 2%,但与玉米矮花叶病毒保加利亚分离物(MDMV-Bg,AJ001691)和高梁花叶病毒萧山甘蔗分离物(SrMV-XoS,AJ310197)的同源性仅为67 8%和69 3%,与约翰逊草花叶病毒(Z26920,JGMV)差异最大。系统进化树分析也表明,该病毒与SCMV分离物位于同一进化簇,而与MDMV进化关系很远。
关键词: 玉米矮花叶病毒原 甘蔗花叶病毒 基因组全序列 序列分析
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鸡α-干扰素基因的克隆及序列分析
《山东家禽 》 2003
摘要:利用RT-PCR方法,从ConA诱导的鸡淋巴细胞中扩增出鸡α-干扰素基因,经同源性比较,发现家禽α-干扰素核苷酸序列之间同源性较高,而与哺乳动物的同源性较低,说明家禽α-干扰素的生物学功能与哺乳动物可能存在一定差异。
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马铃薯X病毒外壳蛋白基因的克隆及其原核表达载体的构建
《中国马铃薯 》 2002
摘要:将来源于国际马铃薯中心 (InternationalPotatoCenter ,ClP)PVX病毒毒源接种至烟草上 ,对表现明显症状的烟草叶片提取马铃薯病毒X (PVX)总RNA ,人工合成引物P1、P2 ,通过RT PCR扩增合成PVX cp的cDNA ,井将其克隆到pGEM T载体上。经限制酶谱分析后进行全序列测定 ,结果表明 :该基因由 714个核苷酸组成 ,编码 2 38个氨基酸 ,与文献 (分别来源于亚洲、非洲和欧洲 )报道的 4个 pVX cp基因相比同源性为 81%~ 95 % ,其编码的氨基酸同源性均在 90 %以上。说明PVX cp具有较高的保守性。用内切酶将PVX cp基因自克隆载体 pGEM切下 ,定向插入到表达质粒 pBV2 2 0的启动子Pr、Pl的下游 ,构建了该基因的原核表达载体pBV pvx ,为进行该基因的原核表达和抗血清的制备奠定了基础。
关键词: 马铃薯X病毒 外壳蛋白基因 RT-PCR 序列分析
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新城疫病毒山东流行株F基因的序列测定和分析
《中国兽医杂志 》 2002 北大核心
摘要:用 SPF鸡胚从发生新城疫鸡群分离到一株病毒 ,进行了生物学特性的研究 ,结果表明 ,最小致死量鸡胚平均死亡时间 (MDT)为 5 0 ,1日龄鸡脑内接种致病指数 (ICPI)为 1.82 ,6周龄鸡静脉接种致病指数 (IVPI)为 2 .6 2 ,属强毒力毒株。以异硫氰酸胍法提取病毒基因组 RNA,RT- PCR扩增其融合蛋白 F基因重要功能区片段 ,经回收后 ,克隆到 p GEM- T载体上进行酶切鉴定与核苷酸序列测定 ,并与多株已报道的 NDV国内外参考株相应片段进行序列比较 ,F基因的同源性在 84% - 91%之间 ,氨基酸同源性为 82 % - 93% ,经基因进化树分析 ,证实流行株为基因 型毒株
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花生条纹病毒外壳蛋白基因cDNA的合成、克隆及全序列测定
《农业生物技术学报 》 1999 CSCD
摘要:自田间采集的花生病叶中提取花生条纹病毒( PStV) 总RNA,人工合成引物P1 、P2 ,通过RTPCR 扩增合成PStVcp 的cDNA,并将其克隆到pGEMT 载体上。经限制酶谱分析后进行全序列测定,结果表明:该基因由1 084 个核苷酸组成,包含了PStVcp cDNA 完整的861 bp 编码序列( 编码287 个氨基酸)以及3'端223 bp 非编码序列,与文献报道的4 个PStVcp 基因相比同源性均在96 % 以上,且其编码的氨基酸同源性均在975 % 以上,说明PStVcp 基因具有较高的保守性。
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