科研产出
一株牛副流感病毒3型的分离鉴定及基因组序列分析
《中国病原生物学杂志 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：目的检测和分离引起山东省某规模化牛场成年牛死亡的病原体并进行系统进化树分析.方法取牛肺组织样品进行RT-PCR检测;检测阳性的样品接种MDBK细胞,经盲传3代后出现明显细胞病变再取细胞上清液经特异性引物进行RT-PCR鉴定,并进行全基因组测序.结果成功分离到1株牛副流感病毒3型,命名为SD001.序列分析表明,SD001毒株与宁夏分离株NX49(KT071671.1)同源性较高为99.7%,均属C型BPIV3.结论本研究获得的分离株为牛副流感病毒3型,与宁夏分离株NX49同源性高.为进一步开展BPIV3研究奠定了基础.
关键词： 牛副流感病毒3型 分离鉴定 细胞病变 测序 同源性
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一例小反刍兽疫疑似病例的确诊及其遗传进化分析
《中国畜牧兽医学会2014年学术年会论文集 》 2014 CSCD
摘要：引言小反刍兽疫(PPR)是由小反刍兽疫病毒(PPRV)引起的一种小反刍兽类的急性接触性A类传染病。我国在2007年首次报道发生了该疫情,从2013年12月至2014年5月,我国有22个省(市)陆续发现疫情。截止9月3目,根据农业部兽医局最新报道该疫情尚在国内存在。有关PPR的防控目前尚无有效治疗方法,主要通过疫苗免疫的方式进行控制,未免疫的山羊和绵羊接触PPRV会导致高发病
山东玉米粗缩病病原S10序列分析
《玉米科学 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：利用采自山东章丘、济宁表现典型粗缩病症状的玉米植株样品进行ELISA和RT-PCR检测。间接ELISA结果表明,二者均与水稻黑条矮缩病毒(RBSDV)多克隆抗体表现阳性反应。RT-PCR扩增出该病毒基因组S10约1.8 kb片段。获得的1 801 bp全长序列与已发表的相关序列进行同源性分析和系统进化树分析,结果表明,章丘分离物克隆JNZ-14序列、济宁分离物克隆JN-8序列均属于RBSDV,但其与玉米粗缩病毒(MRDV)的进化关系比其与南方水稻黑条矮缩病毒(SRBSDV)的关系还要近,且2个分离物分别处于属于RBSDV的Ⅱ或Ⅰ两大分支中。
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中国樱桃泰山干樱S-RNase基因的克隆及序列分析
《果树学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：以中国樱桃品种泰山干樱为试材,利用李属植物C2、C5保守区引物,扩增花柱S-RNase基因,获得4个S等位基因,测序结果表明序列大小分别为:1608、950、796、504bp。根据同源比较发现大小为796bp的等位基因与基因库中登录的S1-RNase为同一基因,其它3个S-RNase基因为首次报道,依序列大小分别命名为S2(1608bp,登陆号EF541168)、S4(950bp,登陆号EF541173)和S6(504bp,登陆号EF541172)。序列分析表明S2-RNase在C3区存在终止密码子,导致翻译提早终止;S4-RNase的C5区前有插入片断;S6-RNase在高变区比其它S等位基因少一个氨基酸残基。氨基酸序列同源性比较分析表明,中国樱桃S-RNase与樱花、扁桃的相似性高。在系统进化树中中国樱桃的4个S-RNase基因的氨基酸序列和樱花、扁桃、甜樱桃、酸樱桃等一起归于李亚科。
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中国荷斯坦牛白细胞黏附缺陷症PCR-RFLP检测方法的研究
《生物技术通报 》 2007 CSCD
摘要：本试验根据已知牛染色体上CD18编码基因序列设计引物,提取牛血液和精液DNA,可扩增出338bp的DNA片段,将PCR产物克隆到pMD18-T载体中,对阳性重组质粒进行测序,确定为牛的CD18基因。由于CD18基因的383位碱基由A变为G,而引起牛白细胞黏附缺陷症(BLAD),通过对济南市11个奶牛场356头奶牛及53头荷斯坦种公牛进行了BLAD的PCR-RFLP检测,共检出3头杂合母牛(携带者),占检测母牛群的0.84%,在荷斯坦公牛中只检测到一种基因型,没有发现隐性突变基因的携带者。
