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PRRSV分离株Nsp2基因和ORF5基因的遗传变异分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王剑非 1 ; 孙建全 2 ; 张金强 2 ; 迟小伟 2 ; 刘杰 2 ; 丛晓燕 2 ; 时建立 2 ; 李俊 2 ; 吴家强 2 ;

作者机构: 1.山东省农业科学院

2.山东省农业科学院;山东省畜禽疫病防治与繁育重点实验室;山东中医药大学附属医院;山东大学附属济南市中心医院

关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒;分离;Nsp2基因;ORF5基因;变异分析

期刊名称: 家畜生态学报

ISSN: 1673-1182

年卷期: 2011 年 32 卷 01 期

页码: 52-57

摘要: 为了解山东省PRRSV流行毒株的遗传变异情况和分子流行病学背景,对2007~2009年分离到的14株山东省内的PRRSV流行毒株进行了Nsp2和ORF5基因序列的测定和分析。结果显示,与参考毒株JXA1相比,14株PRRSV Nsp2与ORF5基因的核苷酸同源性分别达到96.1%~99.8%和98.0%~99.8%,氨基酸序列同源性分别达到92.9%~100%和97.5%~99.5%。序列分析结果表明,14株毒株在Nsp2蛋白内部均存在编码30个氨基酸的碱基对的不连续缺失;ORF5基因编码的GP5蛋白不存在缺失,但存在点突变。遗传进化分析表明,07年分离毒株JQ与参考毒株JXA1亲缘关系很近;09年分离的12株PRRSV,2株仍与国内2006~2007年间的分离株在同一分支,9株已经处在不同分支,1株单独处在一个分支。2007~2009年山东地区流行的PRRSV分离株具有年度特征,无明显的地域特征。

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