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秦川牛mtDNA全基因组遗传多样性与母系起源研究

文献类型： 中文期刊

作者： 白萌萌 1 ; 马卫东 1 ; 成海建 1 ; 黄永震 1 ; 雷初朝 1 ;

作者机构： 1.西北农林科技大学动物科技学院;陕西省农牧良种场;山东省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词： 秦川牛;mtDNA全基因组;遗传多样性;母系起源

期刊名称： 中国牛业科学

ISSN： 1001-9111

年卷期： 2024 年 50 卷 002 期

页码： 11-14

摘要： [目的]从32头秦川牛全基因组中提取其mtDNA全基因组序列进行分析,以揭示秦川牛mtDNA基因组的遗传多样性与母系起源.[方法]采用mtDNA全基因组序列比对及生物信息学方法.[结果]在32头秦川牛mtDNA全基因组序列中,共检测到30种不同的单倍型,其平均单倍型多样度(Hd±SD)为0.996±0.009,其平均核苷酸多样度(π±SD)为0.0067±0.0010,表明秦川牛具有丰富的母系遗传多样性.构建的mtDNA全基因组系统发育树与单倍型网络图表明,32头秦川牛的mtDNA全基因组序列包括T2、T3、T4、I1共4个不同的支系,其中T2支系占21.88%,T3支系占40.625%,T4支系占9.375%,I1支系占28.125%.说明秦川牛具有普通牛和瘤牛两个支系,其中普通牛支系占71.88%,瘤牛支系占28.12%.[结论]秦川牛具有丰富的母系遗传多样性,有普通牛和瘤牛两个母系起源,但以普通牛起源为主.

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