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葡萄全基因组WRKY转录因子鉴定和分析

文献类型： 中文期刊

作者： 苏玲 1 ; 王鹏飞 1 ; 杨阳 1 ; 任凤山 1 ; 王咏梅 1 ; 陈万钧 1 ;

作者机构： 1.山东省葡萄研究院/山东省葡萄栽培与深加工工程技术研究中心/农业部华东都市农业重点实验室

关键词： 葡萄;WRKY;转录因子;进化分析;表达分析

期刊名称： 黑龙江农业科学

ISSN： 1002-2767

年卷期： 2019 年 01 期

页码： 13-22

摘要： 为鉴定和分析葡萄全基因组中WRKY家族转录因子基因,利用生物信息学的方法,分析葡萄全基因组WRKY转录因子类型、进化分析、染色体定位、基因结构、保守元件和基因表达模式。结果表明:葡萄全基因组中有56个WRKY转录因子。序列比对和系谱进化表明,分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ三个组,Ⅱ组分为Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d和Ⅱ-e五个亚组。染色体定位表明,存在串联复制和分布不均现象,但是在3号染色体上无该家族基因定位。结构域和保守元件分析都说明葡萄WRKY(VvWRKY)家族的WRKY结构域是高度保守的。葡萄叶片中基因表达模式分析表明,VvWRKY家族的部分基因参与非生物胁迫。

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