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苹果WUSCHEL-related homeobox (WOX)家族基因的鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王楚堃 1 ; 韩朋良 1 ; 王咏梅 2 ; 王鹏飞 2 ; 胡大刚 1 ;

作者机构： 1.山东农业大学园艺科学与工程学院

2.山东省葡萄研究院

关键词： 苹果;WOX家族;生物信息学;基因表达

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2019 年 46 卷 006 期

页码： 1021-1032

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用生物信息学方法和苹果基因组数据库,鉴定并分析了12个苹果WUSCHEL-related homeobox (WOX)家族基因.系统进化树分析表明,苹果WOX家族和拟南芥WOX家族可被分为现代分支(WUS分支)、中间分支和祖先分支;苹果WOX家族成员均含有1个motif-1,不同分支的成员含有其分支特异的motif;基因结构分析显示,苹果WOX家族基因含有2~4个外显子,染色体定位发现11个基因分别定位在苹果的7条染色体上,1个基因无准确定位.基因表达模式分析表明,12个基因在苹果各组织中均有表达,且在果实中的表达量较高;密码子偏好性分析显示,苹果WOX家族基因的偏好性较弱.

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