科研产出
牛糖基化依赖细胞黏附分子1基因(GlyCAM1)的遗传多态性分析
《农业生物技术学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：以中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛为研究材料,利用CRS-PCR、PCR-SSCP及DNA测序技术检测了糖基化依赖细胞黏附分子1基因(GlyCAM1)的遗传多态性。结果表明,在牛GlyCAM1基因外显子3的第2081(A/C)和内含子3的2417(C/T)位点存在突变,两位点在3个牛群中的等位基因频率A/B分别为0.7525/0.2475、0.6112/0.3888和0.3375/0.6625;0.9046/0.0954、0.8383/0.1617和0.7875/0.2125;经χ2适合性检验,3个牛群在内含子3的突变达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),在外显子3鲁西黄牛和渤海黑牛达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),中国荷斯坦牛的突变在此位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。
关键词： 牛 糖基化依赖细胞粘附分子1基因(GlyCAM1) 遗传多态性 CRS-PCR PCR-SSCP
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牛CXC趋化因子受体1基因(CXCR1)编码区单核苷酸多态性
《农业生物技术学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：采用巢式PCR、DNA测序和CRS-PCR方法,研究了牛(Bos taurus)3个品种中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛的chemokine(C-X-Cmotif)receptor1(CXCR1)基因编码区的单核苷酸多态性(SNPs),发现了819(G/A)、995(G/A)和1008(C/T)3个SNPs,其中995(G/A)和1008(C/T)为首次报道的2个位点,995(G/A)导致氨基酸的改变Arg422His。CXCR1基因819(A/G)、995(A/G)和1008(C/T)3个位点在中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛群体的优势等位基因相同,分别为G、G和C,其等位基因频率分别为0.63/0.73/0.71、0.60/0.85/0.71和0.74/0.76/0.71。经χ2适合性检验,鲁西黄牛在995(A/G)和1008(C/T)位点达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);渤海黑牛的所有位点均达到Hardy-Weinberg平衡状态,荷斯坦牛在3个位点均未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。3个品种牛在819(A/G)和1008(C/T)位点均表现为中度多态(0.25
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牛Nramp1基因5′调控区序列的克隆及序列分析
《中国兽医学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：采用LA-PCR技术扩增牛Nramp1基因2 515 bp的5′调控区序列,构建了重组克隆载体pEASY-T3-Nramp1,对阳性克隆进行了PCR扩增、限制性酶切鉴定、DNA测序及生物信息学分析。结果表明,试验成功构建了包含Nramp1基因5′调控区的重组质粒。经同源性比对发现,Nramp1基因5′调控区在不同物种中具有一定的保守性,在转录起始位点近端的启动子区域,牛与人、鼠、猪、羊的同源性分别是60.50%,58.52%,72.18%,81.95%。经预测,该调控区富含GR、SP1、c-Ets-1、NF-W2等转录因子结合位点。本研究为进一步确定牛Nramp1基因核心启动子区域及该基因的表达调控奠定了理论基础。
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奶牛乳腺炎金黄色葡萄球菌纤连蛋白结合蛋白配基结合区基因的克隆与原核表达
《中国兽医学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：运用PCR方法扩增出奶牛乳腺炎分离株10A的Fnbp配基结合区基因,该片段大小为350bp左右,将其与PGEM-T载体连接,转化到受体菌DH5α中,用Amp/IPTG/X-gal琼脂平板筛选出含有重组子的菌株,鉴定成功后,测序结果表明:奶牛乳腺炎金黄色葡萄球菌10A的Fnbp配基结合区基因的序列与金黄色葡萄球菌Mu50、N315、MSSA476、MW2、RF122、COL以及NCTC8325的相应区域序列同源性分别为97%、97%、95%、95%、96%、94%和94%。将重组克隆载体质粒进行BamHⅠ和XhoⅠ双酶切回收后的DNA,定向插入到融合表达载体PET-32a中,构建了重组质粒PET-Fnbp,并转化到宿主菌BL21(DE3)株中,经IPTG4h诱导后,SDS-PAGE电泳表明,重组蛋白得到高效表达,重组蛋白主要以分泌形式存在,分子量35000左右,Ni柱纯化后的蛋白经Western-blotting检测,具有良好的抗原性和特异性。
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奶牛红毛基因分型及蛋白结构预测研究
《西北农林科技大学学报(自然科学版) 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：【目的】通过对奶牛MC1R基因核苷酸序列的分析和蛋白结构的预测,探讨奶牛红白花毛色形成的分子机制。【方法】采用PCR-RFLP技术对奶牛MC1R基因进行分型,利用生物信息学方法对其蛋白结构特征进行模拟分析。【结果】共检测出与毛色表型有关的3种基因型,其中EE基因型在黑白花奶牛中占优势,ee基因型在红白花奶牛中占优势。蛋白结构预测结果显示,ee基因型个体的缺失突变使蛋白质翻译提前终止,进而引发二级结构改变,导致红白花奶牛个体的出现。【讨论】E等位基因主要与黑色毛色形成有关,e等位基因主要与红色毛色形成有关。
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中国荷斯坦牛红毛基因变异及其编码蛋白结构预测
《中国农业科学 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：【目的】通过对中国荷斯坦牛MC1R基因的核苷酸序列分析和蛋白结构预测,探讨中国荷斯坦牛红白花毛色形成的分子机制。【方法】采用PCR-RFLP技术对MC1R基因进行分型,利用生物信息学方法对其蛋白结构特征进行模拟分析。【结果】检测出与毛色表型相关的三种基因型,EE基因型在中国荷斯坦黑白花牛中占优势,ee基因型在中国荷斯坦红白花牛中占优势。蛋白预测结果显示,ee基因型个体的缺失突变使蛋白质翻译提前终止,引发二级结构改变,导致中国荷斯坦牛红白花个体的出现。【结论】E等位基因主要与黑色毛色形成有关,e等位基因主要与红色毛色形成有关。
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