科研产出
微卫星DNA在牛亲子鉴定方面的研究进展
《中国畜牧兽医 》 2008 北大核心
摘要：微卫星DNA因具有长度多态性这一特点,而被广泛应用于个体的亲子鉴定。作者概述了微卫星DNA在牛亲子鉴定方面的研究进展及发展趋势。
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莱芜黑猪高繁基因的多态性及其对产仔数的影响
《西北农业学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：分析了莱芜黑猪FSHβ、ESR和PRLR基因的多态性及其与产仔性能的关系。结果表明:对于FSHβ亚基基因,AA基因型占绝对优势,且产仔数最高,但各基因型间的产仔数差异不显著。对于ESR基因,AA基因型占绝对优势,由于在被检测的样本中未检测出BB基因型,因此难以计算基因型的产仔数差异。对于PRLR基因,BB基因型频率占绝对优势,但AA基因型比BB基因型的初产仔数多1.94头,达到显著水平(P<0.05)。FSHβ亚基基因和PRLR基因合并统计对产仔数的影响表明:AAAA基因型为有利基因型。在育种实践中,选择AAAA合并基因型可进一步提高莱芜黑猪的繁殖性能。
关键词： 莱芜黑猪 FSHβ ESR PRLR 多态性 产仔数
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“十五”大豆创新种质和1963—1995年间育成品种的SSR遗传结构及遗传多样性分析
《作物学报 》 2007 北大核心 CSCD
摘要：对22份"十五"攻关培育的创新种质和22份大豆育成品种进行了24个SSR标记的分析比较,目的是在分子水平上阐明创新种质的遗传结构特点,为拓宽我国大豆育成品种遗传基础及亲本选择提供理论依据。本研究在24个SSR位点共检测出231个等位变异,其中15.8%(36个等位变异)为创新种质所特有,特别是在与大豆胞囊线虫紧密连锁的Satt309位点上验证了一个我国独有的等位变异。结合UPGMA和Model-based聚类结果,将创新种质和育成品种分为4组,第Ⅰ组由13份来自东北和山西的创新种质组成;第Ⅱ组由8份来自东北的育成品种组成;第Ⅲ组由8份来自黄淮海和南方的大豆种质组成,其中创新种质和育成品种各为4份;第Ⅳ组由4份育成品种组成,分别来自吉林、黑龙江、河南和山西。遗传多样性分析结果表明,利用国外种质和野生大豆创造的创新种质丰富了东北地区育成品种的遗传多样性。因此,应加强利用国外种质、我国栽培大豆地方品种和野生大豆等优异资源,在创造优异大豆新种质的同时,拓宽我国大豆的遗传基础。
莱芜猪DGAT1基因的多态性研究
《畜牧兽医学报 》 2007 北大核心 CSCD
摘要：二酰基甘油酰基转移酶1(Diacylglycerol acyltransferase,DGAT1)是催化酰基化的辅酶A和二酰基甘油合成甘油三脂的关键限速酶。莱芜猪具有较强的脂肪沉积能力,可能与DGAT1基因的活性有关。本研究对莱芜猪DGAT1的外显子6-8共476 bp的序列进行了克隆、测序(GenBank登录号:DQ289596)和多态性分析,分别在外显子6的第27 bp位点和外显子8的第56 bp位点检测到单核苷酸多态(SNP),均属于沉默突变。克隆了莱芜猪5′调控区737 bp的序列,在-241 bp(相对于起始密码子ATG)发现单个碱基的插入,该多态性位点与莱芜猪脂肪沉积的关系值得进一步探讨。
关键词： 莱芜猪 二酰基甘油酰基转移酶1基因(DGAT1) 多态性
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"十五"大豆创新种质和1963-1995年间育成品种的SSR遗传结构及遗传多样性分析
《作物学报 》 2007 CSCD
摘要：对22份"十五"攻关培育的创新种质和22份大豆育成品种进行了24个SSR标记的分析比较,目的是在分子水平上阐明创新种质的遗传结构特点,为拓宽我国大豆育成品种遗传基础及亲本选择提供理论依据.本研究在24个SSR位点共检测出231个等位变异,其中15.8%(36个等位变异)为创新种质所特有,特别是在与大豆胞囊线虫紧密连锁的Satt309位点上验证了一个我国独有的等位变异.结合UPGMA和Model-based聚类结果,将创新种质和育成品种分为4组,第Ⅰ组由13份来自东北和山西的创新种质组成;第Ⅱ组由8份来自东北的育成品种组成;第Ⅲ组由8份来自黄淮海和南方的大豆种质组成,其中创新种质和育成品种各为4份;第Ⅳ组由4份育成品种组成,分别来自吉林、黑龙江、河南和山西.遗传多样性分析结果表明,利用国外种质和野生大豆创造的创新种质丰富了东北地区育成品种的遗传多样性.因此,应加强利用国外种质、我国栽培大豆地方品种和野生大豆等优异资源,在创造优异大豆新种质的同时,拓宽我国大豆的遗传基础.
中国部分板栗品种的SSR标记
《农业生物技术学报 》 2007 CSCD
摘要：从板栗(Castanea mollissima)燕红中分离到25个SSR标记。为了鉴定这些SSR位点,在重复序列的两侧侧翼序列设计引物,并通过化学荧光检测法对6个板栗样品进行检测,共检测到20个多态性位点,每个位点的等位基因数为2~6个。挑选12个位点,通过半自动系统ABI PRISM377对中国北方24个板栗品种进行分析,这12个标记显示了高达75个等位基因的遗传多态性,每个位点的等位基因为4~10个,平均为6.3个,预期的平均杂合性为0.743(介于0.680~0.845),观察值为0.829(介于0.730~0.930)。无效等位基因估算频率显示为3个位点的正向价值,除了一个位点外,这些价值都很低,鉴定几率为7.01×10-11,亲缘关系鉴定几率非常高,为0.999,足够用于花粉流的研究。
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苹果α-法尼烯合酶基因组结构和序列的多态性分析
《园艺学报 》 2007 北大核心 CSCD
摘要：通过设计引物进行PCR扩增、测序、拼接序列,以及与GenBank中的cDNA序列(登录号AY182241)进行比对,获得α-法尼烯合酶基因(AFS)的基因组序列和内含子/外显子结构。获得的AFS基因序列已在GenBank注册(登录号DQ901739),它有6个内含子和7个外显子,编码一个大小为576个氨基酸的蛋白质。间隔外显子的6个内含子相位分别是0、1、2、2、0、0,其大小分别是108、113、>1000、125、220和88bp,7个外显子的推导氨基酸序列大小分别是57、89、127、73、48、83和99。编码的蛋白质中有3个序列模式(motif),RR(X8)W模式的编码基因序列在基因5′端的外显子1上,RxR模式和DDxxD模式的编码基因序列在外显子4上。将获得的AFS基因序列与GenBank中的cDNA序列(登录号AY523409)进行比对,结果发现两序列间有6个单核苷酸多态性,其中4个引起氨基酸突变。有意义的是,1个氨基酸突变(291R→G)发生在RxR模式上,此氨基酸突变以及其它突变是否与苹果α-法尼烯合成能力和虎皮病发生能力有关,值得进一步探讨。
关键词： 苹果 α-法尼烯合酶 基因组DNA 多态性 虎皮病
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樱桃主栽品种的遗传多样性分析
《园艺学报 》 2007 北大核心 CSCD
摘要：利用24对SSR引物对30个樱桃主栽品种进行遗传多样性分析,以了解樱桃产区的资源多样性状况,为种质资源的开发和利用提供帮助。结果表明:樱桃产区具有丰富的遗传变异。SSR的遗传多样性指数的分布范围为1.3647~2.9964,Simpson指数分布范围为0.6111~0.9326。30个品种的分子数据聚类结果均呈现一定的地理分布规律。根据系统聚类分析将30个樱桃品种分为两大类:欧洲甜樱桃和中国樱桃,与传统分类学的结果相符。同时在两大类内又将品种进行细分,第Ⅰ类分为3组,第Ⅱ类分为2组,其结果与地理分布有一定的相关性,能够反映樱桃的遗传特点及区域特性。
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肌肉生长抑制素基因5′调控区的多态性与大白猪的早期生长有关
《中国科学(C辑:生命科学) 》 2007 北大核心 CSCD
摘要：肌肉生长抑制素(myostatin,简称抑肌素,又称GDF8)是骨骼肌发育的负调节因子.本研究对猪抑肌素基因5′调控区的序列进行了克隆,对该区段的多态性及其与大白猪初生重和早期生长的关系进行了分析.结果表明,猪抑肌素基因5′调控区的序列存在长度多态性和单核苷酸多态性(SNP),其中,在435和447位点,由PCR-SSCP判定的2个等位基因(A和B)核苷酸序列不同:A等位基因分别为A和G,B等位基因则分别为G和A.在所检测的大白猪群体中A和B等位基因的频率分别为0.525和0.475;所检测的9头莱芜猪中4头为AA型,5头为AB型,未检测到BB型.本研究首次发现等位基因B对大白猪21日龄(P<0.01)、28日龄(P<0.05)和70日龄体重(P<0.05)以及0~21日龄(P<0.01)、0~28日龄(P<0.05)和21~70日龄(P<0.01)的日增重等早期生长性状均具有有利效应,加性效应值分别为(0.596±0.205)(P=0.0041),(0.498±0.200)(P=0.0136)和(1.409±0.551)kg(P=0.0112)以及(28.39±9.74)(P=0.0041),(17.78±7.15)(P=0.0136)和(37.00±16.92)g(P=0.0304),均达到显著或极显著水平.而对28~70日龄的日增重,尽管BB基因型个体有较高的日增重,但差异不显著(P>0.1).
关键词： 猪 肌肉生长抑制素(myostatin) 5′调控区 多态性 早期生长性状
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