科研产出
豆科植物种子大小性状相关基因及其研究进展
《基因组学与应用生物学 》 2021 北大核心 CSCD
摘要:豆科(Fabaceae)植物种类众多,在全世界范围内广泛分布,其中可食用豆类为人类提供了油脂、蛋白质、淀粉和维生素等营养物质,具有重要的社会和经济意义。豆科植物种子大小性状是决定其产量的重要因素,研究控制种子大小的关键基因及其分子调控机理,对豆科作物的高产、优质育种具有重要的理论意义和应用价值。近年来,随着全基因组测序和生物信息等技术的迅速发展,在种子大小调控机制方面取得了很多重要的研究进展,鉴定了一批调控种子大小的基因。本文通过对调控豆科植物种子大小的重要基因进行综述,为这些基因在育种中的应用提供参考。
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山东栽培豆与野生豆抗裂荚基因SHAT1-5的克隆及序列分析
《山东农业科学 》 2018
摘要:大豆的裂荚性是影响其产量的重要因素之一,因此栽培豆中豆荚开裂特性的遗传学机制成为国内外研究的热点。本研究以山东栽培豆(山宁11、山宁17、齐黄34、齐黄35和鲁0305-1)及山东野生豆(东营野生豆1、2号和山东野生豆1、2号)作为试验材料,根据已有报道,通过PCR扩增克隆了一个大豆抗裂荚基因SHAT1-5,并对该基因的序列进行多态性分析。结果显示,山东栽培豆和野生豆在SHAT1-5基因区约1 599 bp位置处,各自出现不同倍数的TAA重复。山东栽培豆与野生豆在SHAT1-5基因启动子上游4 kb关键调控区极度保守,栽培豆中不存在20 bp的缺失,这些结果与前人报道的东北栽培豆和野生豆中的情况有所不同。这表明,山东栽培豆与野生豆的裂荚性可能受其他基因的调控。
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苹果果实可溶性固形物含量相关基因的全基因组筛选与分析
《植物生理学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要:可溶性固形物含量是苹果果实品质的重要指标。在果实成熟期对苹果杂交后代的果实可溶性固形物含量进行测定,从中选择6个可溶性固形物含量低和4个含量高的植株分成2组,在转录组水平上对其果实的基因表达进行比较分析。结果筛选出14个差异表达基因,其中包括蛋白激酶基因和甲基转移酶基因,表明蛋白质磷酸化和甲基化可能和苹果果实可溶性固形物含量相关。另外,差异表达基因还包括转录因子、细胞色素b6-f复合体亚单元7、形成素类蛋白和1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶等基因。这些结果为通过深入研究找出影响苹果果实可溶性固形物含量的关键基因提供了线索,苹果果实可溶性固形物含量和上述这些基因的关系值得进一步研究。本研究还初步证实了基于转录组测序技术的数量性状集群分离分析法是可行的。
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中国荷斯坦牛GlyCAM1基因遗传多态性的研究
《黑龙江畜牧兽医 》 2009 北大核心
摘要:以273头中国荷斯坦牛为研究对象,利用CRS-PCR、PCR-SSCP及DNA测序技术检测了GlyCAM1基因外显子3、内含子3的遗传多态性。结果表明:GlyCAM1基因分别在外显子3和内含子3的第2 081(A/C)、2 417(C/T)位存在突变,2个位点的等位基因频率A/B分别为0.752 5,0.247 5和0.904 6,0.095 4;经x2适合性检验,中国荷斯坦牛内含子3的突变达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),但其外显子3的突变未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。
关键词: 中国荷斯坦牛 糖基化依赖细胞黏附分子1 基因 遗传多态性 CRS-PCR PCR-SSCP
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苹果基因邻近未知序列的PCR扩增方法
《农业生物技术学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要:利用已知基因序列设计3个巢式PCR引物p14、p15和p16,然后设计3'端为常见酶切位点、5'端为随机引物序列p17的9个酶切位点引物。用p14外引物与9个酶切位点引物进行第1轮PCR扩增,其中前5个反应采用较低的退火温度,目的是将酶切位点引物的5'端序列引入到PCR产物中,其余反应则以此PCR产物为模板采用较高的正常退火温度进行,目的是为了使整个酶切位点引物能稳定地结合到最初反应形成的产物上。为提高PCR产物的特异性和产量,用p15和p16引物分别与p17引物配对进行第2轮和第3轮PCR扩增,电泳检查发现PCR产物条带后进行纯化和测序。为保证序列的正确性,利用测得的DNA序列再设计新引物f3x,将f3x与p14(或p15)配对、直接用提取的DNA为模板进行PCR扩增和测序。利用此方法成功地获得了苹果FPPS基因邻近的启动子序列528bp和5'UTR序列142bp,并已在GenBank注册(登录号FJ263960),利用Blastn发现这是GenBank中首次发表苹果(MalusdomesticaBorkh.)法尼基焦磷酸合酶基因(FPPS)启动子序列。
关键词: 苹果 基因 邻近序列 酶切位点引物 法尼基焦磷酸合酶 启动子
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