科研产出
国际图书情报领域科学数据开放研究的主题结构与演化趋势
《图书馆研究 》 2023
摘要：科学数据开放是图书情报学科重点关注的议题，揭示其研究动态能为开放科学研究与科学决策提供智力支持。文章基于信息计量与内容分析方法，揭示国际图书情报领域科学数据开放研究的主题结构与演化趋势。研究发现，当前国际图书情报领域科学数据开放研究主要分为开放实践调研、学术影响力测度、数据质量与管理、社会影响力测度、科学数据素养教育五个研究社区，社区间交叉研究现象明显。在演化趋势上，部分研究主题演化脉络明显且持续性较好，也存在诸多断续脉络和孤立主题；未来开放实践调研和学术影响力测度研究是国际图书情报领域科学数据开放研究的主流；数据质量与管理和社会影响力测度研究有朝着体系化发展的潜力。
关键词： 图书情报 科学数据开放 开放科学 主题结构 演化趋势
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鸭甲型肝炎病毒的遗传演化分析
《家禽科学 》 2020
摘要：本研究测定了实验室2018～2019年分离的11株鸭甲型肝炎病毒1型(DHAV-1)和37株鸭甲型肝炎病毒3型(DHAV-3)的VP1基因序列,并选取代表毒株与已知阳性血清进行中和试验,分别分析DHAV-1或DHAV-3的遗传和抗原稳定性。结果表明,DHAV-1进化为两个遗传分支,2018～2019年的分离毒株分布在1b分支上,而经典DHAV-1毒株处于不同的1a分支上。DHAV-3进化为两个不同的分支,2018～2019年分离毒株大部分集中在3a分支上,个别毒株分布在3b分支上。DHAV-1或DHAV-3毒株之间均无明显的地理分布差异。血清交叉中和试验结果表明,DHAV-1或DHAV-3同一血清型之间仍具有较好的交叉保护,表明同一血清型的DHAV尚未发生抗原变异。
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山东省近60年来主推小麦品种主要农艺性状演变规律
《中国农学通报 》 2019
摘要：阐明不同年代主推小麦品种农艺性状的演变规律,可为新品种选育和栽培技术创新提供参考。本研究以山东省不同年代的50个主推品种为材料,分析农艺性状和经济系数等指标的演变规律及其相关性。结果表明,随着年代的推移,主推品种株高呈极显著的降低趋势,每次品种更替株高平均降低6.29 cm;主推品种的千粒重呈极显著的增加趋势,每次品种更替千粒重平均增加1.26 g;单茎经济产量与生物产量呈先降低后升高趋势,且二者之间呈极显著的正相关;经济系数呈显著增加趋势,每次品种更替平均增幅达24.33%;穗长、穗粒数、总小穗数、可孕小穗数年代间无明显变化趋势;单茎生物产量和经济产量的变化趋势与单产变化趋势不一致,说明协调群体与个体产量关系是提高单产的重要方向。
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2005—2017年山东省审定大豆品种农艺和品质性状演变分析
《山东农业科学 》 2018
摘要：品种更新对大豆产量提升和品质改良具有重要作用。本研究统计了2005—2017年山东省审定的41个大豆品种的10项农艺和品质指标,并对其演变情况和相关性进行分析。结果表明:山东省近年审定品种产量水平呈显著上升趋势,平均每年提高74.73 kg·hm-2,百粒重平均每年提高0.19 g,单株粒数平均每年提高2.09粒,株高、主茎节数呈下降趋势,生育期和有效分枝基本不变;高产品种单株粒数、百粒重显著较高,增加单株粒重可能是进一步提高产量潜力的关键;山东省近年审定品种蛋白含量和蛋脂总量呈上升趋势,油分稍有下滑。相关分析表明单株粒数与蛋白含量极显著负相关,百粒重与蛋白含量极显著正相关,协调产量与品质的关系将是大豆遗传改良研究的重点。
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花生DGAT基因家族的生物信息学分析
《山东农业科学 》 2018
摘要：含油量是花生最重要的品质性状之一。花生油的主要成分是三酰甘油(TAG),二酰甘油酰基转移酶(DGAT)是催化合成TAG的关键酶类,其活性高低与含油量呈正相关。本研究利用生物信息学方法对花生DGAT(Ah DGAT)基因家族的进化、基因结构特点、表达模式以及可变剪接等进行了分析。进化分析结果显示,Ah DGAT1、Ah DGAT2和Ah DGAT3亲缘关系较近,与Ah WSD/DGAT的亲缘关系稍远。Ah DGAT1具有17~18个外显子,Ah DGAT2具有7~9个外显子,Ah DGAT3具有2~3个外显子,而Ah WSD/DGAT具有3~6个外显子。Ah DGAT1的跨膜区数目为7~11个,Ah DGAT2和Ah WSD/DGAT为0~2个,Ah DGAT3没有跨膜结构。另外,4个亚家族均具有自己特有的保守结构域和表达模式。Ah DGAT1和Ah DGAT2在种子中表达量较高,而Ah DGAT3和Ah WSD/DGAT在根和叶中的表达量较高。Ah DGAT1的可变剪接形式最多,其次为Ah WSD/DGAT。花生的4个Ah DGAT亚家族具有不同的特点,表明它们可能在进化中具有不同的祖先。
关键词： 花生 二酰甘油酰基转移酶(DGAT) 进化 表达模式
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花生PDAT基因家族的全基因组生物信息学分析
《花生学报 》 2018 北大核心
摘要：磷脂二酰甘油酰基转移酶(phospholipids:diacylglycerol acyltransferase,PDAT)催化磷脂和二酰甘油反应,生成溶血磷脂和三酰甘油,是植物三酰甘油合成的关键酶之一。为了在全基因组水平上探究花生PDAT(AhPDAT)基因家族的特征,通过生物信息学方法,结合花生基因组和转录组数据对AhPDAT家族成员从系统进化、基因结构、表达模式以及可变剪接等方面进行系统分析。结果显示,AhPDAT家族包含17个成员,不均匀分布于9条染色体上。系统进化分析发现,AhPDATs与大豆、苜蓿以及菜豆聚在一起,亲缘关系较近。基因结构分析显示,AhPDATs基因具有2~8个外显子,可编码88~742个氨基酸。表达模式分析发现,AhPDATs家族成员组织表达多样化,这种表达模式的差异表明它们功能分工的不同。同时,该家族基因还存在丰富的可变剪接类型。这些结果为今后进一步开展AhPDATs基因家族的功能研究提供参考,同时也为花生品质育种奠定了一定的理论基础。
关键词： 花生 二酰甘油酰基转移酶 进化 表达模式 可变剪接
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中国禽源新城疫病毒(NDV)流行株F和HN基因的遗传演化和变异频率
《微生物学通报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：【目的】新城疫(ND)是中国流行最严重的疫病之一,对家禽业可造成巨大的经济损失,疫苗防控是控制ND的重要措施。新城疫病毒(NDV)流行株的遗传演化一直是研究NDV的焦点。本文利用分子信息学手段,通过比较近20年间NDV流行株不同基因型F和HN基因的分子特征和遗传变异频率,解析免疫压力下NDV的演化规律。【方法】利用Lasergene 7.1和MEGA5.1软件,选取本实验室89株NDV分离株,结合从Gen Bank下载的364株NDV流行株以及15株NDV经典毒株的基因序列,对其进行系统发育、分子特征和替代频率分析。【结果】系统发育表明,NDV已经演化为15个基因型。一致性比较显示,NDV流行株相同基因型之间核苷酸(氨基酸)高度同源,而不同基因型之间差异较大且存在明显的氨基酸变异积累。NDV基因型的分布与时间、地域密切相关,VII d亚型为中国NDV优势流行株。为评估NDV变异的频率,以Go/GD/QY/1997株(中国较早发生的基因VII亚型)为参照,1997-2015年间NDV的F/HN基因的年平均核苷酸(氨基酸)替代率为2.31×10~(-3)(2.26×10~(-3))/3.37×10~(-3)(2.35×10~(-3))。其中,1997-2001年(未使用基因VII型疫苗)F/HN基因核苷酸年平均替代率为4.72×10~(-3)/8.28×10~(-3);2002-2015年(疫苗使用后)为1.6×10~(-3)/1.84×10~(-3),显示出基因VII型疫苗在控制NDV变异速度方面具有明显的效果。【结论】生物信息学分析证实:研制出与NDV流行毒株相匹配的新型疫苗是控制当前NDV变异的关键。
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番茄和马铃薯CIPK3基因的鉴定和特征分析
《天津农业科学 》 2017
摘要：为了研究番茄和马铃薯CIPK3基因的功能,利用生物学信息学的方法从番茄和马铃薯的基因组中分别鉴定出2个与拟南芥CIPK3同源的基因,并对这些基因的结构特征、系统进化和顺式元件进行了系统分析。结果表明,番茄和马铃薯的2个CIPK3基因均与拟南芥的CIPK3直系同源,且都含有14个外显子,编码区大小相似,编码蛋白预测都位于细胞膜上且含有的基序类型相同;在它们的编码区上游序列中均存在多个激素和逆境应答元件,暗示它们在激素和逆境应答中具有一定功能。
关键词： 番茄 马铃薯 CIPK3 基因特征 进化 顺式元件
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华北夏谷区近30年来主要谷子育成品种农艺和品质性状演变分析
《山东农业科学 》 2017
摘要：为给谷子品种选育提供理论依据,对华北夏谷区近30年来育成的20个代表性谷子品种的农艺和品质性状演变情况进行分析。结果表明:该时段内这些谷子品种的产量呈上升趋势,平均每年提高29kg/hm2,穗长、穗重、穗粒重、茎粗呈上升趋势,穗粗、株高呈下降趋势,株高降低、茎粗增粗提高了谷子品种的抗倒伏能力。相关分析表明,各性状与产量的相关系数由大到小依次是穗长﹥穗粗﹥单穗粒重﹥单穗重﹥株高﹥茎粗﹥抽穗日数﹥千粒重,其中抽穗日数、千粒重对产量影响不大。华北地区近年来育成品种的营养品质改善较小,应当加以关注。
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