您好,欢迎访问山东省农业科学院文献资源数据库平台

花生DGAT基因家族的生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 郑玲 1 ; 单雷 2 ; 李新国 2 ; 郭峰 2 ; 孟静静 2 ; 万书波 2 ; 彭振英 3 ;

作者机构: 1.山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室;山东省农业科学院

2.;山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室;山东省农业科学院

3.;山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室;山东省农业科学院;

关键词: 花生;二酰甘油酰基转移酶(DGAT);进化;表达模式

期刊名称: 山东农业科学

ISSN: 1001-4942

年卷期: 2018 年 06 期

页码: 10-18

摘要: 含油量是花生最重要的品质性状之一。花生油的主要成分是三酰甘油(TAG),二酰甘油酰基转移酶(DGAT)是催化合成TAG的关键酶类,其活性高低与含油量呈正相关。本研究利用生物信息学方法对花生DGAT(Ah DGAT)基因家族的进化、基因结构特点、表达模式以及可变剪接等进行了分析。进化分析结果显示,Ah DGAT1、Ah DGAT2和Ah DGAT3亲缘关系较近,与Ah WSD/DGAT的亲缘关系稍远。Ah DGAT1具有17~18个外显子,Ah DGAT2具有7~9个外显子,Ah DGAT3具有2~3个外显子,而Ah WSD/DGAT具有3~6个外显子。Ah DGAT1的跨膜区数目为7~11个,Ah DGAT2和Ah WSD/DGAT为0~2个,Ah DGAT3没有跨膜结构。另外,4个亚家族均具有自己特有的保守结构域和表达模式。Ah DGAT1和Ah DGAT2在种子中表达量较高,而Ah DGAT3和Ah WSD/DGAT在根和叶中的表达量较高。Ah DGAT1的可变剪接形式最多,其次为Ah WSD/DGAT。花生的4个Ah DGAT亚家族具有不同的特点,表明它们可能在进化中具有不同的祖先。

  • 相关文献

[1]花生PDAT基因家族的全基因组生物信息学分析. 田海莹,单雷,李新国,郭峰,张智猛,孟静静,万书波,彭振英. 2018

[2]不同含油量花生品种中二酰甘油酰基转移酶基因的表达分析. 潘丽娟,许静,王秀贞,姜骁,陈娜,王通,殷祥贞,杨伟强,迟晓元. 2023

[3]花生FAT基因家族的全基因组分析. 张会,单雷,李新国,郭峰,孟静静,万书波,彭振英. 2018

[4]花生NRT1基因对盐胁迫的响应. 孔伟伟,田丽彬,李荣冲,肖丽娜,崔凤,刘译阳,李国卫,万书波. 2019

[5]花生中DREB类转录因子PNDREB1的克隆及鉴定. 张梅,刘炜,毕玉平,王自章. 2009

[6]花生白藜芦醇合成酶基因PNRS1的克隆及其在原核中的表达. 韩晶晶,刘炜,毕玉平. 2010

[7]花生生长素原初响应基因PNIAAs的表达模式分析. 任怡怡,戴绍军,刘炜. 2012

[8]花生FAD基因家族的全基因组鉴定与表达模式分析. 阮建,单雷,李新国,郭峰,孟静静,万书波,彭振英. 2018

[9]花生结瘤起始因子基因鉴定及其对氮肥的响应. 田丽彬,刘译阳,张佳蕾,李荣冲,崔凤,万书波,李国卫. 2020

[10]奶牛SLAMF7基因在健康牛和乳腺炎牛中可变剪切体的鉴定与表达研究. 鞠志花,王长法,李秋玲,李建斌,黄金明,仲跻峰. 2011

[11]SOS应答系统及其对细菌耐药性和毒力的调控作用与在治疗细菌感染中的应用. 王进文,白华,颜世敢,胡明,刘玉庆. 2014

[12]近20年中国部分地区鸡源H9N2亚型禽流感病毒HA基因遗传演化及其变异频率. 孟芳,徐怀英,张伟,黄迪海,张再辉,刘霞,常维山,秦卓明. 2016

[13]番茄和马铃薯CIPK3基因的鉴定和特征分析. 马蕾,王施慧,刘淑梅,郎丰庆,纪复勤,李利斌,侯丽霞. 2017

[14]甜瓜CBL基因的鉴定和特征分析. 刘明毓,纪复勤,马强,胡向树,李利斌,董玉梅. 2015

[15]两个玉米新CIPK基因的鉴定. 巩东营,方志军,赵苏娴,刘铁山,刘强,李利斌. 2011

[16]大白菜、甘蓝和黑芥CBL1基因的比较分析. 李化银,姜常松,张一卉,高建伟,李利斌,曹齐卫. 2014

[17]两个甘蓝CBL基因的基因组解析. 陈伟,范华,刘贤娴,李利斌,王淑芬. 2011

[18]瑞典鸡传染性支气管炎新毒株变异的研究. 李晓柳,李桂明(译),林树乾,徐凌川(校). 2013

[19]WRKY转录因子在植物盐胁迫应答中的作用(英文). 陈明娜,陈娜,王冕,迟晓元,潘丽娟,王通,杨珍,禹山林. 2015

[20]AhSOS2转基因水稻基因表达及抗逆性分析. 李颖秀,张国嘉,王莹莹,王庆国,王一帆,李臻,潘教文,刘炜. 2017

作者其他论文 更多>>