科研产出
四个玉米自交系根系内生细菌的分离和鉴定
《作物杂志 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：对4个玉米自交系(PH4CV、PH6WC、郑58和昌7-2)根系中的内生细菌进行分离和鉴定,为获得有益微生物资源奠定基础。通过形态学观察、生理生化特征鉴定及16S r DNA基因序列同源性分析和构建系统发育树等方法对分离菌株进行生物学鉴定,以确定其种属。共分离到23株内生细菌,鉴定为6个属,包括芽孢杆菌属(Bacillus sp.)、假单胞菌属(Pseudomonas sp.)、寡养单胞菌属(Stenotrophomonas sp.)、肠杆菌属(Enterobacter sp.)、贪噬菌属(Variovorax sp.)、鞘氨醇杆菌属(Sphingobacterium sp.),其中优势属为芽孢杆菌属。4个玉米自交系内生细菌的种类不同,细菌种类由多到少依次是PH6WC、郑58、PH4CV和昌7-2。通过对不同玉米自交系内生细菌的比较分析,发现内生细菌的种类和数量与玉米基因型相关。
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山东不同地区韭菜迟眼蕈蚊共生菌Wolbachia的检测及鉴定
《昆虫学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：【目的】为了揭示山东省韭菜迟眼蕈蚊Bradysia odoriphaga Yang et Zhang种群共生菌Wolbachia的感染率及其分类地位,探讨该共生菌对韭菜迟眼蕈蚊的潜在影响。【方法】利用线粒体细胞色素氧化酶I(mt COI)基因引物(LCO1490/HCO2198),通过扩增测序和序列比对对采自山东省12个地区的根蛆种群进行了分类鉴定。在上述基础上,利用Wolbachia的16S r DNA和wsp基因特异引物(分别为16S-F/16S-R和81F/691R)对鉴别出的11个韭菜迟眼蕈蚊种群体内Wolbachia感染情况进行了PCR检测;对感染个体体内Wolbachia依据16S r DNA基因片段序列进行分类鉴定。【结果】山东省12个根蛆种群中,11个种群为韭菜迟眼蕈蚊种群。基于Wolbachia的16S r DNA基因特异引物检测结果发现,这些韭菜迟眼蕈蚊种群广泛感染Wolbachia(感染率为6.67%~93.33%),而利用wsp基因特异引物检测的感染率(0.00%~40.00%)相对较低些。基于Wolbachia的16S r DNA基因构建系统发育树表明,这些韭菜迟眼蕈蚊种群感染的Wolbachia全部属于A组。【结论】确定了Wolbachia在山东省韭菜迟眼蕈蚊体内的感染率及其分类地位,为研究Wolbachia对韭菜迟眼蕈蚊生物学及生态学的影响奠定了基础。
关键词： 韭菜迟眼蕈蚊 分子鉴定 Wolbachia 16S rDNA wsp 山东
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烟草根际固氮菌的筛选、鉴定及优化培养
《中国烟草学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：对四川广元烟草主产区三个种植基地的烟草根际固氮菌进行筛选,分离出28株具有固氮活性的菌株。经扩增r DNA限制性酶切片段分析法(ARDRA)初步分类,共获得5个操作分类单元(OTU),并由16S rDNA序列进行了分析鉴定。结果表明不同分类单元分别是:苏云金芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、甲基营养型芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌和炭疽杆菌。优化了N7菌株(巨大芽孢杆菌)培养条件,确定其最佳碳源为蔗糖,最适宜初始pH值为7.5,最适温度为30℃。
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产蛋白酶和淀粉酶芽孢杆菌SDYB-1的分子鉴定及酶学性能研究
《山东农业科学 》 2015
摘要：对筛选到的一株产蛋白酶和淀粉酶的芽孢杆菌SDYB-1进行分子鉴定和酶学性能研究。克隆了SDYB-1菌株的16S r DNA序列,该序列全长1 548 bp。BLAST显示该菌株与枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)同源。以同源性为基础构建了相关属种的系统发育树,该菌株在进化关系上也与枯草芽孢杆菌聚成一族。结合形态学、生理生化特征及16S r DNA分子鉴定,将其鉴定为枯草芽孢杆菌,命名为Bacillus subtilis SDYB-1。对枯草芽孢杆菌SDYB-1产酶性能研究表明,蛋白酶活性在接种4 h后快速升高,16 h达到最高值,之后快速下降;淀粉酶活性随培养时间不断增加,至24 h达到最高值,之后快速下降。SDYB-1蛋白酶活性的最适反应温度为60℃,50℃下的稳定性较好;最适p H为8.5,p H 8.5时比较稳定。淀粉酶的最适反应温度为70℃,50℃下表现了很强的稳定性,50 min仍保持原有酶活的97%;最适p H为5.6,在p H 4.6~7.0范围内比较稳定。
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羽毛降解菌的分离及多样性分析
《山东农业科学 》 2014
摘要：从禽肉加工厂的污泥中分离到174株能在牛奶琼脂平板产透明圈微生物菌株,其中42株具有分解羽毛的能力,从中筛选出13株具有较强羽毛降解能力的菌株,均能在48 h内将羽毛完全分解。16S rDNA的BLAST比对及系统发育树分析结果显示,8株菌为寡养单胞菌属(Stenotrophomonas),1株菌为芽孢杆菌属(Bacillus),4株菌为气单胞菌属(Aeromonas)。
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产广谱抗菌物质芽孢杆菌的筛选与鉴定
《中国农学通报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：旨在筛选出对果蔬病原菌具有广谱拮抗作用的芽孢杆菌。以9株病原真菌和3株病原细菌为指示菌,采用琼脂平板扩散法,通过初筛和复筛,筛选得到一株具有广谱抑菌作用的拮抗芽孢杆菌NCPSJ7。结合形态学、生理生化和16S rDNA序列同源性分析等手段,该菌株被鉴定为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus Amyloliquefaciens)。抑菌谱实验表明,解淀粉芽孢杆菌NCPSJ7对果蔬病原真菌和病原细菌都具有较强的抑菌能力。该菌株产抗菌物质的适宜发酵培养基、发酵条件优化,抗菌物质的分离纯化、组成、性质和抗菌稳定性等还有待于进一步研究。
关键词： 解淀粉芽孢杆菌 生物防治 抗菌物质 抗菌谱 16S rDNA
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铃木氏果蝇不同地理种群中Wolbachia的检测和系统发育分析
《昆虫学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：铃木氏果蝇Drosophila suzukii是原产于东南亚地区的重要果树害虫,近年来传入北美和欧洲等地区造成严重的危害。本研究利用Wolbachia的16S rDNA和wsp基因特异引物(分别为16S-F/16S-R和81F/691R)对铃木氏果蝇7个地理种群(中国的5个种群、韩国的1个种群和美国的1个种群)的Wolbachia进行了PCR检测并对检测结果进行了比较;对感染个体体内Wolbachia的16S rDNA基因片段进行测序,确定了我国铃木氏果蝇体内Wolbachia的分类地位。基于Wolbachia的16S rDNA基因特异引物检测结果发现,我国5个铃木氏果蝇种群广泛感染Wolbachia(感染率36.7%～80.0%),而韩国和美国2个种群均未检测到该菌的感染。而利用wsp基因特异引物无法检测到该菌。基于Wolbachia的16S rDNA基因构建系统发育树表明,我国铃木氏果蝇种群感染的Wolbachia全部属于A组。这些结果为研究Wolbachia感染对铃木氏果蝇生物学及生态学的影响奠定了基础。
关键词： 铃木氏果蝇 地理种群 内共生菌 Wolbachia 16S rDNA wsp 系统发育分析
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玉米叶面微生物DNA提取方法及PCR引物的筛选
《山东农业科学 》 2012
摘要：传统的微生物培养方法在反映叶面微生态信息上具有局限性,因此逐渐被分子生态学所代替,而获得高质量、大片段、无偏好的总DNA是研究叶面环境微生物的基础。本文采用改进的Sambrook法、CTAB法、改良的化学法以及试剂盒法对玉米生长初期、中期、末期的叶面微生物总DNA进行提取,并对4种方法提取的DNA片段的大小和产量进行综合评价。将得到的DNA用引物357/518以及984/1387对细菌16S rDNA进行扩增;用5种常见引物NS1/fung、ITS1-F/ITS2、NS1/AM1、EF4/fung5、SSU-0817/SSU-1196对真菌18SrDNA进行扩增。结果表明:4种方法提取的DNA片段均适用于PCR,但DNA的得率和纯度有一定差别,其中以试剂盒提取效果最好。PCR结果显示,除化学法外,其他3种方法提取的DNA均能够获得目的条带;并通过比较得出引物984/1387对16S rDNA以及ITS1-F/ITS2对18S rDNA扩增效果较好且扩增量最大。
关键词： 玉米 叶面微生物 DNA提取 PCR 16SrDNA 18SrDNA
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