科研产出
天目多胎羊羔羊期体重性状遗传分析
《中国农业大学学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为进一步提高天目多胎羊的生长性能和育种效率，收集2013—2022年天目多胎羊18 534条断奶前体重数据，分析影响天目多胎羊羔羊期体重性状的非遗传因素，利用DMU软件估计遗传参数和育种值，分析其遗传趋势和表型趋势。结果表明：1）性别、出生年份和出生季节对天目多胎羊羔羊期体重性状均影响极显著（P<0.01）；出生类型对断奶前克莱伯比率具有显著（P<0.05）影响，对其他性状具有极显著影响。2）初生重为中等遗传力性状，直接遗传力为0.18±0.03，母体遗传力为0.13±0.02；断奶重、断奶前平均日增重和断奶前克莱伯比率属于低遗传力性状，直接遗传力分别为0.06±0.02、0.06±0.02和0.02±0.01，母体遗传力估计值分别为0.07±0.01、0.07±0.01和0.09±0.01。3）除初生重与断奶前克莱伯比率之间为负的遗传相关与表型相关外，其余各性状间均为正遗传与表型相关。4）初生重的平均育种值整体呈现下降趋势，平均表型值呈先上升后下降的趋势；断奶重的平均育种值与平均表型值均先下降后上升；断奶前平均日增重和断奶前克莱伯比率的平均育种值先下降后上升又下降终上升，平均表型值先下降后上升。5）初生重、断奶重、断奶前日增重和断奶前克莱伯比率的遗传进展分别为-0.013 kg/a、-0.005 kg/a、-0.001 g/（d·a）和0.005；表型进展分别为0.066 kg/a、0.218 kg/a、3.388 g/天/a和0.092。综上，本研究可对天目多胎羊当前育种方案进行优化调整，进一步稳定其优良遗传性能，提高育种效率，节约饲养成本，为天目多胎羊的科学早期选育、提高生长性能和群体遗传稳定性提供理论依据。
关键词： 天目多胎羊 羔羊期体重性状 遗传参数 育种值 遗传趋势
全文链接
请求原文
猕猴桃扩展蛋白基因家族鉴定及不同胁迫表达
《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：扩展蛋白是细胞壁的重要组成部分，具有疏松细胞壁、增加细胞壁柔韧性的作用，广泛存在于植物基因组中。本研究以中华猕猴桃(Actinidia chinensis)‘红阳’基因组序列为基础，通过毛果杨扩展蛋白序列进行特征结构域比对从而获得猕猴桃扩展蛋白序列信息。通过生物信息和密码子分析软件对猕猴桃扩展蛋白基因进行研究，从而得到基因家族特征和密码子偏好信息。猕猴桃扩展蛋白基因家族包含39个成员，分属于AcEXPA (28)、AcEXPB (6)、AcEXPLA (1)和AcEXPLB (4) 4个亚家族，其中的36个成员定位于22个染色体中。氨基酸组成分析显示，Gly含量最高(11.74%)，而His含量最低(1.91%)。密码子特性分析显示，猕猴桃扩展蛋白第3位碱基更偏好使用嘧啶类，序列GC值趋向于平均使用。通过同义密码子相对使用频率分析发现，扩展蛋白共有高频密码子8个，且均以G/C碱基结尾。对猕猴桃植株进行逆境胁迫处理后分别有3、14、7、6个基因参与低温、高温、干旱和盐胁迫响应。通过对猕猴桃扩展蛋白基因家族的鉴定和密码子用法及功能分析有利于认识其在猕猴桃基因组中的组成特点、表达效率特点，也为今后扩展蛋白在猕猴桃中的作用以及异源表达研究提供一定基础。
关键词： 猕猴桃(Actinidia chinensis) 扩展蛋白 基因家族 密码子偏性 基因功能
全文链接
请求原文
不同通风策略下大规模鸭粪堆肥的腐熟和光谱特征（英文）
《植物营养与肥料学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】鉴于鸭粪处理的固有挑战，有效的通风措施是鸭粪工业堆肥过程成功的关键。这项开创性的研究旨在评估来自鸭粪和蘑菇废弃物堆肥的腐熟度和稳定性。本研究进一步探讨了各种通风策略在促进堆肥过程中有机物分解和转化方面的有效性和效率。【方法】将鸭肥和蘑菇废弃物按干重比为2∶1 (C/N约为21.15)混合进行堆肥试验。堆肥采用梯形桩，每桩体积5.6 m~3，采用管道通风。堆肥试验包括4个通气时间处理，分别为10、20、30、60 min/d (分别记作C1、C2、C3和C4处理)。主要研究了堆肥过程中物理化学特性、紫外-可见光谱、X射线衍射(XRD)和红外光谱(IR)的变化特征。【结果】在堆肥第5天和第6天，堆肥进入嗜热期，持续17天，第15天达到50℃。在堆肥前5天，堆肥pH从8.5迅速上升到12.3，可能是由于鸭粪蛋白质的分解，然后在接下来的20天里逐渐下降，在28～30天急剧下降，之后逐渐下降。在高温期(第17天)后，堆肥C1、C2、C3和C4处理的含水量较堆肥初期分别减少了45.9%、46%、44.7%和43%。C3和C4处理的TC值远低于C1和C2。所有堆肥处理的紫外吸收均随波长的增加而降低。在X射线衍射图中存在部分纤维素特征峰(2θ=26.56°)。这些样品含有更多的结晶和“无定形”纤维素、木聚糖和其他多糖。在200～220 nm光谱范围内，硝酸盐和羧基类化学物质的吸收速度比芳香族或不饱和分子快。堆肥的吸收率随初始碳氮比和堆肥过程的持续时间而变化。相反，在460～480 nm处的吸光度表明有机材料的腐殖质化。Q2/6或Q4/6值越低，表明有机物腐殖化程度越高和越多的有机物缩合成芳香族化合物。在红外光谱中，整个堆肥过程中与有机或无机官能团相关的所有条带的强度都有明显的变化。红外光谱显示出一个宽峰，中心波数为3400 cm~(-1)，表明存在与羟基(OH)基团和水分子相关的拉伸振动。在3000～2800 cm~(-1)的光谱范围内，可以观察到一个与有机化合物所表现出的疏水特性相关的现象。在2900～2850 cm~(-1)处存在的条带可以归因于C-H脂肪族基团和醛基基团(CHO)的伸缩振动。初始堆肥样品和C1、C2、C3、C4的红外光谱在堆肥过程中发生了显著变化。由于这些变化，红外光谱吸收带发生了显著的变化，表明相关的物质结构发生了变化。因此，C3和C4在堆肥过程中表现出较高程度的稳定性。【结论】65天的堆肥试验显示，在整个堆肥过程中，温度发生变化，通风60 min/d的堆肥最高温度高于通风10 min/d的堆肥。在堆肥过程中，随着通气量的增加，pH呈下降趋势，因此，日通风30～60 min的堆肥pH较低。堆肥过程中，堆料C/N逐渐降低，表明纤维素活性增加。XRD光谱显示峰值强度降低，反映了纤维素的分解。日通风30～60 min堆肥表现出较高的成熟度，突出了通风对成功堆肥的重要性。
全文链接
请求原文
小麦TaHKT家族基因的生物信息学分析
《麦类作物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：高亲和性钾离子转运蛋白（high-affinity K+ transporter, HKT）是植物体内一种非常重要的离子转运蛋白，具有运输Na+/K+的能力，在植物响应盐胁迫过程中发挥重要作用。为系统了解小麦TaHKT家族基因，挖掘有效的小麦耐盐基因，本研究采用生物信息学的方法，对小麦TaHKT家族基因进行了全基因组分析，鉴定了家族成员，构建了系统进化树，并对其跨膜结构域、染色体定位、基因结构、Motif、上游顺式作用元件、共线性以及表达谱等进行了分析。结果鉴定出23个TaHKT基因，其编码蛋白质长度为443～590 aa,等电点范围8.2～10.4,跨膜结构域为6～8个。23个基因分布于小麦的2、4、6、7号染色体上，根据亲缘关系可将其分为3个亚族，同一亚族的成员具有较为相似的Motif组成和基因结构。23个基因中，发现了4对串联重复基因，10对大片段复制基因，具有良好的共线性。顺式作用元件分析发现，大部分TaHKT成员含有盐胁迫响应元件MYB、G-box、ABRE和DRE。表达谱分析发现，TaHKT基因在小麦的16种组织中均有表达，在根、茎中的表达量较高，其中TraesCS4D02G361300（ID,下同）在根中的表达量最高。在盐胁迫处理后，不同成员对盐胁迫响应程度不同，TraesCS7B02G318400在盐胁迫处理后表达量逐渐降低；TraesCS2B02G451400和TraesCS2D02G428200在盐胁迫处理后的表达量也明显降低；TraesCS2B02G451800在根部几乎不表达，但在受到盐胁迫处理后表达量逐渐提高，推测它们在小麦抵御盐胁迫过程中发挥不同作用。
关键词： 小麦 TaHKT 生物信息学 基因家族分析 盐胁迫
全文链接
请求原文
日粮中添加不同水平透明质酸钠对猫肠道微生物区系的影响
《中国畜牧杂志 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：试验旨在研究日粮中添加透明质酸钠(SH)对猫肠道微生物区系的影响.试验选取 40 只成年临清狮猫,随机分成 4 组,分别为对照组、164 mg/kg SH组、328 mg/kg SH组和 656 mg/kg SH组,每组 10 个重复,每个重复 1 只.预试期 5 d,正试期 60 d.结果表明:日粮中添加透明质酸钠未对猫粪便评分产生显著影响;相较于对照组,328 mg/kg SH组和 656 mg/kg SH组猫肠道微生物观测物种数目、ACE指数以及Chao1 指数降低(P<0.05);相较于对照组,各SH组变形菌门丰度均降低(P<0.05),656 mg/kg SH组猫肠道厚壁菌门丰度提高(P<0.05);属水平上,328 mg/kg SH组Eubacterium nodatum group以及毛螺菌属NK4A136 组(Lachnospiraceae NK4A136 group)高于对照组(P<0.05);656 mg/kg SH组丁酸菌属(Butyricicoccus)、Ruminococcus gnavus group、肠球菌属(Enterococcus)、Fournierella、瘤胃球菌属(Ruminococcus)丰度高于对照组(P<0.05),鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)丰度降低(P<0.05);PICUIST功能预测结果显示,日粮中添加SH会增加猫肠道微生物中能量代谢、碳水化合物代谢以及细胞运动的相关通路丰度.由此可见,日粮中添加SH会提高丁酸菌属、肠球菌属、瘤胃球菌属等有益菌群丰度,降低有害菌群丰度,具有保护猫肠道的功效.
关键词： 透明质酸钠 临清狮猫 肠道微生物区系 16S rDNA测序
全文链接
请求原文
牦牛基因组拷贝数变异研究进展
《畜牧兽医学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：拷贝数变异（copy number variation, CNV）是基因组结构变异（structural variation, SV）的重要组成部分。与SNP（single nucleotide polymorphism）相比，CNV显示出更丰富的复杂遗传变异，在家畜重要经济性状遗传机理、疾病诱因和物种进化等研究方面具有重要意义。牦牛作为青藏高原的重要牛种，近年来随着高通量测序技术的快速发展和参考基因组的不断升级，其全基因组水平上CNV的研究获得重要进展。本文在阐述基因组CNV的形成原理、作用机制和检测方法基础上，综述了近10年来牦牛基因组CNV的研究现状，分析探究了存在的一些问题与不足，并对其未来的发展和应用趋势进行了展望，以期为深入开展牦牛基因组研究和加速牦牛遗传资源的分子育种进程提供参考。
关键词： 牦牛 基因组 拷贝数变异（CNV）
全文链接
请求原文
不同盐度和氮磷浓度条件下海马齿对水体氮磷的吸收效果及其生长响应
《海洋湖沼通报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：耐盐植物在海水养殖尾水处理和海水农业中具有重要作用。为了探究海马齿的耐盐能力和氮磷净化能力，本研究开展了海马齿盐度和氮磷处理的室内水培实验。盐度实验分别在盐度为0、10、20、30和35的霍格兰营养液中进行，氮磷实验分别在N:0（P:0.5）mg/L、N:1（P:0.1）mg/L、N:5（P:0.5）mg/L、N:20（P:2）mg/L和N:50（P:5）mg/L的人工海水中培养，周期为20 d。结果显示：1)在中、低盐度（0～20）条件下，海马齿对氮、磷的吸收效果明显，而在高盐度（30～35）条件下，其对氮磷的吸收作用明显弱于中低盐度组（P＜0.05）。2)海马齿Na+含量随盐度的升高而不断增加，而K+含量则随着盐度的增加呈现下降的趋势；氮磷浓度对海马齿Na+、K+含量的影响不明显。3)在氮磷实验浓度范围内，海马齿都能正常生长并显示了较高的氮磷吸收能力，明显降低了水体中的氮磷浓度。表明海马齿有较强的耐盐能力，并能有效净化富营养化水体，可用于海水养殖尾水净化，改善养殖环境。
全文链接
请求原文
多样化种植对提升耕地质量的作用:进展与展望
《土壤学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：多样化种植是现代生态农业的重要举措之一,对提高生物多样性、生态服务功能和土壤质量等具有重要意义.在全球粮食供给紧张和耕地短缺背景下,多样化种植在提升我国耕地质量和保障粮食安全中将会发挥越来越重要的作用.但现有研究对多样化种植的理解多集中在提高生物多样性和发挥生态功能等方面,对其提升耕地质量的作用关注较少,特别是多样化种植如何通过改善土壤物理、化学、生物多样性来提高耕地质量和维持土壤健康方面的理解还较为局限.本文在总结多样化种植的内涵及对促进耕地土壤健康和提高生态服务功能作用的基础上,系统梳理了多样化种植对改善土壤物理、化学、生物多样性等方面的作用研究进展,展望了未来以提升耕地质量为核心发展多样化种植亟需关注的方向和研究重点,以期为多样化种植在我国耕地质量提升策略中发挥更大作用提供参考.
全文链接
请求原文
楸子叶片酵母文库构建及甘油二酯激酶MpDGK7互作蛋白鉴定
《核农学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为探究MpDGK7参与调控苹果对非生物胁迫响应的机制，本研究通过构建苹果属植物楸子（Malus prunifolia）叶片的酵母双杂交cDNA文库，筛选与甘油二酯激酶MpDGK7互作的蛋白并进行验证。结果显示，本研究构建的cDNA文库库容达到1.5×107 CFU，重组率100%，平均插入片段长度大于1 200 bp。利用MpDGK7构建诱饵载体pBT3-N-MpDGK7，质粒无毒性且不存在自激活，通过共转化方法从文库中筛选到13个与MpDGK7互作的蛋白。选取4个代表性互作蛋白（KAN4、MYC2、BTB/POZ和金属硫蛋白）进行点对点验证，发现它们均与MpDGK7发生互作。双分子荧光互补（BiFC）验证结果表明，MpKAN4与MpDGK7互作主要发生在细胞膜和细胞核上，MpBTB与MpDGK7互作主要发生在细胞膜上。因此，推测MpDGK7可能通过参与KAN4、MYC2、BTB/POZ和金属硫蛋白等介导的胞内信号转导过程来影响苹果对逆境胁迫的响应。本研究结果为进一步阐明DGK基因参与苹果抗逆分子调控的机理奠定了基础。
关键词： 苹果 MpDGK7 酵母双杂交 双分子荧光互补 蛋白互作
全文链接
请求原文
早/晚抽薹性大白菜自交系中光敏色素B及光周期关键基因的动态研究
《华北农学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：光周期是影响植物抽薹开花最重要的环境因子之一，光周期信号通过植物的光敏色素蛋白调控植物的抽薹开花，其中PHYB介导的信号网络对植物抽薹开花有重要的抑制作用。前期研究发现，大白菜耐抽薹材料06-247与易抽薹材料He102的PHYB基因启动子存在大片段插入/缺失差异，为了进一步研究启动子突变对PHYB及其下游途径关键基因的影响，以耐抽臺材料06-247与极易抽臺材料He102为试验材料，采用生物信息法分析了大白菜基因组中光敏色素基因的冗余特点，发现大白菜基因组包含6个光敏色素基因，其中PHYA有2个拷贝，PHYB、PHYC、PHYD和PHYE都仅有1个拷贝。进一步通过氨基酸序列比对筛选出了PHYB的特异序列、设计了抗原决定簇并制备了抗大白菜PHYB的特异抗体，采用荧光定量RT-PCR技术和Western Blot技术研究了06-247与He102中PHYB的相对含量，同时比较了PHYB下游光周期通路关键调控基因CCA1、FLC、CO和FT的动态变化。结果表明：启动子突变造成PHYB在06-247中表达水平显著升高并进而造成PHYB蛋白水平显著升高，同时下游调控基因CCA1、FLC、CO和FT均在06-247中高水平表达，这对06-247的耐抽薹特性有重要影响。
全文链接
请求原文
