您好，欢迎访问山东省农业科学院文献资源数据库平台

猕猴桃扩展蛋白基因家族鉴定及不同胁迫表达

文献类型： 中文期刊

作者： 李健 1 ; 尹鹏 2 ; 王海荣 1 ; 安淼 1 ; 李国田 1 ;

作者机构： 1.山东省果树研究所

2.北京林业大学生物科学与技术学院

关键词： 猕猴桃(Actinidia chinensis);扩展蛋白;基因家族;密码子偏性;基因功能

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2024 年 22 卷 015 期

页码： 4930-4945

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 扩展蛋白是细胞壁的重要组成部分，具有疏松细胞壁、增加细胞壁柔韧性的作用，广泛存在于植物基因组中。本研究以中华猕猴桃(Actinidia chinensis)‘红阳’基因组序列为基础，通过毛果杨扩展蛋白序列进行特征结构域比对从而获得猕猴桃扩展蛋白序列信息。通过生物信息和密码子分析软件对猕猴桃扩展蛋白基因进行研究，从而得到基因家族特征和密码子偏好信息。猕猴桃扩展蛋白基因家族包含39个成员，分属于AcEXPA (28)、AcEXPB (6)、AcEXPLA (1)和AcEXPLB (4) 4个亚家族，其中的36个成员定位于22个染色体中。氨基酸组成分析显示，Gly含量最高(11.74%)，而His含量最低(1.91%)。密码子特性分析显示，猕猴桃扩展蛋白第3位碱基更偏好使用嘧啶类，序列GC值趋向于平均使用。通过同义密码子相对使用频率分析发现，扩展蛋白共有高频密码子8个，且均以G/C碱基结尾。对猕猴桃植株进行逆境胁迫处理后分别有3、14、7、6个基因参与低温、高温、干旱和盐胁迫响应。通过对猕猴桃扩展蛋白基因家族的鉴定和密码子用法及功能分析有利于认识其在猕猴桃基因组中的组成特点、表达效率特点，也为今后扩展蛋白在猕猴桃中的作用以及异源表达研究提供一定基础。

  • 相关文献

[1]食用菌遗传操作技术与基因功能的研究进展. 韩伟. 2011

[2]集胞藻Synechocystis sp. PCC 6803 slr1501的克隆及原核表达分析. 张燕,岳寿松,陈高,游银伟,钟怀荣,于金慧. 2019

[3]VIGS技术及其在棉花功能基因组研究中的应用进展. 张景霞,王芙蓉,高阳,张军. 2015

[4]基因沉默技术及其在棉花中的应用. 李婷,孔祥强,董合忠. 2016

[5]陆地棉蔗糖转运蛋白基因家族的鉴定及表达分析. 晁毛妮,王斌,陈煜,张金宝,孙新凯,王清连. 2020

[6]水稻干扰素相关发育调节因子的生物信息学分析. 和亚男,李稳,尹俊雅,谢先芝. 2021

[7]大白菜GIF蛋白家族的生物信息学分析. 王凤德,李利斌,李化银,刘立峰,高建伟. 2012

[8]类蛋白Tubby基因家族研究进展. 徐佳宁,刘钢,张利云,高建伟. 2016

[9]炭疽菌属真菌的基因组学研究进展. 马亚男,张勇,韩双,刘宁,余贤美,翟浩. 2018

[10]花生GSTs家族基因的全基因组分析. 王通,迟晓元,王冕,潘丽娟,陈明娜,陈娜,焦坤. 2019

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：山东省农业科学院文献资源数据库平台

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台