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猕猴桃MYB家族成员鉴定及其低温表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 毛可欣 1 ; 安淼 1 ; 王海荣 1 ; 王世金 2 ; 吕巍 3 ; 郭盈添 1 ; 李健 1 ; 李国田 1 ;

作者机构: 1.山东省果树研究所

2.北方奇异果(日照)技术研究院

3.山东农业大学

关键词: 猕猴桃;MYB家族;密码子偏好性;低温胁迫;表达

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2023 年 003 期

页码: 534-548

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 通过对‘红阳’猕猴桃基因组鉴定得到277个MYB家族成员并将其分为12个亚家族(S1~S12),其中多数序列属于R2R3-MYB,其次是MYB相关蛋白,仅鉴定到1个4R-MYB。S11和S12亚家族在进化上处于较早的位置,结构较为多样化,而S1和S2在进化上出现较晚。顺式作用元件分析显示,该家族主要含水杨酸、赤霉素和茉莉酸甲酯等相关植物激素元件,还有部分参与昼夜节律、低温、细胞周期等相关元件。密码子偏好性分析显示,猕猴桃MYB家族有3个高频密码子(UUG、AGA和AGG),基因的密码子偏好使用A/T,第3位碱基偏好更强。通过顺式作用元件分析和4个猕猴桃品种越冬期转录组数据分析筛选了9个可能参与低温胁迫响应MYB基因,对其在低温胁迫下的软枣猕猴桃‘龙成2号’中进行检测验证,确认这些基因参与猕猴桃对低温的响应。

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