科研产出
基于SSR标记的石榴品种遗传多样性分析和指纹图谱构建
《山东农业科学 》 2023 北大核心
摘要：为明确国内主产区不同主栽石榴品种的遗传多样性,构建DNA指纹图谱,本研究以 30 个石榴品种为试材,利用琼脂糖凝胶电泳和毛细管电泳筛选多态性引物,建立了石榴品种SSR分子标记鉴定体系,然后利用样品信息与指纹代码配置组合的串联代码,构建了不同石榴品种的DNA指纹图谱.结果表明,从 36 对引物中筛选出扩增产物条带清晰稳定、多态性高的引物 10 对,共检测出 48 个等位基因,平均为4.8个,观察杂合度和期望杂合度平均分别为 0.50 和 0.60,Shannon's 指数和Nei's多样性指数平均分别为 1.11 和 0.59,多态信息含量在 0.33~0.72 之间,平均为 0.53.聚类分析发现,30 个品种被分为 3 组,A组包括 16 个品种,B组包括 8 个品种,C组包括 6 个品种.基于样品、引物和等位基因信息,构建了 30 个品种的特异指纹代码及指纹图谱二维码.本研究结果可为石榴种质资源分子鉴定及开发利用提供理论依据.
关键词： 石榴品种 SSR分子标记 遗传多样性 DNA指纹图谱
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两株坦布苏病毒的分离鉴定及全基因组序列分析
《中国动物传染病学报 》 2023 北大核心
摘要：2019年，从山东某地疑似坦布苏病毒（TMUV）感染的发病鸭和发病鹅组织病料中进行病毒分离，并通过RT-PCR、间接免疫荧光试验以及基因序列分析，确定分离到1株鸭源和1株鹅源TMUV，并命名为BZ0162和WS12101。将分离株全基因组进行PCR分段扩增、测序，发现BZ0162和WS12101基因组全长包含10 991个核苷酸。全基因组核苷酸同源性比较结果显示，BZ0162和WS12101之间同源性是99.5%，与其他TMUV参考毒株同源性均大于95.7%。E蛋白核苷酸和氨基酸同源性分别大于95.2%和98.0%。遗传进化分析结果显示，BZ0162和WS12101与GenBank最新公布的CHN-JL中国株以及泰国株DK/TH/CU-1亲缘关系最近，处于同一进化分支上。分别成功分离到1株鸭源和1株鹅源坦布苏病毒，为进一步探究坦布苏病毒遗传变异及跨宿主传播机制提供了材料。
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11个单粒花生脂肪酸近红外定量分析模型构建
《中国油料作物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：随机选取80份不同花生品种籽仁，依托德国布鲁克光谱仪器公司MPA型傅里叶变换红外光谱仪构建了单粒花生油酸、亚油酸、棕榈酸、芥酸近红外定量分析模型，并首次构建了单粒花生一烯酸、棕榈一烯酸、山嵛酸、豆蔻酸、α-亚麻酸及长链饱和脂肪酸和不饱和脂肪酸近红外定量分析模型。经OPUS 7.5软件自动优化，花生籽仁油酸、亚油酸、棕榈酸、山嵛酸、豆蔻酸、长链饱和脂肪酸和不饱和脂肪酸的最佳光谱预处理方式均为“一阶导数+矢量归一化”，维数分别为10、10、8、10、5、10、10，决定系数（R~2）分别为0.98、0.98、0.97、0.87、0.88、0.93、0.98，根均方差（RMSECV）分别为2.87%、2.18%、0.461%、0.133%、0.00416%、0.741%、0.19%；芥酸的最佳光谱预处理方式为“一阶导数+多元散射校正”，维数为9,R~2为0.92;RMSECV为0.00628%；棕榈一烯酸的最佳光谱预处理方式为“一阶导数+减去一条直线”，维数为10,R~2为0.80,RMSECV为0.00602%；花生一烯酸和α-亚麻酸的最佳光谱预处理方式均为“矢量归一化”，维数分别为8、10,R~2分别为0.88、0.77,RMSECV分别为0.0731%、0.026%。经检验各项指标真实值和模型预测值平均相对偏差在0.12%～2.50%之间。11个花生籽仁脂肪酸近红外定量分析模型预测效果较好，可用于花生遗传育种和加工中的品质快速筛选和鉴评。
关键词： 花生 近红外反射光谱技术 α-亚麻酸 油酸 亚油酸
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低聚木糖对伊拉肉兔生长性能、养分表观消化率及血清免疫和抗氧化指标的影响
《动物营养学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：本试验研究饲粮添加不同水平低聚木糖(XOS)对伊拉肉兔生长性能、养分表观消化率及血清免疫和抗氧化指标的影响,为XOS在肉兔生产中的应用提供依据.试验选取320只体重相近的42日龄伊拉商品兔,随机分为4个组,每组20个重复(公母各占1/2),每个重复4只.各组分别在基础饲粮中添加0(对照组)、50、100和200 mg/kg的XOS.试验预试期7 d,正试期28 d.结果表明:1)与对照组相比,各XOS添加组肉兔平均日增重和平均日采食量均显著提高(P<0.05);100 mg/kg XOS添加组肉兔末重显著提高(P<0.05),料重比显著降低(P<0.05).2)与对照组相比,各XOS添加组粗蛋白质和粗纤维表观消化率显著提高(P<0.05),100 mg/kg XOS添加组粗脂肪、干物质和酸性洗涤纤维表观消化率显著提高(P<0.05),200 mg/kg XOS添加组中性洗涤纤维和酸性洗涤纤维表观消化率显著提高(P<0.05).3)与对照组相比,100 mg/kg XOS添加组肉兔血清白蛋白含量显著提高(P<0.05),各XOS添加组血清免疫球蛋白G和免疫球蛋白M含量均显著提高(P<0.05).4)与对照组相比,各XOS添加组肉兔血清总抗氧化能力显著提高(P<0.05),100 mg/kg XOS添加组血清丙二醛含量显著降低(P<0.05).综上所述,饲粮添加适宜水平XOS能够提高肉兔生长性能和养分表观消化率,增强免疫和抗氧化能力,其中以100 mg/kg添加水平效果较佳.
关键词： 低聚木糖 肉兔 生长性能 养分表观消化率 免疫 抗氧化
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'鲁丽'*'红1#'苹果杂交群体全基因组KASP标记开发及验证
《中国农业科学 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】利用‘鲁丽’ב红1#’亲本及杂交后代，开发苹果叶片性状竞争性等位基因特异PCR（kompetitive allele-specific PCR,KASP）标记，为苹果光能高效利用育种提供参考。【方法】以‘鲁丽’和I型红肉苹果‘红1#’及其134个杂交后代的幼嫩叶片为材料，调查叶片性状表型（包括叶片长度、宽度、叶绿素含量、花青苷含量、光合参数和叶绿素荧光参数等）数据。采用Illumina HiSeq 2500测序平台进行全基因组重测序，通过短序列比对软件将测序序列（reads）回贴到苹果参考基因组，利用GATK软件工具包检测单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms, SNP）标记。【结果】‘鲁丽’和‘红1#’及其134个杂交后代重测序得到有效reads数分别为164 776 660、149 482 876和3 927 370 200。与苹果参考基因组比对率分别为98.77%、98.89%和97.79%。共检测到6 445 766个SNP。经过滤后获得94 208个特异性强，准确性高的SNP位点。对每个SNP进行KASP引物设计，最终开发了5 802个苹果全基因KASP标记。这些KASP标记的多态性信息含量（polymorphism information content,PIC）平均值为0.31,PIC大于0.35的占30.13%。Simpson遗传多样性指数在0.01—0.67，平均每个位点遗传多样性指数为0.53。观测杂合度平均值为0.32。KASP标记所在基因的KEGG功能聚类分析显示，“叶酸介导的一碳代谢途径”是差异基因富集最显著的途径。通过对‘鲁丽’ב红1#’杂交群体24个叶片相关性状进行表型调查，结果显示亲本‘鲁丽’和‘红1#’在叶片净光合速率、气孔导度（Gs）等性状的表型值均存在显著差异。杂交后代表型变异幅度较大，各性状分离广泛。随后对杂交群体叶片性状表型值与KASP标记基因型进行相关性分析，结合KASP标记注释，筛选得到21个与叶片大小、Gs和色素含量性状显著相关的KASP标记。【结论】利用‘鲁丽’和‘红1#’及其134个杂交后代全基因组重测序数据开发了5 802个苹果全基因组KASP标记，获得21个与叶片性状显著相关的KASP标记，为开展标记辅助苹果光能高效利用育种提供了理论参考。
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植物小分子信号肽参与非生物逆境胁迫应答的研究进展
《生物技术通报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：植物小分子信号肽(small signaling peptides,SSPs)是一类蛋白长度小于 120 个氨基酸的小肽,作为新型信号分子在植物应答非生物逆境胁迫中发挥重要的作用.植物中含有千余种SSPs,多种多样的结构特点、修饰过程与不同受体的结合发挥其特异的功能,参与植物与环境之间的互作.挖掘鉴定植物SSPs功能基因,解析它们应答非生物逆境胁迫的调控机制,对增强植物抗性、改善植物生长具有重要的理论与实践意义.植物SSPs主要包括胞外非分泌型小肽、胞内非分泌型小肽、胞外翻译后修饰分泌型小肽和胞外富含半胱氨酸分泌型小肽四大类.介绍了四类植物SSPs的结构、特征;阐述了它们以SSP配体结合LRR-RLK受体激酶完成信号转导过程,以激活下游抗性基因表达为模式的调控机制;重点综述了它们在干旱、高温、盐渍、营养等非生物逆境胁迫应答中的生物学功能及调控机制.最后讨论了植物SSPs未来研究的方向和有待解决的问题,还对SSPs类生长调节剂的开发前景进行了展望,旨在为提高植物应对环境胁迫和实现农业可持续发展提供新的思路和路径.
关键词： 植物小分子信号肽 非生物逆境 结构特征 受体激酶 作用机制 信号转导 植物抗性
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猪TRIM56敲除细胞系的构建及在增殖PRRSV疫苗毒株中的应用
《畜牧与兽医 》 2023 北大核心
摘要：利用CRISPR/Cas9 基因编辑技术构建 1 株猪TRIM56 基因敲除的PAM-KNU细胞系,并探究其在增殖猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)疫苗毒株中的应用.根据猪TRIM56 基因组外显子区域设计合成2 对特定的向导RNA引物,将引物磷酸化、退火并连接至Px459M和EZ-Guide-XH载体构建敲除质粒Px459M-sTRIM56-KO;将敲除质粒转染PAM-KNU细胞,经嘌呤霉素筛选、有限稀释法筛选获得单克隆细胞并扩大培养;通过RT-PCR、测序及Western blot筛选鉴定,最终获得了敲除细胞系sTRIM56-KO-PAM-KNU;将PRRSV R98 疫苗株感染野生型细胞及敲除细胞系,利用real-time RT-PCR、半数组织培养感染量(TCID50)以及Western blot 检测PRRSV增殖情况.结果显示,TRIM56 敲除细胞系构建成功,该敲除细胞系中sTRIM56 基因编码区第 929~2120 位 1192 个碱基缺失,未检测到sTRIM56 蛋白条带;敲除细胞系中PRRSV R98 疫苗株病毒拷贝数、病毒滴度以及N蛋白表达均显著高于对照组.本研究为猪TRIM56 抗病毒机制研究及PRRSV疫苗研发奠定了基础.
关键词： 猪TRIM56基因 基因敲除 PAM-KNU细胞 猪繁殖与呼吸综合征病毒
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气力离心组合式小麦精量排种器设计与试验
《农业机械学报 》 2023 EI 北大核心 CSCD
摘要：针对传统小麦播种以无序种流、不定量排出的方式存在脉动性高、均匀性差的问题，设计了一种气力离心组合式小麦精量排种器，采用气力充种和离心清种的方式，种子有序均匀排出。对排种器的关键参数进行设计，建立充种和排种过程的动力学模型，确定充种角和落种角的初始范围。利用气固耦合仿真分析方法DEM-CFD进行排种器单因素试验，仿真结果表明，当充种角范围进一步缩小为36°～56°时，其携种性能较好；落种角范围进一步缩小为43°～63°时，其排种性能较好。在此基础上，以充种角、落种角、排种盘转速为试验因素，以漏播率、重播率、直线落种率为响应指标，进行正交旋转组合试验。试验结果表明，当充种角为47.75°、落种角为52.48°、转速为635.5 r/min时，排种器工作性能最优，此时，漏播率为2.78%、重播率为3.73%、直线落种率为93.46%,验证试验结果与优化结果基本一致。田间试验结果表明，当设置排种盘型孔内侧面充种角为47.8°、下侧面落种角为52.5°、排种盘转速在552～800 r/min范围内时，漏播率低于8.9%、重播率低于4.3%、排种合格率高于88.6%,符合小麦精量播种要求。
关键词： 小麦精量排种器 气力离心组合式 DEM-CFD 正交试验
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酶菌协同处理对微拟球藻营养功能成分及生物活性的影响
《食品工业科技 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为提高微拟球藻开发利用价值，本文开展了酶菌协同处理对微拟球藻营养功能成分及生物活性影响的研究。采用木瓜蛋白酶酶解微拟球藻，利用单因素和响应面试验获得其最佳酶解工艺，随后通过益生菌发酵酶解基质，研究发酵前后总酚、多肽和黄酮含量以及体外抗氧化和降血脂活性的变化，并对发酵后的微拟球藻酶液进行感官评价。结果表明：微拟球藻的最佳酶解工艺为：酶量5.0%、pH8.0、酶解时间4.0 h、酶解温度76℃；在此条件下酶解后发酵可有效提高产物中多肽的含量，其中混菌发酵组提高了近1.3倍，总酚含量提高了5.1%，同时总黄酮的含量降低了32.5%；酶菌协同处理显著增强了其抗氧化和胰脂肪酶抑制活性，其中混菌发酵组DPPH自由基清除率提高了1.2倍，胰脂肪酶清除率提高了59.4%。此外，发酵后感官评分显著提升。可见，酶菌协同发酵可显著提高微拟球藻多肽含量、抗氧化活性、降血脂活性及感官特性，为开发功能型发酵产品提供了参考和技术支持。
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