科研产出
花生高亲和硝酸盐转运蛋白基因家族生物信息学分析
《中国油料作物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：氮素利用效率（nitrogen utilization efficiency,NUE）是影响花生产量的重要因素之一。基于前期产量相关性状全基因组关联分析锚定到的一个候选基因，属于花生高亲和硝酸盐转运蛋白（nitrate transporter 2,NRT2）基因家族。本研究利用栽培种花生全基因组和不同组织的转录组信息，对NRT2家族成员进行了全基因组鉴定与表达模式分析。共鉴定到10个NRT2基因家族成员，染色体定位分析结果显示这些基因不均匀地分布在20条染色体上。其中，3号（AhNRT2.5c）和13号（AhNRT2.5b）染色体，6号（AhNRT2.7b）和16号（AhNRT2.7a）染色体上的基因成员存在同源关系。AhNRT2.4,AhNRT2.5a,AhNRT2.5b和AhNRT2.5c四个基因在根组织中表达量较高，表明这些NRT2基因在根系中发挥重要作用。该结果为进一步研究花生NRT2基因家族及在氮转运过程中的作用机制提供了理论依据。
关键词： 栽培种花生 高亲和硝酸转运蛋白 基因功能鉴定 表达模式分析
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利用PyBSASeq算法挖掘大豆百粒重相关位点与候选基因
《作物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：基于量化染色体区间上与目标性状相关多态性位点的富集程度这一原理开发的PyBSASeq算法,被证实更适合进行基于BSA-seq技术的复杂数量性状遗传解析.本研究采用该算法,以'滑皮豆'和'齐黄26'为亲本杂交所衍生的包含149个RILs为材料,挖掘与大豆百粒重相关位点,共获得11个与目标性状紧密关联的候选区域,分别位于1号、2号、4号、7号、9号、14号和16号染色体,其中qSW4-1、qSW9-1、qSW9-2和qSW7-1与已报道大豆百粒重QTL位置一致.候选区域共包含218个编码基因,根据基因表达特性和单倍型分析结果,最终获得2个与目标性状相关的候选基因Glyma.02G075000和Glyma.04G082500,分别参与蔗糖的运输和维生素E的生物合成.研究结果将有助于大豆百粒重遗传机制的阐释,并为基于BSA-Seq技术的数量性状研究提供参考.
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甜樱桃新品种'江南锦'
《园艺学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：‘江南锦’是从‘大紫’（♀）ב那翁’（♂）的杂交后代中选育出的樱桃新品种。果实肾形，果柄长，平均单果质量6～8 g，果形指数0.92；果皮较薄，黄底带红晕；果肉细腻、软糯、酸甜适口，可溶性固形物含量20.7%；裂果率低，畸形果少。适宜浙江气候及相似生境设施栽培，适合观光采摘。
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高度特异性小麦ATG8抗体的研制及其在细胞自噬检测中的应用
《作物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：细胞自噬是一种进化上高度保守的溶酶体/液泡降解途径,对机体适应各种生物或非生物胁迫,以及维持自身正常生长发育具有重要的意义。自噬相关蛋白8 （autophagy-related protein 8, ATG8）是检测自噬的金标准。目前由于缺乏特异性好的小麦ATG8抗体,导致小麦细胞自噬研究进展缓慢。本研究通过人工合成小麦ATG8蛋白序列上的一段18个氨基酸的多肽作为抗原去免疫兔子,成功获得了高度特异性的小麦ATG8多克隆抗体。该抗体不仅能够识别小麦根、叶及种子中的ATG8蛋白条带,而且可以在根、叶中检测到细胞自噬结构,并首次在小麦籽粒中实现了细胞自噬结构的检测。本研究研制的小麦ATG8抗体,除了能够检测到小麦中常见的ATG8a-h等8种典型类型外,还能检测到一种非典型的新的ATG8蛋白,为深入开展植物细胞自噬调控机制研究以及优异新基因挖掘提供了最佳方法学基础。
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番茄颈腐根腐病抗性鉴定技术的建立及抗性种质资源筛选
《中国农业科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]探索番茄颈腐根腐病(Fusarium crown and root rot,FCRR)苗期抗性鉴定技术,并对番茄种质资源及品种进行抗性鉴定分析,挖掘和丰富可利用的抗性资源,为培育抗颈腐根腐病番茄品种打下基础.[方法]以尖镰孢番茄颈腐根腐病专化型病原菌(Fusarium oxysporum f.sp.radicis-lycopersici,Forl)和感病栽培番茄Heinz 1706为材料,研究接种菌液浓度、接种寄主苗龄、接种后管理温度和不同接种方法对番茄颈腐根腐病人工接种鉴定效果的影响.随后通过苗期人工接种鉴定方法结合文献中已报道的与抗性基因连锁的分子标记,对100份番茄种质材料进行颈腐根腐病抗性鉴定分析.[结果]在一定范围内,番茄颈腐根腐病发病率及病情指数随着接种菌液浓度的升高而增大,接种菌液浓度为107个孢子/mL时,发病率及病情指数分别为100%和89.2,可以反映寄主真实的抗性水平;接种寄主苗龄为2—5叶期均能使植株发病,不同苗龄间病情指数无显著差异;接种后不同的管理温度对番茄颈腐根腐病的病情指数影响显著不同,其中较低的管理温度(20℃)有利于番茄颈腐根腐病的发生;使用浸根法和灌根法进行鉴定,番茄颈腐根腐病发病率和病情指数较高且效果稳定,显著优于茎注射法.对100份番茄种质材料进行分析,接种鉴定结果显示有38份材料表现抗病,这些材料可用于番茄抗颈腐根腐病育种或生产.在已报道的与Frl连锁的分子标记中,SCARFrl的准确率最低,仅为51%,C2-25的准确率为59%,而PNU-D4的准确率为83%,该标记可用于番茄抗颈腐根腐病辅助选择.[结论]建立的苗期抗性鉴定技术能客观反映供试材料的实际抗性水平,可用于番茄抗颈腐根腐病材料的鉴定筛选.
关键词： 番茄;颈腐根腐病;抗性鉴定;分子标记
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HS-SPME-GC-MS法分析3种块菌子囊果主要挥发性成分
《菌物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：本研究采用顶空-固相微萃取结合气相色谱-质谱联用技术(HS-SPME-GC-MS)比较分析了假喜马拉雅块菌Tuber pseudohimalayense、中华夏块菌T.sinoaestivum和印度块菌T.indicum子囊果主要挥发性有机化合物(volatile organic compounds,VOCs)组成与含量.结果表明,在3种块菌子囊果中共鉴定到173种VOCs,其中假喜马拉雅块菌、中华夏块菌和印度块菌子囊果中分别检测到79、63和71种挥发性成分,3种块菌子囊果中共有成分11种,其中1-辛烯-3-醇是含量最高的共有化合物(39.52%、38.98%和8.46%).利用挥发性成分对3种块菌种类进行判别分析,结果表明2-丁酮、庚醛、苯乙烯、1-辛烯-3-醇和环十四烷能100.0%地将3种块菌样品按照种类正确分类.本研究初步确定了 3种块菌子囊果VOCs组成和含量的差异,并探究了用VOCs相对含量区分3种块菌种类的可行性,为我国块菌质量评价,尤其是加工的块菌商品的鉴别提供了重要的理论依据.
关键词： 块菌 挥发性有机化合物 气相色谱质谱联用 判别分析
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钙肥对酸性红壤花生种子萌发及种子际微生物菌群结构的调控
《作物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：红壤因酸度较大且钙素匮乏,严重阻碍种子萌发和植物的形态建成,提高花生出苗、健苗率是酸性红壤花生高效栽培的有效策略之一.钙素营养和种子际土壤微生物对种子萌发均有重要的调控作用,但二者间的内在联系却知之甚少.为揭示钙素营养对花生种子际微生物菌群结构和萌发的潜在影响,以花生品种花育20号(Huayu 20,HY20)为材料,设置不施钙素和外源施钙素盆栽试验,结合菌群高通量测序对花生萌发出苗过程中的种子际微生物菌群结构进行了深度分析.结果表明:各处理种子际样本均以厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)为优势细菌门;子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)和被孢霉门(Mortierellomycota)为优势真菌门.CaO的施加,使厚壁菌门、拟杆菌门、被孢霉门的相对丰度提高,担子菌门相对丰度降低.另外,钙素营养增加了有益菌芽孢杆菌属(Bacillus)的数量.对细菌功能预测分析结果表明,施用钙素后,与有机物代谢相关的途径(氨基酸转运/代谢、碳水化合物转运等)和抗逆相关的途径(复制重组与修复等)均显著提高,这在一定程度上改善了红壤花生种子的萌发环境.对真菌营养型预测显示,钙素处理提高共生菌群数量的同时,降低了腐生菌群的数量.Redundancy analysis相关性预测分析表明,施钙后土壤细菌和真菌菌群结构与土壤理化因子钙素和pH均呈负相关性,并且土壤钙对种子际土壤微生物的多样性影响大于pH.基于上述研究,酸性红壤施用钙素营养可改善种子际微生物菌群结构,从而促进花生种子萌发.
关键词： 种子际 微生物菌群结构 花生 酸性红壤 16S rRNA测序
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小麦条锈病胁迫下光合速率与光谱指数关系研究
《光谱学与光谱分析 》 2022 EI SCI 北大核心 CSCD
摘要：为应用遥感技术进行小麦条锈病的实时监测以及大范围作物病害识别,明确条锈病胁迫下小麦光谱反射率和净光合速率与病情指数的关系,利用光谱植被指数预测小麦光合速率的变化,在2018年—2019年度冬小麦生长季节,以易感条锈病的济麦15号小麦品种为对照,以生产上播种面积较大的济麦22和鲁原502为供试品种,基于大田小区条锈病接种试验,从抽穗期到乳熟期,每隔7~10 d进行小麦旗叶光合速率、光谱反射率测定及病情指数调查.研究发现,随感病程度加重,小麦旗叶光合速率呈显著下降趋势,扬花期济麦22光合速率高于鲁原502.灌浆期可见光波段,病斑部位的光谱反射率始终高于正常部位,这是由于病斑部位叶片单位面积上叶绿素含量较低,对光吸收的少;而在反射平台区域,病斑部位的光谱反射率较正常叶低得多.利用与病害胁迫、生长状况以及产量相关较大的光化学反射指数(photochemical reflectance index,PRI)、植被衰减指数(plant senescence reflectance index,PSRI)和比值植被指数(ratio vegetation in-dex,RVI)来反映病情指数变化,结果显示,病斑部位的光化学反射指数和植被衰减指数大于正常部位,且植被衰减指数变化率较大,而比值植被指数变化率小于正常部位.小麦不同生育期,光合速率与光谱反射率的相关性不同,模拟光合速率的植被指数也不同.灌浆期,鲁原502的光合速率与光谱反射率始终呈正相关关系;在可见光范围内,对照光合速率与光谱反射率呈正相关,济麦22呈负相关;在反射率平台位置,对照光合速率与光谱反射率呈负相关,济麦22呈正相关.在小麦灌浆期,可以利用植被衰减指数进行病害程度识别及光合速率估测.该研究为利用遥感手段大面积监测小麦长势及病害发生情况提供了理论依据,也为探讨利用光谱指标无损监测的方法预测小麦条锈病发生及危害程度奠定了基础.
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三丁酸甘油酯对产肠毒素大肠杆菌K88诱发的小鼠肠道损伤的缓解作用
《动物营养学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：本试验旨在研究三丁酸甘油酯（TB）对产肠毒素大肠杆菌K88（ETEC K88）诱导的小鼠肠道损伤的缓解作用。试验1：选用（20±2） g的BALB/c小鼠50只，随机分为5组，每组10只。各组均饲喂基础饲粮，在第4天对照组腹腔注射0.5 mL无菌磷酸盐缓冲液（PBS），试验组腹腔分别注射浓度为5.5×10~8、4.9×10~7、4.0×10~6、6.5×10~5CFU/mL的ETEC K88悬液0.5 mL，连续观察3 d临床症状，统计腹泻率和死亡率，剖检、观察肠道病理变化，确定ETECK88最佳造模剂量。试验2：选择（20±2） g的BALB/c小鼠105只，随机分为7组，每组3个重复，每个重复5只。空白组、阴性对照组饲喂基础饲粮，阳性对照组饲喂添加0.16%金霉素的饲粮，试验1、2、3、4组分别饲喂添加0.05%、0.10%、0.20%、0.30%TB的饲粮。连续饲喂14 d，在第15天空白组小鼠腹腔注射0.5 mL无菌PBS，阴性对照组、阳性对照组和试验组小鼠按照试验1中确定的最佳造模剂量腹腔注射ETEC K88悬液0.5 mL，继续观察3 d，采血、剖检，检测血清中二胺氧化酶（DAO）活性与内毒素（ET）、C-反应蛋白（CRP）和分泌型免疫球蛋白A（SIgA）含量，制作空肠组织切片，观察肠道组织形态变化。结果显示：小鼠腹腔注射不同浓度ETEC K88悬液后出现不同程度的腹泻和死亡情况，根据腹泻率和死亡率，确定4.9×10~7CFU/mL为ETECK88建立小鼠腹泻模型的最佳剂量。阳性对照组和试验3、4组的平均日增重与空白对照组差异不显著（P<0.05），但显著高于阴性对照组（P>0.05）。小鼠的腹泻率表现为阴性对照组（53.33%）>试验1组（33.33%）>阳性对照组（26.67%）=试验2组（26.67%）>试验3组（20.00%）=试验4组（20.00%）>空白对照组（无腹泻发生）。肠道损伤程度：阴性对照组>试验1组>阳性对照组>试验2组>空白对照组>试验4组>试验3组。与阴性对照组相比，各试验组以及阳性对照组小鼠血清CRP、ET含量和DAO活性均有不同程度降低，以试验3组降低幅度最大，其次为试验4组。与阳性对照组相比，试验3、4组小鼠血清CRP、ET含量和DAO活性均有不同程度降低，但差异不显著（P>0.05）。与阴性对照组相比，试验3、4组小鼠血清SIgA含量分别增加了169.00%（P<0.05）、114.33%（P<0.05）。与阳性对照组相比，试验3、4组小鼠血清SIgA含量分别增加了72.81%（P<0.05）和37.69%（P<0.05）。由此得出，在小鼠基础饲粮中添加0.20%或0.30%的TB可以对抗大肠杆菌感染，缓解ETEC K88诱导的肠道损伤，且效果与添加0.16%的金霉素相当。
关键词： 三丁酸甘油酯 产肠毒素大肠杆菌 小鼠腹泻模型 肠道损伤
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H13亚型禽流感病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及其应用
《病毒学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：H13亚型禽流感病毒以往只在海鸥、鸭等水禽中被发现,2018年,我们实验室报道了蛋鸡感染H13亚型禽流感病毒的证据,表明H13亚型禽流感病毒存在从水禽中溢出感染陆禽的风险,因而有必要加强对H13亚型禽流感病毒的监测。实时荧光定量PCR由于具有特异性强、灵敏度高、检测时间短等优点,在病原监测工作中得到了广泛应用。本研究以H13亚型禽流感病毒的HA基因作为靶基因,设计了一对特异性荧光定量PCR检测引物,通过特异性试验、敏感性试验等,建立了H13亚型禽流感病毒实时荧光定量PCR检测方法,并应用建立的检测方法对海鸥粪便样品进行核酸检测。实验结果发现,该检测方法的灵敏度为1.60×10~0拷贝/μL;该检测方法对H1、H3、H5、H6、H7和H9等6个亚型的禽流感病毒无交叉反应;该检测方法的敏感性是常规PCR的10倍;海鸥粪便样品中H13亚型禽流感病毒的核酸检测阳性率为18.8%。我们建立的H13亚型禽流感病毒实时荧光定量PCR检测方法具有灵敏度高、特异性强等特点,该检测方法可用于大量临床样品的快速检测,为H13亚型禽流感病毒监测工作的顺利开展提供了技术支撑。
关键词： H13亚型禽流感病毒 荧光定量PCR 检测 HA基因
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