科研产出
荷斯坦奶牛热休克蛋白70基因3'-侧翼区遗传变异与耐热性的关系
《农业生物技术学报 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：本实验采用PCR-SSCP和测序技术对荷斯坦奶牛和鲁西黄牛两个群体共673个个体热休克蛋白70基因(HSP70)的3'-侧翼区的遗传变异,及该突变对奶牛产奶性状和耐热性状的影响进行研究。研究结果表明设计引物扩增片段大小500bp,扩增产物具有多态性。供试的72头鲁西黄牛和601头荷斯坦奶牛均发现3种基因型,为AA、AB和BB型。测序分析发现热休克蛋白70基因(HSP70)的3'-侧翼区存在1个新突变,T→C。关联分析结果表明,BB基因型荷斯坦奶牛个体,乳脂率、乳蛋白率和305d产奶量,相对于AA基因型的个体都要高;红细胞钾含量和产奶量下降率比AA类型个体要低,且达显著水平(P<0.05)。鲁西黄牛B基因基因频率为74.31%,而荷斯坦奶牛B基因基因频率却比较低,为14.89%。由于鲁西黄牛耐热性显著强于荷斯坦奶牛,且耐热性最高的BB型奶牛产奶量下降率显著低于耐热性差的AA型奶牛。等位基因B可作为选育抗热应激奶牛潜在的分子遗传标记。
关键词： 荷斯坦奶牛 热休克蛋白70基因(HSP70) 多态性 热应激
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三个牛品种MBL1基因第一内含子与第二外显子遗传多态性研究
《中国农业科技导报 》 2010
摘要：采用巢式PCR、DNA测序和CRS-PCR方法,研究中国荷斯坦牛、鲁西黄牛、渤海黑牛的MBL1基因内含子1和外显子2的单核苷酸多态性(SNPs),发现了855(G/A)、2651(G/A)和2686(T/C)3个新SNP位点。855(G/A)位于内含子1上,2651(G/A)导致Val24 Ile氨基酸的改变,2686(T/C)为同义突变。3个SNP位点在3个牛品种群体中优势等位基因相同,分别为G、G、C,其等位基因频率分别为0.87/0.58/0.57、1/0.75/0.74、1/0.76/0.63。经χ2适合性检验,荷斯坦牛在855(G/A)位点、鲁西黄牛在855(G/A)、2651(G/A)位点、渤海黑牛的所有位点达到Hardy-W e inberg平衡状态(P>0.05)。3个牛品种在855(G/A)位点均表现为低度多态;在2651(G/A)和2686(T/C)位点均表现为中度多态(0.25 全文链接
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中国荷斯坦牛CXCR1基因编码区的遗传多态性
《西北农林科技大学学报(自然科学版) 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究中国荷斯坦牛趋化因子受体1基因(Chemokine(C-X-C motif)receptor1,CXCR1)编码区的遗传多态性。【方法】采用巢式PCR、DNA测序和创造酶切位点法,对中国荷斯坦牛CXCR1基因编码区下游区域的单核苷酸多态位点(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)进行筛查,并对筛查到的SNPs进行群体遗传多态性分析。【结果】发现了819(A/G)、995(A/G)和1008(C/T)3个SNPs,其中995(A/G)和1008(C/T)为首次报道的多态位点,995(A/G)位点导致第332位的Arg突变为His。CXCR1基因819(A/G)、995(A/G)和1008(C/T)3个位点在中国荷斯坦牛群体的优势等位基因分别为G、G和C,其等位基因频率分别为0.634 0,0.733 0和0.706 4。经χ2适合性检验,荷斯坦牛在3个位点均未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05);3个位点均表现为中度多态。【结论】中国荷斯坦牛CXCR1基因编码区的遗传多态性比较丰富。
关键词： 中国荷斯坦牛 CXCR1基因 遗传多态性 优势等位基因
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中国荷斯坦牛κ-酪蛋白基因第4和第5外显子多态性与泌乳性状的关联分析
《中国农业科学 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究中国荷斯坦牛κ-酪蛋白基因第4和第5外显子多态性与泌乳性状的关联性,为培育高乳蛋白及高乳脂率奶牛提供参考依据。【方法】采用DNA测序、PCR-RFLP和CRS-PCR技术,对544头中国荷斯坦牛κ-酪蛋白基因的外显子4和5序列进行研究,通过SHEsis软件和PHASE软件进行配对连锁不平衡分析和单倍型分析。【结果】发现6个新的SNPs,包括外显子5上A12907G、G12950A、C12989T、A13028G、T12980C共5个SNP位点,证实前4个位点紧密连锁;外显子4上A10996T共1个SNP位点。单位点基因型与泌乳性状关联分析表明,A10996T突变位点的TT和AT基因型个体乳脂率显著高于AA基因型个体(P<0.05);T12980C突变位点的TC和CC基因型个体乳脂率、乳蛋白率分别极显著(P<0.01)、显著(P<0.05)高于TT基因型个体;紧密连锁的4个突变位点的DE基因型个体乳脂率极显著高于DD基因型个体(P<0.01)。与泌乳性状的关联分析表明,共构建出7种单倍型,发现16种单倍型组合;其中H6H6单倍型组合个体乳脂率最高,H1H4次之;H1H4单倍型组合个体乳蛋白率最高;H5H6单倍型组合个体乳蛋白率及乳脂率最低。【结论】H1H4单倍型组合在乳蛋白率和乳脂率方面为有利单倍型组合,可作为选择高乳蛋白高乳脂率牛群的分子标记。
关键词： 中国荷斯坦牛 κ-酪蛋白基因 多态性 泌乳性状 单倍型
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荷斯坦牛Nramp1基因遗传多态性及其与乳房炎相关性的研究
《遗传 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：利用PCR-SSCP技术检测了344头中国荷斯坦牛Nramp1基因exon 11的基因多态性,并分析了其不同基因型与乳房炎及产奶量性状的关系。结果表明:实验群体发现3种基因型AA、AB、BB,其中A等位基因为优势等位基因,等位基因频率为0.767,而B等位基因频率则为0.233。经X~2适合性检验,群体处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。测序结果显示:扩增片段分别在200 bp(C/G)和254 bp(T/G)存在碱基突变,并导致了氨基酸改变,分别为丙氨酸替换为脯氨酸(A1a356Pro)、亮氨基酸替换为蛋氨酸(Leu374Met)。通过构建最小二乘线性模型,进行Nramp1基因多态性与产奶量、体细胞评分(SCS)的相关性分析表明,AA型个体的SCS最小二乘均值显著低于BB、AB型(P<0.05),而AA型、AB个体的产奶量最小二乘均值显著高于BB型(P<0.01,P<0.05),AA基因型可作为乳房炎抗性的优良基因型。因此,可将Nramp1作为奶牛乳房炎候选基因应用于分子标记辅助选择育种。
关键词： Nramp1 遗传多态性 PCR-SSCP 乳房炎 中国荷斯坦牛
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牛α1-抗胰蛋白酶基因5′侧翼区新SNP的鉴定及其与中国荷斯坦奶牛产奶性状的相关性
《中国生物化学与分子生物学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：以中国荷斯坦奶牛(Chinese Holstein dairy cattle)为对象,以α1-抗胰蛋白酶基因(α1-AT)为候选基因,扩增5′侧翼区668 bp和999 bp的片段并进行测序.首次发现,在+3 142 bp处P1和+4 408 bp处P2分别发生C-T、T-C突变.随后采用PCR-RFLP方法对随机采自6个牛场,共计294头牛进行了检测,遗传变异和产奶性状分析结果显示:2个位点的等位基因在群体中都有分布,且处于中度多态.P1位点A和B等位基因的频率分别为50.34%和49.66%;AA、AB和BB基因型频率分别为23.81%、53.06%和23.13%;P2位点E和F等位基因的频率分别为30.61%和69.39%,EE、EF和FF基因型频率分别为11.90%、37.41%和50.68%.χ2适合性检验表明,该群体在P1位点的突变达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),在P2位点未达到平衡.基因与产奶性状关联分析表明,AB基因型个体产奶量与脂蛋比显著高于AA基因型个体(P<0.05);FF基因型个体乳蛋白率显著高于EF基因型个体(P<0.05);9种单倍型组合与乳脂率、乳蛋白率、体细胞数、产奶量及脂蛋比均存在不同程度相关性.
关键词： α1-抗胰蛋白酶基因 多态性 PCR-RFLP 产奶性状 中国荷斯坦奶牛
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牛糖基化依赖细胞黏附分子1基因(GlyCAM1)的遗传多态性分析
《农业生物技术学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：以中国荷斯坦牛、鲁西黄牛和渤海黑牛为研究材料,利用CRS-PCR、PCR-SSCP及DNA测序技术检测了糖基化依赖细胞黏附分子1基因(GlyCAM1)的遗传多态性。结果表明,在牛GlyCAM1基因外显子3的第2081(A/C)和内含子3的2417(C/T)位点存在突变,两位点在3个牛群中的等位基因频率A/B分别为0.7525/0.2475、0.6112/0.3888和0.3375/0.6625;0.9046/0.0954、0.8383/0.1617和0.7875/0.2125;经χ2适合性检验,3个牛群在内含子3的突变达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),在外显子3鲁西黄牛和渤海黑牛达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),中国荷斯坦牛的突变在此位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。
关键词： 牛 糖基化依赖细胞粘附分子1基因(GlyCAM1) 遗传多态性 CRS-PCR PCR-SSCP
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hsp70基因编码区一新SNP的发现及其多态性与热应激性状的相关性研究(英文)
《中国农业科技导报 》 2009
摘要：为了探索hsp70基因多态性与热应激性状(直肠温度和红细胞钾含量)的相关性,利用PCR-SSCP方法检测290头中国荷斯坦奶牛hsp70基因的未知SNP,并利用PCR-RFLP方法对基因进行分型,采用SBYE荧光定量PCR方法检测不同组织中hsp70mRNA表达水平。结果显示,在1524位点发现一个G/A突变,有两种基因型(AA/AB),基因频率和基因型频率分别是0.9570,0.0430和0.9137,0.0863,卡方检验该群体处于哈迪-温伯格平衡。相关性分析结果表明,AA、AB基因型的直肠温度没有显著差异,但在红细胞钾含量中有极显著差异。肝脏中hsp70mRNA表达水平显著高于其他组织。推测hsp70基因1524位点的G/A SNP与中国荷斯坦奶牛热应激有关。
关键词： 热休克蛋白70 多态性 热应激 荧光定量PCR 荷斯坦奶牛
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中国荷斯坦牛GlyCAM1基因遗传多态性的研究
《黑龙江畜牧兽医 》 2009 北大核心
摘要：以273头中国荷斯坦牛为研究对象,利用CRS-PCR、PCR-SSCP及DNA测序技术检测了GlyCAM1基因外显子3、内含子3的遗传多态性。结果表明:GlyCAM1基因分别在外显子3和内含子3的第2 081(A/C)、2 417(C/T)位存在突变,2个位点的等位基因频率A/B分别为0.752 5,0.247 5和0.904 6,0.095 4;经x2适合性检验,中国荷斯坦牛内含子3的突变达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),但其外显子3的突变未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。
关键词： 中国荷斯坦牛 糖基化依赖细胞黏附分子1 基因 遗传多态性 CRS-PCR PCR-SSCP
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大豆抗烟粉虱基因SSR分子标记的引物筛选
《湖北农业科学 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：烟粉虱是近年发展起来的灾害性农业害虫,具有危害范围广、危害程度重、防治难度大等特点。烟粉虱对大豆的危害十分严重。试验进行了多次PCR扩增,在PCR扩增的基础上比较了大豆基因组总DNA提取方法的优劣,初步探索了退火温度对PCR扩增结果的影响。研究表明,在615对大豆SSR引物中能够有效扩增的有318对,161对有多态性。这些多态性引物的获得将为大豆抗烟粉虱的分子基础研究提供参考。
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