科研产出
大白菜功能基因编码区SSRs的分布规律研究
《天津农业科学 》 2011
摘要：利用数据库中大白菜的部分基因组序列及其注释结果,对大白菜功能基因编码区分布的SSRs类型进行了分析。结果表明,编码区的SSRs以3核苷酸重复的最多,其次为6核苷酸重复的;各种基序的SSRs类型在基因编码区分布的数量有很大差异;另外编码氨基酸的三核苷酸SSRs在11944个基因编码区前100bp、中部及后100bp的分布也有较大差异。说明大白菜基因编码区的SSRs具有相位和极性,其原因在于编码氨基酸的需要。正是这种相位和极性引起大白菜基因编码区SSRs分布的不均一性。
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苹果基因邻近未知序列的PCR扩增方法
《农业生物技术学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：利用已知基因序列设计3个巢式PCR引物p14、p15和p16,然后设计3'端为常见酶切位点、5'端为随机引物序列p17的9个酶切位点引物。用p14外引物与9个酶切位点引物进行第1轮PCR扩增,其中前5个反应采用较低的退火温度,目的是将酶切位点引物的5'端序列引入到PCR产物中,其余反应则以此PCR产物为模板采用较高的正常退火温度进行,目的是为了使整个酶切位点引物能稳定地结合到最初反应形成的产物上。为提高PCR产物的特异性和产量,用p15和p16引物分别与p17引物配对进行第2轮和第3轮PCR扩增,电泳检查发现PCR产物条带后进行纯化和测序。为保证序列的正确性,利用测得的DNA序列再设计新引物f3x,将f3x与p14(或p15)配对、直接用提取的DNA为模板进行PCR扩增和测序。利用此方法成功地获得了苹果FPPS基因邻近的启动子序列528bp和5'UTR序列142bp,并已在GenBank注册(登录号FJ263960),利用Blastn发现这是GenBank中首次发表苹果(MalusdomesticaBorkh.)法尼基焦磷酸合酶基因(FPPS)启动子序列。
关键词： 苹果 基因 邻近序列 酶切位点引物 法尼基焦磷酸合酶 启动子
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中国荷斯坦牛GlyCAM1基因遗传多态性的研究
《黑龙江畜牧兽医 》 2009 北大核心
摘要：以273头中国荷斯坦牛为研究对象,利用CRS-PCR、PCR-SSCP及DNA测序技术检测了GlyCAM1基因外显子3、内含子3的遗传多态性。结果表明:GlyCAM1基因分别在外显子3和内含子3的第2 081(A/C)、2 417(C/T)位存在突变,2个位点的等位基因频率A/B分别为0.752 5,0.247 5和0.904 6,0.095 4;经x2适合性检验,中国荷斯坦牛内含子3的突变达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),但其外显子3的突变未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。
关键词： 中国荷斯坦牛 糖基化依赖细胞黏附分子1 基因 遗传多态性 CRS-PCR PCR-SSCP
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