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大白菜功能基因编码区SSRs的分布规律研究

文献类型： 中文期刊

作者： 周新成 1 ; 李利斌 1 ; 刘立锋 1 ; 李化银 1 ; 高建伟 1 ;

作者机构： 1.山东省农业科学院蔬菜研究所山东省设施蔬菜生物学重点实验室国家蔬菜改良中心山东分中心

关键词： SSRs;分布;基因;编码区;大白菜

期刊名称： 天津农业科学

ISSN： 1006-6500

年卷期： 2011 年 17 卷 06 期

页码： 1-5

摘要： 利用数据库中大白菜的部分基因组序列及其注释结果,对大白菜功能基因编码区分布的SSRs类型进行了分析。结果表明,编码区的SSRs以3核苷酸重复的最多,其次为6核苷酸重复的;各种基序的SSRs类型在基因编码区分布的数量有很大差异;另外编码氨基酸的三核苷酸SSRs在11944个基因编码区前100bp、中部及后100bp的分布也有较大差异。说明大白菜基因编码区的SSRs具有相位和极性,其原因在于编码氨基酸的需要。正是这种相位和极性引起大白菜基因编码区SSRs分布的不均一性。

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