科研产出
基于新疆乳用型褐牛遗传缺陷基因和致死单倍型检测应用效果研究
《安徽农业科学 》 2024
摘要：为了提升新疆乳用型褐牛选育水平，应用93种牛遗传缺陷基因和致死单倍型的引物组合及试剂盒，随机抽样296头乳用型新疆褐牛遗传缺陷基因(如脊髓性肌萎缩、髓鞘发育不良、蜘蛛腿综合征等)的因果突变位点(SNP、短片段的插入或缺失)及致死单倍型(BH2、BH6、BH14、OH2、OH4等)进行检测，筛选出具有单基因遗传缺陷基因的携带者及致死单倍型携带者的牛，提示BH2、BH6、BH14和脊髓髓鞘发育异常在新疆褐牛母牛群体中存在一定的比例，对携带遗传缺陷基因和致死单倍型牛只繁殖性能和疾病发病统计分析，其比较结果差异显著(P<0.05);对携带牛只采用选种、选配手段繁殖产生正常F1代(未检测出缺陷基因和致死单倍型检),分析其繁殖指标，结果表明繁殖性能有明显提升。有必要定期对携带者母牛进行筛查并合理选种选配，为新疆褐牛乳用性能选育、群体遗传改良和地方品种遗传资源的保护提供依据。
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非生物胁迫对水稻抽穗期的影响
《分子植物育种 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：水稻（Oryza sativa L.）是重要的粮食作物，其产量与粮食安全和经济发展密切相关。水稻抽穗期是一个重要的农艺性状，对水稻播种季节、产量和适宜种植地区有着极其重要的影响。水稻抽穗期的调控涉及了一系列的基因，而且这些基因彼此之间存在着复杂的相互调控关系。盐、干旱和温度等非生物胁迫严重影响水稻抽穗期，解析非生物胁迫对水稻抽穗期的影响及其分子机理，有助于抗逆水稻新品种的选育。本研究梳理了水稻抽穗期调控的分子机制，以及非生物胁迫对水稻抽穗期的影响，以期为水稻耐逆品种的选育提供理论指导。
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MC1R基因多态性与杜黑猪毛色关系研究
《山东农业科学 》 2023
摘要：黑色素皮质素受体 1(MC1R)基因是调控哺乳动物毛色的一个关键基因.为了解杜洛克和枣庄黑盖猪杂交组合(简称杜黑猪)中MC1R基因多态性与毛色表型的关系,本研究以 390 头杜黑猪F2 代个体和 18头枣庄纯种黑盖猪为研究对象,对F2 代群体进行毛色表型类型分组,利用液相芯片捕获测序技术鉴定MC1R基因中影响毛色的 10 个SNP位点的基因型.结果表明,杜黑猪F2 代群体出现了毛色分离,其中,75.13%的个体为全黑色,13.08%的个体为棕红色,其余 11.79%的个体呈现混杂色,包括黑红条纹、棕色偏黄、棕色偏白等.测定的 5 个多态SNP位点中,ED1等位基因 3 个SNP位点(rs45435031、rs45434630、rs45434629)的突变纯合型(GG、GG、TT)个体表现为黑红条纹,野生纯合型(AA、AA、CC)个体表现为棕红色,杂合基因型(GA、GA、TC)个体大部分(80.83%)表现为黑色,少部分(19.17%)为黑色红纹、棕色偏黄和棕色偏白.e等位基因 2 个SNP位点(rs45435032、rs321432333)的突变纯合基因型(AA、TT)个体全部为棕红色,野生纯合基因型(GG、CC)个体全部为黑色毛色,杂合基因型(GA、TC,AA、TC,GA、TT)大部分(80.99%)为黑色毛色,少部分个体(19.01%)毛色为黑红条纹、棕色偏黄和棕色偏白.HaploView单倍型分析表明 5 个SNP高度连锁,位于 1 个单倍型块内.本研究结果表明,杜黑猪毛色黑色对棕红色为不完全显性,利用MC1R基因的 5 个SNP标记进行毛色分子标记辅助选择可快速剔除隐性棕红色等位基因,使杜黑猪新品种的毛色迅速固定为全黑色,以加速新品种培育进程.
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16份花生品种(系)油酸含量及FAD2基因型鉴定
《花生学报 》 2022 北大核心
摘要：为研究花生油酸含量与AhFAD2基因型的关系,选用低(小于50%)、中(50%~70%)、高油酸(大于75%)含量的16个品种(系)进行分析.通过竞争性等位基因PCR(kompetitive allele spe-cific PCR,KASP)和直接测序法对AhFAD2进行分型,结果表明低油酸品种(系)的基因型均为AABB,中油酸品种(系)的基因型为aaBB,高油酸品种(系)的基因型为aabb.7个高油酸品种(系)的AhFAD2B突变为F435突变,即442位A碱基插入,而06B16的AhFAD2B突变为665位205 bp MITE转座子的插入.对16个花生品种(系)控制油酸基因型的鉴定,尤其是高油酸种质06 B16基因型的确定将为高油酸花生分子育种提供理论参考.
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豆科植物种子大小性状相关基因及其研究进展
《基因组学与应用生物学 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：豆科(Fabaceae)植物种类众多，在全世界范围内广泛分布，其中可食用豆类为人类提供了油脂、蛋白质、淀粉和维生素等营养物质，具有重要的社会和经济意义。豆科植物种子大小性状是决定其产量的重要因素，研究控制种子大小的关键基因及其分子调控机理，对豆科作物的高产、优质育种具有重要的理论意义和应用价值。近年来，随着全基因组测序和生物信息等技术的迅速发展，在种子大小调控机制方面取得了很多重要的研究进展，鉴定了一批调控种子大小的基因。本文通过对调控豆科植物种子大小的重要基因进行综述，为这些基因在育种中的应用提供参考。
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不同基因型和预处理方式对大葱离体雌核发育诱导单倍体的影响
《山东农业科学 》 2020
摘要：以大葱未开放花蕾为试材,研究不同基因型和低温、热激两种预处理方式对大葱离体雌核发育诱导单倍体效果的影响.结果表明:不同基因型大葱以鲁葱杂5号的胚状体诱导率最高,为4. 50%,再生植株数为15株;低温处理的胚状体诱导率和再生植株数整体高于热激处理,两指标分别于低温处理3 d、热激处理36 h时达到最大值,分别为7. 50%、41株和3. 50%、17株;基因型和预处理试验分别得到31、147株再生植株,其中,分别有4、18株被鉴定为单倍体,单倍体诱导率分别为12. 90%和12. 24%.
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杏基因组全新组装及杏的进化分析
《植物生理学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：杏(Prunus armeniaca)是一种风味独特、具有重要经济和营养价值的果树.选择以杏品种'美华'为试材,利用先进的Illumina、PacBio和Hi-C组合技术,分别获得Illumina数据40.92 Gb、PacBio数据32.56 Gb和Hi-C辅助组装数据36.9 Gb,组装出全新的杏基因组HiC Ver 1.0,其序列叠连群(contig)总长和半总长位置叠连群(N50)大小分别是243.35和1.81 Mb,包含未知碱基的序列叠连群(scaffold)总长和N50大小分别是243.37和30.07 Mb.组装基因组的98.0%挂载到8个假分子形式的染色体.基因组杂合率0.425%,重复序列占47.1%, GC含量37.4%,预测出23 445个蛋白质编码基因.利用12种植物共有的664个单拷贝基因家族构建系统发育树,结果表明杏和梅(P. mume)约在10.7百万年(Ma)前分歧, 5种核果类果树与2种仁果类果树的祖先约在57.2 Ma前分歧.与杏和梅的共同祖先相比,杏有198个基因家族扩张、729个基因家族收缩.与其他4种核果类果树比较,杏有327个特有基因家族(437个特有基因);与其他11种植物比较,杏有90个特有基因家族(187个特有基因).
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PARMS在水稻基因编辑后代基因分型中的应用研究
《山东农业科学 》 2019
摘要：基因编辑技术为植物基因功能研究和作物遗传改良提供了有效途径.目前基因编辑植株基因分型多采用PCR/RE法、PAGE检测法、Sanger测序法等手段,但这些方法存在操作复杂、耗时长或成本高等问题.PARMS技术(penta-primer amplification refractory mutation system,五引物扩增受阻突变体系)是最新开发出的基于荧光检测的SNP基因分型方法,具有操作简便、耗时短、成本低的优势.本研究利用PARMS技术对水稻CRISPR/Cas9基因编辑植株进行了基因分型,鉴定结果与PAGE检测和Sanger测序法一致,证明PARMS技术可用于水稻基因编辑植株后代基因分型,也为其它作物基因编辑后代基因分型技术选择提供了参考.
关键词： 水稻 基因编辑 基因分型 五引物扩增受阻突变体系(PARMS)
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