科研产出
杏基因组全新组装及杏的进化分析
《植物生理学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：杏(Prunus armeniaca)是一种风味独特、具有重要经济和营养价值的果树.选择以杏品种'美华'为试材,利用先进的Illumina、PacBio和Hi-C组合技术,分别获得Illumina数据40.92 Gb、PacBio数据32.56 Gb和Hi-C辅助组装数据36.9 Gb,组装出全新的杏基因组HiC Ver 1.0,其序列叠连群(contig)总长和半总长位置叠连群(N50)大小分别是243.35和1.81 Mb,包含未知碱基的序列叠连群(scaffold)总长和N50大小分别是243.37和30.07 Mb.组装基因组的98.0%挂载到8个假分子形式的染色体.基因组杂合率0.425%,重复序列占47.1%, GC含量37.4%,预测出23 445个蛋白质编码基因.利用12种植物共有的664个单拷贝基因家族构建系统发育树,结果表明杏和梅(P. mume)约在10.7百万年(Ma)前分歧, 5种核果类果树与2种仁果类果树的祖先约在57.2 Ma前分歧.与杏和梅的共同祖先相比,杏有198个基因家族扩张、729个基因家族收缩.与其他4种核果类果树比较,杏有327个特有基因家族(437个特有基因);与其他11种植物比较,杏有90个特有基因家族(187个特有基因).
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智利大麦染色体的荧光原位杂交分析
《山东农业科学 》 2015
摘要：为建立智利大麦染色体新的细胞遗传学标记,用多聚核苷酸探针对中国春-智利大麦双二倍体、1Hch和1HchS杂合附加系、4Hch、5Hch、6Hch和7Hch附加系进行原位杂交(FISH)分析。以Oligo-p Ta535.1和Oligo-p Sc119.2进行的双色原位杂交结果发现,前者能在1Hch~7Hch染色体上产生不同信号,而后者能在除3Hch外的6对染色体末端产生杂交信号;以(GAA)8进行的单色原位杂交在智利大麦1Hch~7Hch染色体上的杂交信号也各不相同。以上3个探针在智利大麦染色体上的杂交信号和小麦染色体信号不同,并且在染色体转移过程中未发现智利大麦多聚核苷酸序列明显删除现象。因此,可以用这3个探针进行原位杂交对小麦背景中的智利大麦染色体进行有效识别,并辅助利用智利大麦进行小麦染色体工程育种工作。
关键词： 智利大麦 附加系 染色体 荧光 原位杂交 细胞遗传标记
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用于保种的蒙山牛耳成纤维细胞的培养研究
《华北农学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：本研究首先利用组织块培养法成功分离培养了蒙山牛耳皮肤成纤维细胞,接着对培养的细胞进行了传代培养和冷冻保存及复苏检测,然后对细胞进行了形态观察和生长曲线测定,最后分别对不同汇合程度和不同保存时间细胞的核型正常率和细胞周期进行分析。结果表明,培养的细胞具有典型的成纤维细胞形态,具有正常的分裂增殖特性,没有转化倾向。在处于S期细胞数目上,60%~70%和80%~90%汇合程度组差异不显著,但显著高于90%~100%汇合程度组(P<0.05)。而在处于G0+G1期细胞数目上,60%~70%和80%~90%汇合程度组显著低于90%~100%汇合程度组(P<0.05)。冷冻保存1个月和3个月组细胞复苏率显著高于12个月组(P<0.05),但保存时间对核型正常率、处于S期细胞数目和处于G0+G1期细胞数目上差异不显著(P>0.05)。说明在本实验室条件下,可以利用体细胞培养进行蒙山牛种质资源保存,这也为稀有或濒危物种种质资源保存提供一种有效手段。
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