科研产出
MC1R基因多态性与杜黑猪毛色关系研究
《山东农业科学 》 2023
摘要:黑色素皮质素受体 1(MC1R)基因是调控哺乳动物毛色的一个关键基因.为了解杜洛克和枣庄黑盖猪杂交组合(简称杜黑猪)中MC1R基因多态性与毛色表型的关系,本研究以 390 头杜黑猪F2 代个体和 18头枣庄纯种黑盖猪为研究对象,对F2 代群体进行毛色表型类型分组,利用液相芯片捕获测序技术鉴定MC1R基因中影响毛色的 10 个SNP位点的基因型.结果表明,杜黑猪F2 代群体出现了毛色分离,其中,75.13%的个体为全黑色,13.08%的个体为棕红色,其余 11.79%的个体呈现混杂色,包括黑红条纹、棕色偏黄、棕色偏白等.测定的 5 个多态SNP位点中,ED1等位基因 3 个SNP位点(rs45435031、rs45434630、rs45434629)的突变纯合型(GG、GG、TT)个体表现为黑红条纹,野生纯合型(AA、AA、CC)个体表现为棕红色,杂合基因型(GA、GA、TC)个体大部分(80.83%)表现为黑色,少部分(19.17%)为黑色红纹、棕色偏黄和棕色偏白.e等位基因 2 个SNP位点(rs45435032、rs321432333)的突变纯合基因型(AA、TT)个体全部为棕红色,野生纯合基因型(GG、CC)个体全部为黑色毛色,杂合基因型(GA、TC,AA、TC,GA、TT)大部分(80.99%)为黑色毛色,少部分个体(19.01%)毛色为黑红条纹、棕色偏黄和棕色偏白.HaploView单倍型分析表明 5 个SNP高度连锁,位于 1 个单倍型块内.本研究结果表明,杜黑猪毛色黑色对棕红色为不完全显性,利用MC1R基因的 5 个SNP标记进行毛色分子标记辅助选择可快速剔除隐性棕红色等位基因,使杜黑猪新品种的毛色迅速固定为全黑色,以加速新品种培育进程.
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奶牛红毛基因分型及蛋白结构预测研究
《西北农林科技大学学报(自然科学版) 》 2008 北大核心 CSCD
摘要:【目的】通过对奶牛MC1R基因核苷酸序列的分析和蛋白结构的预测,探讨奶牛红白花毛色形成的分子机制。【方法】采用PCR-RFLP技术对奶牛MC1R基因进行分型,利用生物信息学方法对其蛋白结构特征进行模拟分析。【结果】共检测出与毛色表型有关的3种基因型,其中EE基因型在黑白花奶牛中占优势,ee基因型在红白花奶牛中占优势。蛋白结构预测结果显示,ee基因型个体的缺失突变使蛋白质翻译提前终止,进而引发二级结构改变,导致红白花奶牛个体的出现。【讨论】E等位基因主要与黑色毛色形成有关,e等位基因主要与红色毛色形成有关。
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