科研产出
基于干种子DNA的洋葱杂交种纯度分子标记快速鉴定
《山东农业科学 》 2023 北大核心
摘要：为了寻找一种从洋葱种子中快速提取高质量DNA的方法,并能满足大量准确鉴定洋葱杂交种纯度的要求,本研究首先对全式金PlantZol试剂盒、天根快捷型植物基因组DNA提取系统、TPS法和CTAB法提取的洋葱种子DNA质量进行比较,筛选出最佳提取方法,并对不同发芽天数的种子及提取有效DNA的种子数量进行优化筛选,然后利用SCAR分子标记对洋葱杂交种的纯度进行鉴定,进一步验证洋葱种子DNA的提取质量.结果表明,天根快捷型植物基因组DNA提取系统未能成功得到洋葱干种子基因组总DNA;CTAB法提取的基因组总DNA带型整齐一致、单一明亮,条带无拖尾和降解现象,也没有明显的RNA和蛋白污染;洋葱干种子以 1粒和发芽3d提取的DNA更加完整,纯度更高.以CTAB法提取的1粒洋葱干种子基因组总DNA为模板,对杂交种Ms位点的基因型进行SCAR标记鉴定,PCR扩增条带清晰明亮,根据条带的迁移位置可以清楚区分洋葱不同细胞核基因型之间的差异.综上,本研究确定了CTAB法为洋葱干种子基因组总DNA提取的最佳方法,1 粒洋葱干种子获得的有效DNA完全可以满足杂交种分子标记鉴定的要求,实现洋葱杂交种纯度的早期鉴定.
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大白菜杂交新组合ZF006未成熟杂交种纯度分子标记快速鉴定
《山东农业科学 》 2020
摘要：为在大白菜种子收获前提早鉴定杂交种纯度,使新组合顺利进行品种登记、新品种种子提早上市销售,本研究以新组合ZF006及其双亲为试材,对ZF006杂交种试配阶段双亲二级侧枝上近、中及远端3个部位的未成熟种子进行了离体诱导和单棵幼苗DNA提取。同时,采用20对均匀分布于大白菜基因组的InDel标记对双亲进行多态性引物的筛选,共筛选到8对双亲间有多态性的引物,选择其中4对共显性且条带清晰的InDel引物用于杂交种纯度鉴定。结果表明:双亲二级侧枝上不同部位的未成熟杂交种离体诱导萌发率有较大差异,近端和中端的种子离体诱导萌发率较高,远端的种子离体诱导萌发率较低;亲本P_1的二级侧枝近、中及远端未成熟种子的杂交率分别是87. 96%、97. 45%和94. 44%,而亲本P_2的则明显低于P_1对应部位的种子,分别是71. 53%、90. 37%和90. 00%,总体上,P_1收获的种子杂交率为92. 49%,而亲本P_2的为80. 52%,双亲混收的杂交率则为86. 54%。综上结果,单收和混收杂交种的纯度均未达到98%的国家标准,提示新组合ZF006双亲有必要在自交不亲和性方面继续加以改进。而本研究构建的未成熟大白菜杂交种纯度快速鉴定技术,对大白菜种业企业降低成本、加速资金周转以及提高经营效益具有重要的实践指导意义。
关键词： 大白菜 杂交组合 未成熟种子 纯度 分子标记 快速鉴定
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基于种特异性COI标记的花生蚜快速鉴定技术
《花生学报 》 2019 北大核心
摘要：针对花生蚜虫体型小、在田间不易准确快速识别的问题。本文采用基于线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基I(mitochondrial DNA cytochrome coxidase subunit I, mt DNA COI)基因的种特异(species-specificCOI)PCR方法,研究了其快速鉴定的分子技术。研究利用mt DNA COI基因通用型引物F-LCO-1490/R-HCO-700ME获得青岛地区花生蚜虫COI基因序列,并根据测序结果设计六对花生蚜特异引物,同时以同一花生田采集的、与花生蚜同生境节肢动物、线虫、软体动物的166个DNA样本为模板对六对引物的种特异性进行了检测。PCR结果显示,引物AC_F2/AC_R2对花生蚜基因组模板有特异扩增能力,片段长度为299bp;且该对引物在与花生蚜同生境节肢动物、线虫、软体动物样本中均未扩增出条带,显示出此种特异性引物对其他物种不具有交叉反应扩增能力,可用于花生蚜的快速检测及预测预报,同时对本地天敌对花生蚜捕食作用的检测也具有重要意义。
关键词： 花生蚜 线粒体基因 COI基因 种特异性引物 快速鉴定
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