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基于干种子DNA的洋葱杂交种纯度分子标记快速鉴定

文献类型： 中文期刊

作者： 孙亚玲 1 ; 李艳伟 1 ; 王振宝 1 ; 吴雄 1 ; 刘冰江 1 ; 杨妍妍 1 ;

作者机构： 1.山东省农业科学院蔬菜研究所/山东省设施蔬菜生物学重点实验室/国家蔬菜改良中心山东分中心/农业农村部黄淮地区蔬菜科学观测实验站

关键词： 洋葱;种子;DNA提取;纯度;快速鉴定

期刊名称： 山东农业科学

ISSN： 1001-4942

年卷期： 2023 年 55 卷 011 期

页码： 169-175

收录情况： 北大核心

摘要： 为了寻找一种从洋葱种子中快速提取高质量DNA的方法,并能满足大量准确鉴定洋葱杂交种纯度的要求,本研究首先对全式金PlantZol试剂盒、天根快捷型植物基因组DNA提取系统、TPS法和CTAB法提取的洋葱种子DNA质量进行比较,筛选出最佳提取方法,并对不同发芽天数的种子及提取有效DNA的种子数量进行优化筛选,然后利用SCAR分子标记对洋葱杂交种的纯度进行鉴定,进一步验证洋葱种子DNA的提取质量.结果表明,天根快捷型植物基因组DNA提取系统未能成功得到洋葱干种子基因组总DNA;CTAB法提取的基因组总DNA带型整齐一致、单一明亮,条带无拖尾和降解现象,也没有明显的RNA和蛋白污染;洋葱干种子以 1粒和发芽3d提取的DNA更加完整,纯度更高.以CTAB法提取的1粒洋葱干种子基因组总DNA为模板,对杂交种Ms位点的基因型进行SCAR标记鉴定,PCR扩增条带清晰明亮,根据条带的迁移位置可以清楚区分洋葱不同细胞核基因型之间的差异.综上,本研究确定了CTAB法为洋葱干种子基因组总DNA提取的最佳方法,1 粒洋葱干种子获得的有效DNA完全可以满足杂交种分子标记鉴定的要求,实现洋葱杂交种纯度的早期鉴定.

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