科研产出
聚球藻7002基因组DNA提取方法比较
《北方园艺 》 2013 北大核心
摘要：以聚球藻7002(Synechococcus sp.PCC 7002)为试材,采用高盐法、CTAB法、PVP法和石英砂法4种方法对其基因组DNA进行提取,并使用核酸测定仪检测提取到的基因组DNA的纯度和浓度,对基因组DNA进行琼脂糖凝胶电泳分析及PCR扩增检测。结果表明:4种方法均能提取到符合分子生物学要求的聚球藻7002基因组DNA,其中PVP法纯度最高,高盐法、石英砂法次之,CTAB法纯度最低;石英砂法浓度最高,PVP法、高盐法稍低,CTAB法浓度最低。4种方法提取到的基因组DNA均能扩增出理想条带。
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东方百合杂种后代试管苗叶片总DNA提取方法的选择
《分子植物育种 》 2013 CSCD
摘要：以东方百合‘Sorbonne’בFrancia’的杂种后代试管苗叶片为材料,采用CTAB-高盐法、简易CTAB法、CTAB-硅珠法和SDS-CTAB法等4种DNA提取方法,比较DNA耗时、纯度、得率、浓度和质量等指标,以期为东方百合‘Sorbonne’בFrancia’杂种群体大量杂种后代试管苗叶片总DNA的提取筛选适宜方法。结果表明,除CTAB-硅珠法未获得DNA,其余3种方法均获得条带清晰、完整性好的DNA。在耗时方面,CTAB-硅珠法<简易CTAB法 关键词：
东方百合
杂种后代
试管苗叶片
基因组DNA
提取方法
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苹果α-法尼烯合酶基因的启动子序列及同源基因
《基因组学与应用生物学 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：本文通过设计引物进行PCR扩增α-法尼烯合酶(AFS)基因的5'端区段并测序,获得510bp的‘国光’苹果AFS基因启动子和5'端非翻译区(5'UTR)序列,已在GenBank注册(登录号FJ263961)。序列分析结果表明,该序列具有典型的启动子特征,在转录起始点上游-46bp处有一个TATA盒,-93bp处有一个CAAT盒,-84bp处有一个W盒和-436bp处有一个热胁迫反应顺式作用元件GAAATTTTTT。与‘皇家嘎拉’苹果的AFS基因启动子序列(GenBank登录号AY786553.1)比对,本研究发现‘国光’苹果AFS基因启动子序列中有6个碱基(-186T,-207T,-283C,-301A,-413A和-433A)发生变异,‘皇家嘎拉’苹果AFS基因启动子序列相应位置的碱基分别为碱基缺失、-206C、-282G、-300G、-412G和-432G。重要的是,其中‘国光’苹果-413A碱基变异为G发生在一个热胁迫反应顺式作用元件GAAATTTTTT中,苹果虎皮病发生和AFS基因的转录表达是否受到这一碱基变异的影响值得进一步探讨。本研究结果还表明,在苹果AFS基因启动子和5'UTR序列中存在一个正向重复序列1(R9+IR18+R9),重复单元R9长度9bp,转录起始点位于其长度18bp的IR18区段。有趣的是,本研究新发现了一个与AFS基因启动子和5'UTR序列高度同源的450bp基因片段(GenBank注册登录号FJ469631),该同源片段缺失AFS基因中的27bp序列(R9+IR18,包含转录起始点)。据我们所知,这是果树中存在AFS基因启动子同源序列的首次报道。
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利用改进的酚-氯仿法从猪毛囊中提取基因组DNA
《遗传 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：为提高从猪毛囊组织中提取基因组DNA的效率,文章在借鉴从其他组织提取基因组DNA方法的基础上,对经典的酚-氯仿法的反应体系和步骤进行了改进。利用改进的酚-氯仿抽提法,从猪的毛囊组织中快速、高效地提取了高质量基因组DNA。利用该方法从1~6根猪毛囊中提取的基因组DNA可满足基于PCR技术的相关分子生物学实验需要。
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忍冬叶片基因组DNA的提取与分析
《山东中医药大学学报 》 2008
摘要：目的:获取高质量的忍冬基因组DNA。方法:采用改良CTAB法从忍冬叶片中提取DNA,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法、酶切检测其质量,并与常规CTAB法比较。结果:改良CTAB法所得DNA优于常规CTAB法,电泳条带清晰,完整性好,纯度高,能被完全酶切。结论:改良CTAB法适合忍冬基因组DNA的提取。
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鸭瘟病毒基因组的提取和限制性酶切分析
《中国家禽 》 2007 北大核心
摘要：利用高渗缓冲液裂解感染鸭瘟病毒的鸭胚成纤维细胞,加入核酸酶消化细胞DNA,再抽提病毒DNA的方法提取鸭瘟病毒基因组,结果证明,这种方法可以最大限度地消除细胞DNA的污染,得到纯净的病毒基因组DNA。用10种限制性内切酶对鸭瘟病毒疫苗株和分离株的基因组进行酶切分析,酶切产物电泳结果表明,SmaⅠ、SalⅠ、PstⅠ、NotⅠ、HindⅢ、EcoRⅤ和BamHⅠ7种限制酶产生酶切图谱二者几乎完全一致,EcoRⅠ和SacⅠ仅有个别条带不同,BglⅡ产生的条带迁移率差别较大,但条带数量相同。
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果树基因组DNA的提取和PCR扩增测序方法
《分子植物育种 》 2007 CSCD
摘要：为避免多年生果树组织中的多糖和酚类物质影响基因组DNA的提取质量,在CTAB提取缓冲液中加入2%PVP-40和2%β-巯基乙醇,以改进的CTAB提取方法从苹果嫩叶中提取基因组DNA。所得DNA样品D_(260nm)/D_(280nm)比值为1.98～2.05,纯度高。当用DNA样品和设计的特异引物进行PCR扩增时,其PCR产物只出现一条清晰电泳谱带,质量满足测序要求,采用DNA纯化试剂盒纯化后可直接用于测序。该方法已成功用于"国光"和"金冠"苹果的基因组DNA测序,是一个操作简便、快捷和高效的方法,非常适用于果树基因组DNA的提取和测序。
关键词： 苹果 基因组DNA DNA提取 PCR产物 DNA测序
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