科研产出
利用SSR荧光标记构建41份山东省苹果资源分子身份证
《沈阳农业大学学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：山东自古为中国苹果的栽培中心,苹果属植物资源较为丰富,种间杂交类型较多,资源分类难度大,相关研究较为滞后。本研究选取山东省果树研究所苹果资源圃保存的41份资源为试材,利用SSR荧光标记构建分子身份证,旨在探索建立应用分子技术进行资源分类鉴定的技术体系。从SSR富集文库中开发并设计59对引物,从中筛选出10对多态性良好的引物,利用SSR荧光标记毛细管电泳检测扩增条带分子量的方法对41份山东省原产的苹果属资源进行分析,获得相应的等位基因。采用个位数字和小写英文字母对不同等位基因进行编码,按照10对引物从小到大串联排序的方式构建供试样品的分子身份证。试验结果表明:10对SSR引物共检测到139个SSR等位位点,244种基因型,平均每对引物对品种扩增等位位点13.9个,基因型24.4种。利用PopGen32软件计算引物的多态性信息含量,10对引物的平均多态性信息含量为0.85。基于10对SSR引物的扩增结果,采用个位数字和小写英文字母对不同等位基因进行编码,成功构建了41份山东苹果种质资源的分子身份证,为山东省苹果资源的鉴定工作提供了重要依据。
关键词： 种质资源 苹果属 分子身份证 山东省 SSR荧光标记
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基于InDel标记的大白菜育种材料分子身份证构建
《中国蔬菜 》 2019 北大核心
摘要：以105份大白菜育种材料为试材,精选20对均匀分布于大白菜基因组、且只能检测出2个等位基因的共显性InDel标记引物进行分子标记检测,构建分子身份证。结果表明:20对引物中有16对引物在所有材料中均扩增出单一条带,另外各有2对引物在部分材料中存在缺失和加倍现象。将所有标记引物按其所处染色体编号由小(A01)到大(A10)排列,同一染色体上的标记则按照物理位置从小到大排列,按顺序对标记赋值,构建了105份大白菜材料的分子身份证。所筛选的20对引物对未知新种质的身份证构建具有通用性和兼容性,表明InDel标记技术可以作为大白菜鉴定和分子身份证构建的有效技术手段。
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利用SSR荧光标记构建山东地方梨种质资源分子身份证
《果树学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】利用SSR荧光标记构建45份山东地方梨种质资源的分子身份证。【方法】从SSR富集文库中开发并设计40对引物,从中筛选出10对多态性良好的引物,采用SSR荧光标记毛细管电泳技术检测扩增条带分子质量的方法对山东地方梨种质资源进行分析,获得相应的扩增条带。采用个位数字和小写英文字母对不同带型进行编码,按照10对引物扩增带型数由少到多顺序串联排序的方式构建供试样品的分子身份证。【结果】10对SSR引物共检测到111个SSR等位位点和189个带型,平均每对引物对品种扩增的等位位点11.1个,带型18.9个。采用个位数字和小写英文字母结合对不同带型进行编码,成功构建了45份山东地方梨种质资源的分子身份证,可以将材料完全区分开。【结论】构建了45份山东地方梨种质资源分子身份证,有利于山东地方梨种质资源的保护与利用。
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利用荧光SSR标记构建杏新品系的分子身份证
《北方园艺 》 2018 北大核心
摘要：以15份杏种质(包括4个新品系)为试材,采用6个荧光SSR标记进行PCR试验,构建了4个杏新品系的分子身份证,以期为利用分子鉴定技术对4个杏新品系进行品种权保护提供参考依据。结果表明:利用6个标记共检测到47个等位基因,57个带型,平均每个标记获得9.8个带型;利用其中5个标记构建10位数的分子身份证,‘开园’‘春华’‘英华’和‘美华’4个新品系的分子身份证分别是2578231744、5878341744、277a231344和6768174612,既互不相同,也与其它种质的分子身份证不同。这些结果为4个杏新品系利用分子鉴定进行品种权保护提供了依据。
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基于ISSR标记的16个核桃品种遗传多样性分析及分子身份构建
《核农学报 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：为了分析16个核桃栽培品种的遗传关系和构建分子身份证,以核桃幼叶为材料提取其基因组DNA,利用ISSR分子标记方法,从28条引物中筛选出10条引物对16个核桃栽培品种进行标记分析。结果表明,10条ISSR引物共扩增出115个位点,每条引物可获得9~15条DNA片段,平均为11.5条,其中多样性位点99个,多态性百分比达86.09%,16个核桃品种之间的平均有效等位基因数(Ne)为1.5080,Nei's基因多样性指数(H)为0.3041,Shannon信息指数(I)为0.4577,遗传相似系数(GS)变幅为0.42~0.82。采用UPGMA方法构建的聚类图表明,16个核桃品种可以划分为4个组,品种间遗传信息差异比较大,具有丰富的遗传多样性,能够通过ISSR标记方法将16个品种区分开。此外从10条引物中筛选出3条引物作为16份核桃品种资源种质鉴定的核心引物,构建了每个核桃品种的分子身份证。本研究通过构建16个核桃品种的分子身份,为核桃品种鉴定和品种权保护提供了依据,也为核桃育种亲本的选配和种质资源鉴定奠定了基础。
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