科研产出
ICARDA引进-小麦苗期抗旱性的全基因组关联分析
《中国农业科学 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【目的】干旱是限制小麦生产最主要的逆境因子之一。挖掘、鉴定优异抗旱新种质、克隆抗旱新基因，以期丰富我国小麦抗旱遗传基础，为小麦抗旱遗传改良提供材料。【方法】以198份从国际干旱地区农业研究中心（ICARDA）引进的抗旱种质为材料，采用PEG-6000模拟干旱方法，通过调查苗期干旱和正常条件下的地上部鲜重、地下部鲜重、生物量和根冠比4个性状，鉴定、评价其抗旱性，结合660K SNP芯片对其抗旱性进行全基因组关联分析，发掘抗旱性相关染色体区间及关联位点，结合干旱胁迫下根等多组织的表达量数据，筛选抗旱性相关基因，最后以强抗旱性品系IR214和干旱敏感品系IR36为材料，利用qRT-PCR方法对候选基因进行验证，并分析关键候选基因的优异单倍型。【结果】干旱胁迫下，小麦的生长发育受到显著抑制，各性状表型均显著低于正常对照，不同小麦品系间也表现出显著差异，4个性状在2种处理下均呈现正态分布，变异系数为0.363—0.760，多样性指数为0.310—0.400；基于加权隶属函数值（D值）综合评价各个品种的抗旱性，发现品系IR214的D值最大，为0.851，其次为IR92、IR213、IR235和IR218等，它们可作为新的优异抗旱种质；在此基础上，通过全基因组关联分析（genome-wide association study,GWAS），共检测到102个与4个性状抗旱系数显著关联的SNP位点，表型变异解释率范围为1.07%—38.70%，其中，与地上部鲜重相关的位点60个、地下部鲜重相关位点1个、生物量相关位点36个以及根冠比相关位点5个；基于基因组注释信息，筛选到31个抗旱相关基因，结合根等不同组织的RNA-seq数据，筛选出4个抗旱候选基因，对差异表达的候选基因进行qRT-PCR验证，鉴定到2个关键抗旱候选基因；最后，分析候选基因的单倍型效应，发现TraesCS6A02G048600的AX-86174509位点，2种基因型在抗旱性状上具有显著差异，是潜在的功能位点。【结论】共检测到102个与苗期抗旱性显著关联的位点，筛选出TraesCS5B02G053500和TraesCS6A02G048600 2个关键候选基因，TraesCS6A02G048600的AX-86174509位点是潜在的抗旱性功能位点。
关键词： 小麦 干旱胁迫 660K SNP芯片 全基因组关联分析 候选基因
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玉米耐旱相关性状Meta-QTL及候选基因表达分析
《延边大学农学学报 》 2022
摘要：该研究借助高密度分子标记遗传图谱IBM 22008 Neighbors,在正常水分条件下搜集并整合了来自17个不同作图群体的211个玉米耐旱性状相关QTL.通过元分析方法获得39个与玉米耐旱相关的"一致性"QTL(Meta-QTL).经与水稻已克隆的耐旱相关基因进行同源对比,在MQTL区段内找到6个玉米耐旱候选基因,分别为Zm00001d038453、Zm00001d034601、Zm00001d023294、Zm00001d037112、Zm00001d019230和Zm00001d045384.
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大白菜抗根肿病分子标记研究进展
《山东农业科学 》 2022 北大核心
摘要：根肿病是由芸薹根肿菌侵染大白菜以及其它十字花科作物根部而引起的一种土传病害.该病害随着农业机械跨区域作业的实施等逐年加重,造成严重的经济损失,严重威胁十字花科作物的安全生产.开发与抗根肿病紧密连锁的分子标记、利用标记辅助选择培育高效抗根肿病大白菜新品种是应对根肿病危害的重要手段.多年来,大白菜抗根肿病QTL定位和分子标记开发取得重要进展,已经定位23个抗病位点,开发60多个连锁标记,尤其大白菜参考基因组序列的发布,大大促进了抗根肿病功能基因的鉴定,目前已经克隆鉴定了3个功能基因.本文对抗根肿病位点的特点、紧密连锁分子标记在最新版大白菜参考基因组中的物理位置、候选基因图位克隆情况以及潜在候选基因筛选等方面的进展进行综述,讨论了抗病育种存在的难题,并对下一步抗病研究重点提出了建议,以期为利用分子标记辅助选择创制大白菜持久抗根肿病新种质提供参考.
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绵羊多羔性状候选基因的研究进展
《草食家畜 》 2017
摘要：产羔数与绵羊养殖业的经济效益密切相关。对影响绵羊繁殖力的候选基因进行研究,可为我国绵羊高繁品种(系)的分子选育提供有益参考,大大加快高繁殖力绵羊品种(系)的繁育进程,对我国养羊业的发展具有十分重要的意义。为了补充完善和深化我们对产羔性状的认识,本文从遗传突变、基因表达水平和拷贝数差异方面综述了近年来国内外有关绵羊多羔性状候选基因的研究和进展情况,并对其应用前景进行展望,说明多羔性状候选基因在提高和稳定绵羊繁殖性能上的重要性。
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褐变相关基因原核表达产物对马铃薯块茎汁液褐化的影响
《哈尔滨地图出版社 》 2015 CSCD
摘要：马铃薯以其优质的蛋白质、丰富的维生素和微量元素作为鲜切蔬菜深受消费者欢迎,但是马铃薯在加工过程中易发生酶促褐变,使外观品质和营养价值大为降低。褐变是导致鲜切马铃薯品质下降并限制其货架期的主要因素~([1,2])。鲜切马铃薯褐变的机理仍不清楚,大多集中在对酶促反应过程中多酚类物质和多酚氧化酶特性的研究上,且存有较大的争论~([3-5])。本实验室在前期对马铃薯褐变前后的基因表达谱研究中,发现了表达差异特别大
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