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不同禽源副粘病毒分离株F基因的克隆与序列分析

文献类型: 会议论文

第一作者:

作者: 王旋 1 ;

作者机构: 1.王旋@家禽疫病防控监测安徽省重点实验室,凤阳 安徽 233100--黄兵@山东省农业科学院家禽研究所,济南 山东 250023--张训海@家禽疫病防控监测安徽省重点实验室,凤阳 安徽 233100--于可响@山东省农业科学院家禽研究所,济南 山东 250023--钟登科@家禽疫病防控监测安徽省重点实验室,凤阳 安徽 233100--宋敏训@山东省农业科学院家禽研究所,济南 山东 250023-- 龚争@家禽疫病防控监测安徽省重点实验室,凤阳 安徽 233100--赵磊@家禽疫病防控监测安徽省重点实验室,凤阳 安徽 233100--

关键词: 禽副粘病毒;F基因;基因克隆;序列分析;发育进化树;酶切位点

会议名称: 中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第十三次学术研讨会

主办单位: 中国畜牧兽医学会

页码: 1042-1046

摘要: 分别对鸡源、鸭源、鹅源NDV强毒分离株(WFooC、WFooD、WFooG)的F基因进行RT-PCR扩增、克隆和序列测定,对其核苷酸和推导氨基酸序列的分析结果表明,各分离株F基因均含1个完整的开放阅读框(ORF),全长为1662bp,编码553个氨基酸,有6个潜在的糖基化位点,裂解位点区的氨基酸序列均为112R-R-Q-K-R-F117,与强毒株特征相符,具有第101位的K(赖氨酸)和121位的V(缬氨酸),符合基因Ⅶ型NDV特征;WFooC株有134个半胱氨酸(Cys)残基,WFooD株和WFooG株各有12个Cys残基:在限制性内切酶(RE)位点(nt334-1682)的分布上,三个毒株均存在多数鹅源分离株特有的973nt和1249nt Rsa Ⅰ位点;WFooD株与WFooC株、WFooG株以及GenBank下载的15株各基因型代表株的F基因编码区同源性进行比较,其核苷酸序列同源率为84.7~99.3%,推导的氨基酸序列同源率为88.4~98.9%;三个分离株间的同源性较高,其与ZJ1、SF02和NA_1等鹅源毒株之间差异较小,而与Lasota、F48E9等毒株之间差异明显。根据NDV系统发育进化树、酶切位点分析以及基因分型结果,证明它们的基因型均为Ⅶd亚型。

分类号: S858.3`S852.659.5

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