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不同禽源副黏病毒分离株F基因的克隆与序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王旋 1 ; 黄兵 2 ; 张训海 1 ; 于可响 2 ; 钟登科 1 ; 宋敏训 2 ; 龚争 1 ; 赵磊 1 ;

作者机构: 1.家禽疫病防控监测安徽省重点实验室

2.山东省农业科学院

关键词: 禽副黏病毒;新城疫病毒;F基因;克隆;序列分析

期刊名称: 中国兽医学报

ISSN: 1005-4545

年卷期: 2010 年 30 卷 08 期

页码: 1043-1048

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 分别对鸡源、鸭源、鹅源新城疫病毒(NDV)强毒分离株(WF00C、WF00D、WF00G)的F基因进行RT-PCR扩增、克隆和序列测定,并对其核苷酸和推导氨基酸序列进行分析。结果表明,各分离株F基因均含1个完整的开放阅读框(ORF),全长为1 662 bp,编码553个氨基酸,有6个潜在的糖基化位点,裂解位点区的氨基酸序列均为112R-R-Q-K-R-F117,与强毒株特征相符,具有第101位的K(赖氨酸)和121位的V(缬氨酸),符合基因Ⅶ型NDV特征;WF00C株有13个半胱氨酸(Cys)残基,WF00D株和WF00G株各有12个Cys残基;在限制性内切酶(RE)位点(nt334~1 682)的分布上,3个毒株均存在多数鹅源分离株特有的973 nt和1 249 nt RsaⅠ位点;WF00D株与WF00C株、WF00G株以及GenBank的15株各基因型代表株的F基因编码区同源性进行比较,其核苷酸序列同源性为84.7%~99.3%,推导的氨基酸序列同源性为88.4%~98.9%;3个分离株间的同源性较高,其与ZJ1、SF02和NA_1等鹅源毒株之间差异较小,而与LaSota、F48E9等毒株之间差异明显。根据NDV系统发育进化树、酶切位点分析以及基因分型结果,证明它们的基因型均为Ⅶd亚型。

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