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苹果生长素响应因子(ARF)基因家族全基因组鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李慧峰 1 ; 冉昆 1 ; 何平 1 ; 王海波 1 ; 常源升 1 ; 孙清荣 1 ; 程来亮 1 ; 李林光 1 ;

作者机构： 1.山东省果树研究所

关键词： 苹果;生长素响应因子;基因组学;表达分析

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2015 年 07 期

页码： 1045-1054

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 生长素响应因子(auxin response factor,ARF)基因在调控生长素响应基因和生长素信号转导途径以及其它多个生长发育过程具有重要作用。本研究利用Blast P程序比对并获得苹果ARF基因家族,通过DNAMAN 6.0、MEGA 5.0、Web Logo3、Map Inspect和MEME软件对苹果ARF基因进行分析,采用RT-PCR技术研究基因组织表达情况。结果表明,苹果基因组存在29个ARF基因,进化上可分为I、II、III、IV和V组,每组成员数目分别是4、5、10、6和4个。内含子和外显子结构分析表明,该基因家族由2~15个外显子构成。染色体分布结果显示,Md ARF基因在染色体上分布不均匀。分别鉴定出4对和2对Md ARF基因经历了串联复制和片段复制,14个Md ARF基因经历了全基因组复制。保守元件分析表明,苹果ARF基因家族DBD区域、ARF区域、III元件和IV元件结构高度保守。半定量结果表明,大多数Md ARF基因在根、茎、叶、花和果中均有表达。

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