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猪传染性胃肠炎病毒N蛋白的二级结构和B细胞抗原表位的预*测

文献类型: 中文期刊

作者: 姜宁朋 1 ; 孙健全 2 ; 黄庆华 2 ; 王可 2 ;

作者机构: 1.山东省农业科学院高新技术研究中心

2.山东省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词: 猪传染性胃肠炎病毒;二级结构;B细胞抗原表位

期刊名称: 家畜生态学报

ISSN: 1673-1182

年卷期: 2009 年 30 卷 05 期

页码: 23-27

摘要: 以TGEV基因组序列为基础,运用Garnier-Robson、Chou-fasman和Karplus-Schulz方法预测猪传染性胃肠炎病毒N蛋白的二级结构。运用Kyte-Doolitte方法对N蛋白的疏水性进行了分析,Jameson-Wolf方法预测了结构蛋白的抗原指数,Emini方法预测了N蛋白的表面可能性,最后结合吴玉章的方法综合分析预测B细胞抗原表位。结果显示柔性区域主要集中在N-端第11~31、52~65、128~147、155~188、210~227、313~319、331~347区段,α-螺旋和β-折叠数量少且分散。N蛋白可能的B细胞抗原位点是N-端12~31,154~191,204~243,309~320,329~354区段,而这些区段内部或附近都有柔性区域存在,可作为N蛋白的抗原优势表位。本研究为TGEV抗原优势表位的试验研究和反向疫苗的研制奠定了基础。

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